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共生曲霉菌D來(lái)源的聚酮類化合物及其生物合成初探

發(fā)布時(shí)間:2020-06-18 19:21
【摘要】:海洋是一個(gè)低溫、高壓、高鹽等復(fù)雜而又特殊的環(huán)境,海洋微生物生存于這樣的環(huán)境中逐步衍生出與陸地生物不同的遺傳基因和代謝機(jī)制,造就了其獨(dú)特的代謝和防御系統(tǒng)。海洋微生物與海洋海藻、無(wú)脊椎動(dòng)物共附生是一種很普遍的現(xiàn)象,共附生微生物更能產(chǎn)生結(jié)構(gòu)新穎、活性多樣的新穎天然產(chǎn)物。海洋共生曲霉菌是近年來(lái)研究最為廣泛的海洋真菌,其次級(jí)代謝產(chǎn)物具有廣泛的化學(xué)多樣性和生物活性,是篩選藥物先導(dǎo)化合物的重要來(lái)源之一。曲霉菌次級(jí)代謝產(chǎn)物是在一系列相關(guān)酶連續(xù)作用下逐步生成的,這一系列的酶促反應(yīng)組成了代謝途徑,對(duì)曲霉菌次級(jí)代謝產(chǎn)物生物合成途徑進(jìn)行深入研究有利于探究其代謝機(jī)理和提高產(chǎn)物產(chǎn)量。論文以濱海植物結(jié)香(Edgeworthia chrysantha Lindl.)來(lái)源的一株共生曲霉菌D為研究對(duì)象,系統(tǒng)開展了次級(jí)代謝產(chǎn)物生物合成基因簇分析、次級(jí)代謝產(chǎn)物分離與鑒定、生物活性評(píng)價(jià)及聚酮類產(chǎn)物生物合成的研究。曲霉菌D經(jīng)馬鈴薯葡萄糖液體培養(yǎng)基(PDB)培養(yǎng)、固體大米規(guī)模發(fā)酵、乙酸乙酯(EtOAc)超聲萃取后得到粗提物I。采用現(xiàn)代色譜技術(shù)(pre-HPLC、semiprep-HPLC等),對(duì)粗提物I進(jìn)行系統(tǒng)的分離,共得到了8個(gè)單體化合物(1 8),利用現(xiàn)代波譜技術(shù)(NMR、MS等)并查閱相關(guān)文獻(xiàn)數(shù)據(jù),鑒定了8個(gè)聚酮類單體化合物分別為:rubrofusarin B(1),alternariol 9-O-methyl ether(2),fonsecinone D(3),asperpyrone A(4),asperpyrone D(5),fonsecinone B(6),fonsecinone A(7)和aurasperone A(8)。抑菌活性研究結(jié)果表明,化合物1-8對(duì)大腸桿菌(Escherichia coli AB 94012)、白色念珠菌(Candida albicans AY 204006)和金黃色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus AB 2010021)的抑制作用較弱,MIC值均高于100μg·mL~(-1);僅化合物8對(duì)幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)有一定的抑制能力,其MIC值為50μg·mL~(-1)。微生物全基因組測(cè)序與結(jié)果分析,表明曲霉菌D具有代謝豐富次級(jí)代謝產(chǎn)物的能力。通過(guò)antiSMASH預(yù)測(cè)菌D中包含11個(gè)合成PKS關(guān)鍵基因簇,對(duì)其基因簇進(jìn)行產(chǎn)物結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)菌D具有代謝betaenone類、equisetin類及alternapyrone類化合物的功能。分子生物學(xué)分析結(jié)果表明基因scaffold8.t287可能參與調(diào)控合成聚酮類化合物,經(jīng)抗性標(biāo)記篩選、重組載體構(gòu)建、根瘤農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化等實(shí)驗(yàn)后敲除該目的基因,采用PCR驗(yàn)證并測(cè)序后成功得到敲除菌株?HY44,在相同條件下發(fā)酵菌?HY44得到粗提物II,經(jīng)HPLC制備分離,結(jié)合~1H NMR、UPLC技術(shù)發(fā)現(xiàn)敲除菌株?HY44的代謝產(chǎn)物種類和含量均發(fā)生了改變,表明該基因確實(shí)參與調(diào)控聚酮類化合物的生物合成。
【學(xué)位授予單位】:浙江工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R914
【圖文】:

生物合成途徑,化合物


圖 1-1 Notoamide E4 的生物合成途徑推測(cè)Figure 1-1. Plausible biosynthetic pathway of notoamide E41.1.2 曲霉 Aspergillus allahabadii 的研究概述一株香桂來(lái)源的植物內(nèi)生真菌 Aspergillus allahabadii BCC45335[3],經(jīng) PDB 發(fā)酵后,分離得到 2 個(gè)新化合物 allahabadolactones A(1.22) 和 B (1.23),以及 3 個(gè)已知的化合物(1.24 1.26)。而后,對(duì)化合物 1.22 和 1.23 的生物活性及生物合成途徑進(jìn)行了研究,如圖 1-2;钚詫(shí)驗(yàn)表明,化合物 1.22 1.23 對(duì) Vero 和 NCI-H187 細(xì)胞株均有一定細(xì)胞毒活性,其 IC50值范圍大約為 0.58-30.51 μg·mL-1。1.22 1.23

生物合成途徑,化合物


圖 1-2 化合物 1.22 1.23 生物合成途徑推測(cè)Figure 1-2. Plausible biosynthetic pathway of compounds 1.22 1.23.3 曲霉 Aspergillus europaeus 的研究概述查閱文獻(xiàn)資料報(bào)道,大都研究者對(duì)曲霉菌來(lái)源的次級(jí)代謝產(chǎn)物進(jìn)行抗菌抗腫評(píng)價(jià),而關(guān)于抗氧化方面的研究較少,F(xiàn)有一株海綿 Xestospongia testudinaria 曲霉菌 Aspergillus europaeus WZXY-SX-4-1[4],基于 OSMAC 策略,對(duì)該菌分別、MnPY、ISP2、PDB 液體培養(yǎng)基,及加海鹽的固體大米培養(yǎng)基發(fā)酵,經(jīng) EtOA萃取、初步 DPPH 活性實(shí)驗(yàn)后表明大米發(fā)酵得到的粗提物有顯著的清除自由基活終確定選擇大米作為培養(yǎng)基。結(jié)合硅膠柱和 HPLC 分離,分離得到六個(gè)新聚酮物,分別為 eurobenzophenones A-C (1.27 1.29),euroxanthones A-B (1.30 1.31),及O-demethylvariecolorquinones A(1.32),化合物 1.29 對(duì)于清除 DPPH 具有較好的活合物 1.28 對(duì)于 DPPH 的清除有微弱活性,相應(yīng)的 IC50值分別為 1.70 和 18.5 μg·m 96 孔板 NO 抑制實(shí)驗(yàn)證明,所有化合物均有對(duì)小鼠格子細(xì)胞 BV2 抑制作用及人腸癌細(xì)胞株 SW480 中 NF-κB 激活作用,從而抑制 LPS 誘導(dǎo)一氧化氮(NO)產(chǎn)

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