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HNP-1的原核基因工程表達(dá)和抑菌機(jī)制研究

發(fā)布時間:2020-08-04 11:06
【摘要】:細(xì)菌耐藥已成為危害全球公共衛(wèi)生的嚴(yán)重問題。近年來全球抗生素的使用量不斷增加,細(xì)菌耐藥的發(fā)生與傳播越來越嚴(yán)重,目前幾乎所有的病原菌均呈現(xiàn)出抗生素耐藥性,給全球醫(yī)療體系帶來巨大的經(jīng)濟(jì)和社會負(fù)擔(dān)。不幸的是,新型抗生素的開發(fā)遠(yuǎn)遠(yuǎn)趕不上耐藥菌增長的速度,且隨著抗生素使用量的大幅增加,出現(xiàn)細(xì)菌耐藥性的時間也更為短暫?咕氖情_發(fā)新型抗生素的重要候選者。它們由宿主表達(dá)以消除入侵的病原體并增強(qiáng)免疫應(yīng)答。其中人中性粒細(xì)胞蛋白(human neutrophil protein-1,HNP-1)是人中性粒細(xì)胞的主要抗菌肽分子,主要存在于人中性粒細(xì)胞的溶酶體顆粒內(nèi),是迄今發(fā)現(xiàn)含量最多的殺菌分子。HNP-1具有廣泛的抗菌譜和極強(qiáng)的抗菌活性,對革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌以及腺病毒、流感病毒、艾滋病毒等均有很強(qiáng)的殺傷活性,有可能成為新一代抗菌藥物,有助于解決細(xì)菌的耐藥性和抗生素的毒副作用等問題。盡管HNP-1有廣闊的應(yīng)用前景,天然獲取HNP-1的量極其有限,而化學(xué)合成HNP-1則由于其分子內(nèi)含有3對二硫鍵,難以保證多肽折疊時正確配對,從而影響其生物活性。因此,研究者嘗試通過各種融合表達(dá)策略進(jìn)行基因工程表達(dá),但是效果仍然不理想,很難使HNP-1形成正確的折疊。本課題研究HNP-1在大腸桿菌中有效表達(dá)、成熟過程及其殺菌機(jī)制,研究內(nèi)容和結(jié)論主要包括以下三個方面:1.在大腸桿菌BL21(DE3)表達(dá)全長HNP-1過程中,會激活產(chǎn)生有殺菌活性的mature HNP-1:(1)用tricine gel體系比較IPTG誘導(dǎo)前、后蛋白表達(dá)的差異,發(fā)現(xiàn)誘導(dǎo)后蛋白樣品在3.4kD附近出現(xiàn)明顯的條帶,切膠質(zhì)譜鑒定為mature HNP-1的肽段,并用top-down MS進(jìn)一步確認(rèn)了 mature HNP-1生成;(2)隨著IPTG誘導(dǎo)時間的延長,mature HNP-1表達(dá)量逐漸升高,而對應(yīng)的活細(xì)菌數(shù)目卻顯著減少;(3)根據(jù)mature HNP-1分子量較小的特點(diǎn),采用3kD超濾管對誘導(dǎo)后的全蛋白溶液進(jìn)行超濾,得到純化的mature HNP-1蛋白;(4)分別用純化的preproHNP-1和matureHNP-1加入菌液中檢測生長曲線,顯示preproHNP-1沒有抑菌活性,而mature HNP-1具有抑菌作用。2.HNP-1能夠誘發(fā)大腸桿菌BL21(DE3)產(chǎn)生細(xì)菌程序性死亡:(1)采用非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定HNP-1參與抑菌過程的蛋白,根據(jù)誘導(dǎo)前、后差異蛋白的功能聚類,并結(jié)合文獻(xiàn)報(bào)道推測HNP-1誘發(fā)了細(xì)菌程序性死亡過程;(2)TUNEL染色顯示HNP-1促進(jìn)DNA斷裂;Annexin V染色顯示HNP-1誘導(dǎo)使膜結(jié)構(gòu)發(fā)生了顯著變化,主要是內(nèi)膜外翻;掃描電鏡結(jié)果顯示細(xì)菌表面產(chǎn)生了大量凋亡樣小泡。上述經(jīng)典表型實(shí)驗(yàn)確認(rèn)HNP-1誘發(fā)大腸桿菌細(xì)菌程序性死亡過程。3.HNP-1通過和RecA結(jié)合,抑制其活性:(1)采用Ni-NTAbeads富集帶有His-tag的HNP-1及其相互作用蛋白,經(jīng)質(zhì)譜鑒定,結(jié)合蛋白功能注釋,篩選得到可能和HNP-1相互作用的蛋白RecA;(2)Western blot驗(yàn)證在HNP-1富集的相互作用蛋白溶液中存在RecA表達(dá);又用RecA蛋白抗體富集其相互作用蛋白,在其中同樣鑒定到HNP-1,從而正向和反向都確認(rèn)了兩者具有相互作用;(3)隨著誘導(dǎo)時間延長,mature HNP-1逐漸替代了 preproHNP1和RecA結(jié)合,進(jìn)一步說明是mature HNP-1和RecA相互結(jié)合為主;(4)通過分子對接軟件ZDOCK和PyMoL預(yù)測RecA和mature HNP-1的結(jié)合位點(diǎn),發(fā)現(xiàn)mature HNP-1正好能結(jié)合在RecA發(fā)揮重組修復(fù)活性的位點(diǎn)Asp-161和Ser-162,使RecA不能和DNA結(jié)合,抑制其活性;(5)采用體外實(shí)驗(yàn)證實(shí)加入10 μM mature HNP-1可以顯著降低RecA和ssDNA的結(jié)合水平,抑制RecA酶活性。通過本項(xiàng)研究,我們發(fā)現(xiàn)大腸桿菌不能高效表達(dá)全長HNP-1的原因是會激活產(chǎn)生有殺菌活性的mature HNP-1。并通過超濾法獲得了純化的有活性的mature HNP-1,為批量生產(chǎn)mature HNP-1提供了一種操作簡單和成本低廉的技術(shù)方案。我們的研究還揭示了 mature HNP-1在細(xì)菌內(nèi)的作用靶點(diǎn)RecA。Mature HNP-1可以抑制RecA蛋白和ssDNA結(jié)合,從而抑制其SOS修復(fù)功能。RecA由于其具有的重要功能,已經(jīng)成為抗耐藥菌治療的理想靶點(diǎn)。鑒于HNP-1在抑制RecA活性中的重要作用,有望成為新型抗耐藥菌藥物。
【學(xué)位授予單位】:武漢大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R91
【圖文】:

抗生素,人口大國,中低收入,低收入國家


新型抗生素的開發(fā)遠(yuǎn)遠(yuǎn)趕不上耐藥菌增長的規(guī)模(圖丨-3)。且隨著抗生素使逡逑用量的大幅增加,目前幾乎所有的抗生素都出現(xiàn)了抗性,人類面臨缺乏可用抗生逡逑素的困境(圖1-4)。逡逑_一-一…’一逡逑70-邋-二邐_邋MRSA逡逑30邋H邋W逡逑圖1-3抗生素耐藥性增加而新增抗生素?cái)?shù)量下降[7],耐甲氧西林金黃色葡萄球菌逡逑(MRSA)、耐萬古霉素腸球菌(VRE)、耐氟喹諾酮銅綠假單胞菌(FQRP)逡逑

抗生素耐藥性,耐萬古霉素腸球菌,耐甲氧西林金黃色葡萄球菌,喹諾酮


邐2015邐-mcome邋mkjdle-income逡逑圖1-2全球抗生素消費(fèi)2000-2015,邋(A)中低收入國家抗生素消費(fèi)量增速更快;(B)在中逡逑低收入國家中的人口大國的抗生素使用總量增長迅速[5]。逡逑J逡逑2017年世界衛(wèi)生組織公布了首份抗生素耐藥“重點(diǎn)病原體”清單[6]。該清單逡逑特別強(qiáng)調(diào)了對多種抗生素耐藥的革蘭氏陰性菌的威脅。這些細(xì)菌具有尋找新方法逡逑抵抗抗生素治療的內(nèi)在能力,并且還可以廣泛傳播使其它細(xì)菌產(chǎn)生耐藥的遺傳物逡逑質(zhì)。該清單根據(jù)新型抗生素的迫切需求程度將12種耐藥菌分為三個類別:極為逡逑重要、十分重要和中等重要。極為重要組中包括包括碳青霉烯類藥物耐藥鮑曼不逡逑動桿菌、碳青霉烯類藥物耐藥綠膿桿菌和碳青霉烯類藥物耐藥、產(chǎn)超廣譜P-內(nèi)酰逡逑胺酶腸桿菌科,這些細(xì)菌可引起嚴(yán)重且致命的肺部和血液感染。逡逑日益增加的耐藥菌數(shù)量給全球醫(yī)療體系帶來巨大的經(jīng)濟(jì)和社會負(fù)擔(dān)。不幸的逡逑是,新型抗生素的開發(fā)遠(yuǎn)遠(yuǎn)趕不上耐藥菌增長的規(guī)模(圖丨-3)。且隨著抗生素使逡逑用量的大幅增加,目前幾乎所有的抗生素都出現(xiàn)了抗性,人類面臨缺乏可用抗生逡逑素的困境(圖1-4)。逡逑_一-一…’一逡逑70-邋-二邐_邋MRSA逡逑30邋H邋W逡逑圖1-3抗生素耐藥性增加而新增抗生素?cái)?shù)量下降[7],耐甲氧西林金黃色葡萄球菌逡逑(MRSA)、耐萬古霉素腸球菌(VRE)、耐氟喹諾酮銅綠假單胞菌(FQRP)逡逑

耐藥菌,抗生素


圖14耐藥菌和所對應(yīng)的抗生素ra逡逑耐藥菌使新型抗生素研發(fā)受阻邐‘逡逑圖1-4所示,制藥企業(yè)和科研機(jī)構(gòu)對新型抗生素研發(fā)投入持續(xù)降低,藥菌的出現(xiàn)使藥物利潤大幅減少。在開始加入致死劑量的抗生素能迅分對抗生素敏感的細(xì)菌群體,但是菌群中仍然存在少量以非常慢的速生長的殘留細(xì)胞,稱為持留菌(persister),是形成抗生素耐藥菌的關(guān)I邐II邐111邐IV逡逑丨—sns邋==邋0is^r0m逡逑I逡逑,邐IV邐IV逡逑

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本文編號:2780462

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