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靶向金黃色色素合成蛋白CrtN的苯并六元含氧脂肪環(huán)類抗MRSA候選藥物:設(shè)計(jì)、合成和藥理學(xué)評(píng)價(jià)

發(fā)布時(shí)間:2020-10-31 21:22
   金黃色葡萄球菌是一種致病力及致死率都很高的革蘭氏陽性菌,它能在抗生素環(huán)境下快速突變?yōu)槟退幗瘘S色葡萄球菌(methicillin-resistantS.aureus,MRSA),近年來幾乎所有上市抗生素都出現(xiàn)了相應(yīng)的MRSA菌。為了緩解抗生素耐藥造成的公眾健康危機(jī),開發(fā)一類有別于傳統(tǒng)抗生素的新型治療策略尤其迫切。細(xì)菌在生長和繁殖過程中會(huì)分泌出各種毒力因子,這些毒力因子不僅能隨宿主環(huán)境變化進(jìn)行自適性調(diào)節(jié),為細(xì)菌營造出更適宜的生長環(huán)境,而且能夠幫助細(xì)菌躲避宿主的免疫殺傷,更重要的是毒力因子不直接影響細(xì)菌的生長和繁殖。因此以毒力因子為靶點(diǎn)的新型抗細(xì)菌感染治療策略,能夠在“不殺菌”的前提下降低細(xì)菌對(duì)人體的傷害,并有效避免細(xì)菌的耐藥性突變。金黃色色素是金黃色葡萄球菌體內(nèi)特有的毒力因子,不僅能夠幫助細(xì)菌抵御人體的免疫殺傷(ROS殺傷機(jī)制),還會(huì)加速人體器官和組織的壞死,因此通過阻斷金黃色色素的合成和產(chǎn)生,能高效專一的治療MRSA引起的感染和損傷。金黃色色素的合成通路受操縱子crtOPQMN調(diào)控,CrtN是其中最重要的色素合成通路之一。在課題組之前的研究中,我們通過自建“老藥庫”發(fā)現(xiàn)了已上市抗真菌藥物鹽酸萘替芬,能通過靶向CrtN來阻斷金黃色色素的合成。我們以鹽酸萘替芬為先導(dǎo)化合物,將其結(jié)構(gòu)中的萘環(huán)替換成苯并脂肪環(huán),發(fā)展了第一代靶向CrtN的苯并脂肪環(huán)類色素抑制劑,特別是候選藥物44表現(xiàn)出了極佳的體內(nèi)外藥效。但是在隨后的研究中,我們發(fā)現(xiàn)候選藥物44存在水溶性差,心臟hERG毒性強(qiáng)等成藥性缺陷。因此,本論文工作的主要目標(biāo)就是發(fā)現(xiàn)一類具有良好體內(nèi)外活性,同時(shí)能夠克服第一代色素抑制劑缺陷的新型藥物小分子。我們首先以同是苯并脂肪環(huán)衍生物的46為先導(dǎo)化合物,分析了化合物水溶性差的主要根源在于結(jié)構(gòu)中存在疏水性苯并脂肪環(huán),并驗(yàn)證性在46的結(jié)構(gòu)中插入了一個(gè)親水性氧原子,合成了具有苯并二氫吡喃新骨架衍生物60。60不僅保持了較好的色素抑制活性(IC50 = 4.6±0.2nM),同時(shí)水溶性比46提高了20多倍(13.2 mg/mL)。隨后以苯并二氫吡喃為母核結(jié)構(gòu),在新化合物60的其他結(jié)構(gòu)區(qū)域進(jìn)行優(yōu)化和改造,在保持其色素抑制活性和水溶性的基礎(chǔ)上,改善心臟hERG毒性。在先導(dǎo)化合物46的烯丙基碳端位(A區(qū)域)引入環(huán)烷基、取代芳基及雜芳基等,設(shè)計(jì)合成了38個(gè)新衍生物(47-84),并考察它們對(duì)S.aureusNewman的色素抑制能力。測試結(jié)果不僅清晰的展示了化合物結(jié)構(gòu)與抑制活性之間的關(guān)系,而且發(fā)現(xiàn)了 9個(gè)化合物的色素抑制活性達(dá)到了個(gè)位數(shù)納摩爾級(jí)別,通過構(gòu)效關(guān)系結(jié)果對(duì)化合物進(jìn)行初步篩選后,4-二苯基取代基片段的化合物67表現(xiàn)出了最強(qiáng)的色素抑制活性(IC50 = 3.8±0.1nM)。隨后將烯烴端位碳取代固定為對(duì)二苯基取代片段,開展了氮上(R)和鏈上取代變化(Linker)的考察。對(duì)這兩部分的考察共合成了 10個(gè)化合物(85-94),根據(jù)色素抑制結(jié)果可知,氮上甲基被替換成氫原子、乙基或異丙基后(85-87),色素抑制活性喪失,鏈上雙鍵被替換或剔除(89-93)也會(huì)喪失色素抑制活性,而引入共軛多烯基團(tuán)后,色素抑制活性反而有所上升。色素抑制活性較好的衍生物53、56、57、58、59、60、63、66、67、81、88、94被優(yōu)選進(jìn)行水溶性和心臟hERG毒性方面的篩選,化合物67和88憑借出色的色素抑制活性、較低的hERG毒性和良好的水溶性,被選中進(jìn)行隨后的藥理篩選實(shí)驗(yàn)。在CrtN酶抑制活性試驗(yàn)中,兩個(gè)化合物均表現(xiàn)出較好的酶抑制活性(IC50300nM)。在MRSA菌株色素抑制試驗(yàn)中,四組MRSA菌,USA400MW2、USA300 LAC、Mu50和NRS271菌株被用來考察化合物的色素抑制活性,結(jié)果顯示67和88均表現(xiàn)出良好的MRSA色素抑制活性,但候選藥物88在Mu50和NRS271菌株中的表現(xiàn)更佳(IC50 = 0.36±0.1 nM inMu50和IC50=0.4±0.1 nMinNRS271),我們將更有成藥潛質(zhì)的88作為候選藥物開始進(jìn)一步的考察。利用高效液相色譜法測定CrtM的催化產(chǎn)物,證明了候選藥物88確實(shí)作用在CrtN色素合成通路。隨后設(shè)置了四種不同的體外實(shí)驗(yàn),詳細(xì)考察與候選藥物88共孵育的MRSA菌在免疫清除上的變化,綜合各實(shí)驗(yàn)結(jié)果可知,候選藥物88能夠在“不殺菌”的情況下,極大的削弱了細(xì)菌的毒力和繁殖能力。鑒于第一代色素抑制體內(nèi)藥效評(píng)價(jià)中存在的缺陷,在本論文工作中,通過增加多種多重耐藥MRSA菌株為受試菌、引入萬古霉素和利奈唑胺作為陽性對(duì)照物、增加了對(duì)給藥劑量(0.1mgb.i.d.和0.4mgb.i.d.)和給藥模式(前給藥模式和正常給藥模式)的考察,全面評(píng)價(jià)了候選藥物88的體內(nèi)抗毒活性。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明候選藥物88在S.aureus Newman菌株、中度萬古霉素耐藥MRSA菌株Mu50和重度利奈唑胺耐藥MRSA菌株NRS271的小鼠感染膿腫實(shí)驗(yàn)中均表現(xiàn)出較好的治療效果,甚至小劑量給藥組表現(xiàn)出好于陽性藥組的抑菌能力(部分臟器中抑菌率達(dá)到了99%)。為了進(jìn)一步提高化合物水溶性,對(duì)88進(jìn)行了鹽型篩選,合成了 10類不同的鹽型,結(jié)果發(fā)現(xiàn)88磷酸鹽具有較好的水溶性(12.9 mg/mL)。以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果都證明候選藥物88可以作為抗毒力因子候選藥物進(jìn)行后續(xù)開發(fā)。在苯并二氫吡喃類衍生物設(shè)計(jì)中,通過在苯并脂肪環(huán)結(jié)構(gòu)中引入親水性氧原子,顯著提高了化合物的水溶性,但是比較遺憾的是,由于在結(jié)構(gòu)優(yōu)化中引入了疏水的4-二苯基和共軛雙烯,雖極大地改善了hERG毒性,但同時(shí)消泯了親水性氧原子帶來的水溶性提升。在本論文的第二部分工作中,為了進(jìn)一步改善化合物水溶性,同時(shí)拓展第二代靶向CrtN金黃色色素抑制劑的骨架類型,我們再次以46為先導(dǎo)化合物,在苯并脂肪環(huán)結(jié)構(gòu)中引入兩個(gè)氧原子,設(shè)計(jì)并合成一類新穎的,具有苯并二噁烷骨架的化合物。苯并二噁烷候選藥物的研究策略和發(fā)現(xiàn)過程與第一部分工作相同,共有46個(gè)新結(jié)構(gòu)衍生物被合成并測試了S.aureus Newman色素抑制活性,其中有11個(gè)位數(shù)納摩爾抑制活性的化合物被獲得。通過構(gòu)效關(guān)系結(jié)果篩選,活性較好的A05、A06、A37、A38(ICs03.5nM)被選取測試水溶性、心臟hERG毒性、體外酶活和其他MRSA菌色素抑制活性,候選藥物A37在其中表現(xiàn)出最好的成藥潛力,并進(jìn)行了體外“不殺菌”免疫清除實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)結(jié)果可知,A37在“不殺菌”的前提下,高效的削弱了細(xì)菌在免疫環(huán)境下的存活能力。在體內(nèi)藥效實(shí)驗(yàn)中,候選藥物A37依舊表現(xiàn)出色,實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示大部分A37給藥組顯示出了良好的體內(nèi)藥效活性,小劑量給藥組的體內(nèi)活性好于提前給藥組,甚至小劑量正常給藥組活性和兩個(gè)陽性藥組相當(dāng)。所有這些數(shù)據(jù)都表明候選藥物A37是極具潛力的抗MRSA,VISA和LRSA感染的候選藥物。本論文工作的創(chuàng)新性主要表現(xiàn)在以下3個(gè)方面:(1)在苯并脂肪環(huán)中引入親水性氧原子,形成具有苯并二氫吡喃和苯并二噁烷骨架的第二代靶向CrtN金黃色葡萄球菌色素抑制劑;(2)克服了苯并脂肪環(huán)類色素抑制劑的缺陷,提升了候選藥物的水溶性和改善了心臟hERG毒性;(3)優(yōu)化了體內(nèi)藥效學(xué)評(píng)價(jià)模型,引入多重耐藥菌株作為受試菌株,同時(shí)增加萬古霉素和利奈唑胺為陽性藥對(duì)照組。
【學(xué)位單位】:華東理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R914;R96
【部分圖文】:

抗生素,耐藥,時(shí)間軸,進(jìn)化速度


讓抗生素得以在全世界廣泛使用[2()]。隨之而來的抗生素濫用,特別是在畜牧業(yè)和食品工??業(yè)中問題尤為嚴(yán)重,更加劇了“危機(jī)”的進(jìn)一步惡化[21,22]。而且更令人擔(dān)憂的是,新型抗??生素的研發(fā)進(jìn)展也越來越跟不上細(xì)菌對(duì)抗生素耐藥的進(jìn)化速度。由圖1.1可見[23],1970??

金黃色葡萄球,金黃色葡萄球菌,培養(yǎng)皿,電子顯微鏡


抗生素耐藥時(shí)間線?m'??圖1.1抗生素的研發(fā)及耐藥時(shí)間軸(軸上方為各類抗生素的研發(fā)時(shí)間,軸下方為各類抗生素耐??藥菌的出現(xiàn)時(shí)間,圖片改自參考文獻(xiàn)丨231)。??Fig.?1.1?The?timeline?of?antibiotic?deployment?(above)?and?the?antibiotic?resistance?observed??(below).??自上世紀(jì)80年代起,藥物研發(fā)成本的升高、藥物新型治療策略陷入瓶頸及藥物上市??后資金收益極度縮水,導(dǎo)致世界主要的藥物研發(fā)企業(yè)大幅縮減對(duì)新型抗菌藥物開發(fā)的投??入。特別是2000以后,上市的新抗菌藥物逐年遞減,特別是近幾年這種趨勢愈演愈烈,??2015年至2017年僅有四個(gè)上市新藥,其中更有兩個(gè)僅是聯(lián)合用藥型新藥,而在2016年更??是“顆粒無收”(表1.1)?[28’29]。截止2017年,新千年后上市的化學(xué)類抗菌藥物總計(jì)34個(gè),??全部是針對(duì)細(xì)菌本身殺傷的傳統(tǒng)廣譜性抗生素(表1.1),沒有一例以新機(jī)制新治療策略??成功上市的藥物。??表1.1?2000-2017年FDA批準(zhǔn)上市的化學(xué)類抗菌藥物匯總(表格改自參考文獻(xiàn)[28])??Table?1.1?The?summary?of?FDA?approved?chemical?antibacterial?drug?during?2000-2017??上市年份?藥物名稱?

圖片,核糖體,抗生素,耐藥機(jī)理


MLS類抗生素(macrolides-lincosamides-streptogramins)包括大環(huán)內(nèi)酯類、林可酰胺??類和鏈陽菌素類抗生素,通過阻斷核糖體中50s轉(zhuǎn)移酶,抑制細(xì)菌蛋白合成,達(dá)到阻止??細(xì)菌繁殖的目的(圖1.4)?[74,75]。mLS類抗生素耐藥機(jī)理主要有三種:(1)藥物主動(dòng)外??排機(jī)制介導(dǎo)的耐藥性突變,通過操縱子調(diào)控ATP泵,使抗生素主動(dòng)流出胞外,降低??胞內(nèi)藥物濃度,并使藥物與核糖體結(jié)合的能力下降,喪失藥效[7M8];?(2)通過調(diào)控ermA、??ermB、ermC,介導(dǎo)23SrRNA甲基化酶發(fā)生改變,或使核糖體結(jié)合藥物的作用位點(diǎn)發(fā)生??改變,降低甚至阻斷藥物的殺菌能力,以達(dá)到耐藥的目的[79,8t)];?(3)直接通過體內(nèi)的??代謝酶破壞藥物活性結(jié)構(gòu),使藥物失活[81]。??氨基糖甙類抗生素(Aminoglycosides)因?yàn)槠涓弊饔帽容^大,現(xiàn)已逐漸退出市場,??少數(shù)藥物如妥布霉素等也只作為局部用藥使用。其耐藥模式基本和MLS類抗生素相同,??
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