肽核酸(PNA)介入DNA雜合催化劑的研究
發(fā)布時(shí)間:2020-04-10 15:28
【摘要】:不對(duì)稱催化一直是現(xiàn)代有機(jī)化學(xué)的研究重點(diǎn),DNA雜合催化劑由于其高效高選擇性的特點(diǎn)從2005年被提出以來(lái)便得到了廣泛的發(fā)展,DNA雜合催化劑由手性支架、催化金屬中心以及連接兩者的配體三部分組成,通過(guò)對(duì)這三部分的改造、修飾,人們可以實(shí)現(xiàn)對(duì)催化劑的性能優(yōu)化以及催化機(jī)理的探索。本論文第一次將肽核酸雙鏈(PNA-PNA)及PNA-DNA雜交鏈作為手性支架構(gòu)成新型雜合催化劑應(yīng)用到不對(duì)稱反應(yīng)中,同時(shí)與傳統(tǒng)DNA雜合催化劑進(jìn)行對(duì)比來(lái)探索溝渠大小對(duì)催化性能的影響。PNA作為DNA的結(jié)構(gòu)類似物,可通過(guò)Watson-Crick鍵與DNA合成手性雙鏈體。本文合成了三種類型的手性支架,將其與聯(lián)吡啶銅絡(luò)合組成雜合催化劑,通過(guò)Friedel-Crafts反應(yīng)來(lái)評(píng)價(jià)催化性能。結(jié)果顯示三種類型的雙鏈合成的雜合催化劑均能催化反應(yīng)并且可以得到一定的對(duì)映體過(guò)量值(enantiomeric excess,ee),通過(guò)對(duì)比實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)我們發(fā)現(xiàn)隨著雙鏈中PNA成分的增加ee值呈下降趨勢(shì),這可能是PNA骨架不帶電荷雙鏈間無(wú)靜電斥力進(jìn)而改變了雙鏈溝渠的大小造成的,離子強(qiáng)度實(shí)驗(yàn)從DNA溝渠的角度驗(yàn)證這一結(jié)論。重復(fù)性實(shí)驗(yàn)則證明PNA介入后的雜合催化劑的催化效果比DNA雜合催化劑穩(wěn)定,可重復(fù)利用多次。為了進(jìn)一步討論催化結(jié)果差異的原因,本論文進(jìn)行了一系列光譜學(xué)的表征方法。圓二色譜實(shí)驗(yàn)表明聯(lián)吡啶銅與三種雙鏈的作用模式有顯著差異。紫外滴定實(shí)驗(yàn)顯示PNA-PNA雙鏈與聯(lián)吡啶銅的結(jié)合常數(shù)較大,說(shuō)明PNA雙鏈的結(jié)構(gòu)與聯(lián)吡啶銅的親和能力強(qiáng),這證明了 PNA催化反應(yīng)的ee值較低并不是由于游離的聯(lián)吡啶銅造成的。Tm實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示PNA雙鏈最穩(wěn)定,表明PNA雜合催化劑有實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。本文首次將PNA應(yīng)用到雜合催化領(lǐng)域,拓寬了手性支架的范圍,并且討論了造成DNA-DNA、DNA-PNA和PNA-PNA三種雙鏈做手性支架的雜合催化劑催化效果出現(xiàn)差異的原因,為雜合催化劑手性支架的研究拓寬了思路。
【圖文】:
離子結(jié)合生成過(guò)渡金屬配合物,可以引領(lǐng)過(guò)渡金屬進(jìn)入或接近DNA雙螺旋,從而使逡逑催化反應(yīng)發(fā)生的位置在DNA手性微環(huán)境內(nèi),將DNA的手性傳遞給催化中心,進(jìn)而產(chǎn)逡逑生具有對(duì)映體過(guò)量值的產(chǎn)物。過(guò)渡金屬配合物與DNA共有兩種結(jié)合策略(圖1-1),超逡逑分子自組裝(圖1-1B)和共價(jià)錨定(圖1-1A)。逡逑超分子自組裝主要有小溝結(jié)合和插入結(jié)合兩種作用方式,金屬離子配合物主要依逡逑靠氫鍵、范德華力和靜電吸引等相互作用力與DNA結(jié)合,而共價(jià)錨定則是將金屬配逡逑合物與DNA以共價(jià)鍵的形式連接在一起f14,邋W,連接位置可以是化學(xué)修飾過(guò)的堿基或逡逑磷脂。逡逑A逡逑sS邐h邐^非手性底物逡逑CM+邋■—自組裝一逡逑B逡逑共價(jià)修飾的核苷酸逡逑_邐y邋y邐b邋,非手性底物逡逑ill逡逑^+CM邐s邐p、手性產(chǎn)物逡逑圖1-1邋(A)超分子自組裝結(jié)合方式;(B)共價(jià)結(jié)合方式逡逑Figure邋1-1邋(A)Supramolecular邋self-assembly;邋(B)Covalent邋attachment邋strategy.逡逑1.1.1.2配體的發(fā)展逡逑配體經(jīng)過(guò)第一代和第二代的發(fā)展(圖1-2),2005年首次發(fā)現(xiàn)DNA雜合催化劑時(shí)所逡逑應(yīng)用的為第一代配體(圖1-2A),其組成包括氨甲基吡、一段柔性連和9-氨基吖啶。研逡逑究表明,由第一代配體組成的雜合催化劑的催化性能與取代基R和柔性連的長(zhǎng)度有逡逑關(guān)
Figure邋1-7邋CD邋spectra邋of邋DNA邋(A)邋B-A邋transition;邋B)邋B-Z邋transition逡逑(2)邐G■四聯(lián)體DNA逡逑中國(guó)科學(xué)院的李燦課題組在2012年發(fā)現(xiàn)人工構(gòu)建的G四聯(lián)體DNA(圖1-8A)也可逡逑以催化不對(duì)稱Friedel-Crafts反應(yīng),不需要配體,,直接加銅離子就可以進(jìn)行催化,最高逡逑可得到75%的ee值,并且催化產(chǎn)物的絕對(duì)構(gòu)型和對(duì)映體選擇性受到DNA序列的影響。逡逑隨后的研究中發(fā)現(xiàn)G4DNA催化反應(yīng)的ee值可受堿金屬的調(diào)控[32],當(dāng)加Na+時(shí)反應(yīng)逡逑ee值為正,加K+時(shí)反應(yīng)ee值為負(fù),進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)加不同的堿金屬離子可對(duì)G4DNA逡逑的CD信號(hào)產(chǎn)生不同影響,說(shuō)明堿金屬可以造成G4DNA結(jié)構(gòu)的變化,最終表現(xiàn)為對(duì)逡逑催化反應(yīng)中a值的影響。逡逑A邐B邐C逡逑:媝i:便I!邐c~栧義希義賢跡保福ǎ粒撬牧;(n┚迪瘢模危;(C)DN>殺祭C義希疲椋紓酰潁邋澹保稿澹ǎ粒牽瘢酰幔洌潁酰穡歟澹誨澹ǎ攏停椋潁潁錚潁桑恚幔紓邋澹模危粒誨澹ǎ茫模危鈴澹齲幔椋潁穡椋鑠義希ǎ常
本文編號(hào):2622396
【圖文】:
離子結(jié)合生成過(guò)渡金屬配合物,可以引領(lǐng)過(guò)渡金屬進(jìn)入或接近DNA雙螺旋,從而使逡逑催化反應(yīng)發(fā)生的位置在DNA手性微環(huán)境內(nèi),將DNA的手性傳遞給催化中心,進(jìn)而產(chǎn)逡逑生具有對(duì)映體過(guò)量值的產(chǎn)物。過(guò)渡金屬配合物與DNA共有兩種結(jié)合策略(圖1-1),超逡逑分子自組裝(圖1-1B)和共價(jià)錨定(圖1-1A)。逡逑超分子自組裝主要有小溝結(jié)合和插入結(jié)合兩種作用方式,金屬離子配合物主要依逡逑靠氫鍵、范德華力和靜電吸引等相互作用力與DNA結(jié)合,而共價(jià)錨定則是將金屬配逡逑合物與DNA以共價(jià)鍵的形式連接在一起f14,邋W,連接位置可以是化學(xué)修飾過(guò)的堿基或逡逑磷脂。逡逑A逡逑sS邐h邐^非手性底物逡逑CM+邋■—自組裝一逡逑B逡逑共價(jià)修飾的核苷酸逡逑_邐y邋y邐b邋,非手性底物逡逑ill逡逑^+CM邐s邐p、手性產(chǎn)物逡逑圖1-1邋(A)超分子自組裝結(jié)合方式;(B)共價(jià)結(jié)合方式逡逑Figure邋1-1邋(A)Supramolecular邋self-assembly;邋(B)Covalent邋attachment邋strategy.逡逑1.1.1.2配體的發(fā)展逡逑配體經(jīng)過(guò)第一代和第二代的發(fā)展(圖1-2),2005年首次發(fā)現(xiàn)DNA雜合催化劑時(shí)所逡逑應(yīng)用的為第一代配體(圖1-2A),其組成包括氨甲基吡、一段柔性連和9-氨基吖啶。研逡逑究表明,由第一代配體組成的雜合催化劑的催化性能與取代基R和柔性連的長(zhǎng)度有逡逑關(guān)
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本文編號(hào):2622396
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