耐藥細(xì)菌的不斷出現(xiàn)與傳播,使得感染性疾病的臨床治療面臨巨大挑戰(zhàn),研制新型抗耐藥菌的藥物迫在眉睫。傳統(tǒng)的從土壤放線菌中發(fā)現(xiàn)新結(jié)構(gòu)抗生素的幾率日趨下降,而海洋微生物中一系列結(jié)構(gòu)新穎的先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn),使海洋放線菌引起了廣泛的關(guān)注�；蚪M測序技術(shù)的進(jìn)步使得從基因水平上預(yù)測微生物次級代謝產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)成為可能。因此,基于基因組序列分析、發(fā)現(xiàn)海洋放線菌中新活性天然產(chǎn)物成為近年的研究熱點。本研究是以基因組分析為導(dǎo)向,預(yù)測一株海洋來源的放線菌—鏈霉菌（Streptomyces sp.）IMB3-202的次級代謝產(chǎn)物,并對其進(jìn)行分離、純化和結(jié)構(gòu)鑒定,以期獲得新型的抗耐藥菌活性化合物。利用AntiSMASH3.0對菌株基因組進(jìn)行生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)其基因組中,存在一條與吲哚咔唑類化合物生物合成基因相似的基因簇,提示該菌株具有產(chǎn)生吲哚咔唑化合物的潛能;對菌株IMB3-202的發(fā)酵培養(yǎng)基和發(fā)酵條件進(jìn)行優(yōu)化,確定了其最佳培養(yǎng)條件;采用多種色譜方法對發(fā)酵產(chǎn)物進(jìn)行系統(tǒng)的分離純化,從中分離純化得到4個吲哚咔唑類化合物（1～4）;利用UV、IR、MS、1D和2DNMR等波譜方法進(jìn)行結(jié)構(gòu)鑒定,其結(jié)構(gòu)分別確定為星形孢菌素（1... 

【文章來源】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】：94 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１從海洋微生物中發(fā)現(xiàn)的先導(dǎo)化合物??ＦｉｇｕｒｅｌＬｅａｄ?ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ?ｆｒｏｍ?ｍａｒｉｎｅ?ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ??近年來，基因測序技術(shù)的發(fā)展使得通過基因組測序分析和發(fā)現(xiàn)微??

??圖２－１部分海洋放線菌粗提物的活性結(jié)果??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ａｎｔｉｂａｃｔｅｒｉａｌ?ａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ?ｏｆ?ｃｕｌｔｕｒｅ?ｅｘｔｒａｃｔｓ?ｆｒｏｍ??ｍａｒｉｎｅ－ｄｅｒｉｖｅｄａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｓ??ｃ．?ｖｎｍｏ??ｗ?＇????＇＜?？＜－．?ｒ?－?＊?ｔ?＞??Ｉ］?Ｉ?１??？?ＪＬ?．?Ｊｉ??：—二４〔，冬?—，?４－?＿７??ＪＬ」ＷＪＬ?」ｍｂ６??ｍ?ＪＵ?Ａ?ＩＭＢ

ＢＬＡＳＴ比對，從得到了?８個菌株的１６ＳｒＲＮＡ基因序列作為對比菌株，用??ＣＬＵＳＴＡＬＸ軟件進(jìn)行多序列比對，根據(jù)比對結(jié)果用ＭＥＧＡ５．０軟件通過鄰接法進(jìn)??行聚類分析，構(gòu)建目標(biāo)菌株與對比菌株之間的系統(tǒng)進(jìn)化樹（圖２－３）。??￣?＂——?—ｃｈｍｍｏｆｉｔｓａｉＳ?ＮＢＲＣ?？＾ａ５？｛Ａ８１８４Ｔ９４）??托?Ｌ、．＇—．．—一?５加敝》？摩油鄉(xiāng)ｔ／?Ｃ象？耶！歟浚罰保?釩歟崳?ｆＳＰ?５５ｌ？（＾ＡＪ３９�。停浚ぃ�??——一—?—一．一??１Ｌ〇?匕?細(xì)ｃｅｗｓ?５５７ｒ（ＡＪ３＇９９４８４）??卿一：節(jié)，觀順．＾ｒｅｐｌａｍｙｃｔｆｓ?ＮＢｆ＾Ｃ?ｆ３４．５＾ＡＥ１＃４４９１）ｉ??１Ｍ０￥ｉＡＪ？￥１７￥４）??？．．．．，；：一讀．＾Ｔ＾ｐｆｏｍｙｃ：＾?ｔ５４ｊ＞＾＇ＡＢ＊Ｂ４６５ｉ）??鍵?ｒ?Ｓｆｉ＊＊？ｐｆｏｍｙＧ？￥?ＮＢＲＣ?．＊？４３９（ＡＢ１Ｓ４？７６）??１２０＾?Ｓｉｒｅｆｉｔａｍｙｃｍ?￥ｇＪＭＢ．１２Ｑ２ｉ）ｍ４＆？Ｕ＆）??Ｉ￣￣Ｉ??ａ朋??圖２－３海洋放線菌ＩＭＢ３－２０２的１６Ｓ?ｒＲＮＡ系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹??Ｆｉｇｕｒｅ?２－３?１６Ｓ?ｒＲＮＡ?ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ｔｒｅｅ?ｏｆ?Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ?ｓｐ．?ＩＭＢ３－２０２??汾ｒｅ／＾ｏ／＾ｙｃａ?ｓｐ．?ＩＭＢ３－２０２的１６ＳｒＲＮＡ基因序列進(jìn)ＢＬＡＳＴ比對分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]吲哚咔唑類化合物及其衍生物的抗腫瘤活性[J]. 陳蘇婷,尤啟冬.  化學(xué)進(jìn)展. 2008(Z1)
[2]一種簡單、有效的適于PCR操作的放線菌DNA提取方法[J]. 姜淑梅,張龍,戴世鯤,李翔.  生物技術(shù). 2007(01)



本文編號：2901594