【摘要】：抗生素的有效性伴隨著抗生素的使用正在減弱,要保證抗生素能被人類持續(xù)利用,一方面采取有效措施減少抗生素的使用,以達(dá)到最合理地使用抗生素；另一方面,對(duì)抗生素的有效性進(jìn)行改進(jìn)更新,包括提高現(xiàn)有抗生素的效力和開發(fā)新的抗生素。與全球細(xì)菌耐藥泛濫形成鮮明對(duì)比的是,新抗生素研發(fā)相對(duì)遲緩。以放線菌為主的微生物是抗生素的重要來(lái)源,對(duì)于新抗生素的發(fā)現(xiàn),除了創(chuàng)新現(xiàn)有篩選策略外,藥用微生物資源問(wèn)題也是導(dǎo)致新抗生素研發(fā)遲緩的瓶頸問(wèn)題之一。特境藥用放線菌資源的開發(fā)成為當(dāng)前的一個(gè)研究熱點(diǎn)。基于以上研究背景,本論文選擇鹽湖這一特境,開展了九蓮城淖爾藥用放線菌資源勘探及3株特境放線菌新資源的多相分類研究,主要開展了以下研究工作：一、對(duì)九蓮城淖爾來(lái)源的土壤樣品進(jìn)行放線菌的分離；從中選取代表菌株進(jìn)行搖瓶發(fā)酵、提取代謝產(chǎn)物并對(duì)其進(jìn)行抗菌活性篩選；同時(shí)對(duì)代表菌株進(jìn)行Ⅰ型聚酮合酶(PKSⅠ)KS域、Ⅱ型聚酮合酶(PKSⅡ)KS域和非核糖體多肽合成酶(NRPS)A結(jié)構(gòu)域抗生素生物合成基因的檢測(cè)。從11份土壤樣品中分離純化到251株放線菌,歸屬于10個(gè)目15個(gè)科31個(gè)屬,優(yōu)勢(shì)菌屬為鏈霉菌屬和擬諾卡氏菌屬；其中37株可能為放線菌新物種。96株放線菌活性篩選結(jié)果顯示,56株至少對(duì)一種檢定菌具有抗菌活性,陽(yáng)性率較高,并且篩選到了多株對(duì)耐藥革蘭陰性菌有抗性的菌株；96株放線菌中84株至少攜帶3種生物合成基因中的1種,陽(yáng)性率高。二、九蓮城淖爾來(lái)源嗜鹽菌株J11Y309的多相分類菌株J11Y309T與糖霉菌科Salininema proteolyticum Miq-4T、Paraglycomyces exinjiangensis TRM 49201T和Haloglycomyces albus YIM 92370T的同源性最高,16SrRNA基因序列相似度分別為95.80%、95.77%和94.84%,P. xinjiangensis TRM 49201T和S. proteolyticum Miq-4T的同源性為99.5%。系統(tǒng)發(fā)育樹顯示菌株J11Y309T和S. proteolyticum Miq-4T、P. xinjiangensis TRM 49201T、H. albus YIM 92370T在糖霉菌科內(nèi)聚成一簇,并且它在該進(jìn)化枝內(nèi)形成了獨(dú)立的分枝。綜合多相分類學(xué)的研究結(jié)果,提出菌株J11Y309T代表糖霉菌科新屬新種,命名為白色鹽湖桿菌,同時(shí),將Paraglycomyces xinjiangensis Luo et al.2015重新分類為Salininema proteolyticum Nikou ef al.2015的一株異名同種菌株,并對(duì)Salininema屬和Salininema proteolyticum的描述進(jìn)行了補(bǔ)充修訂。三、九蓮城淖爾來(lái)源耐鹽菌株J12GA03的多相分類菌株J12GA03T與棒桿菌目 Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1T和Hoyosella altamirensis OFN S31T同源性最高,16S rRNA基因序列相似度分別為98.18%和97.75%；序列比對(duì)還發(fā)現(xiàn),A. subflavus DQS3-9A1T和H. altamirensis OFN S31T同源性為99.77%。系統(tǒng)發(fā)育樹顯示菌株J12GA03T、A. subflavus DQS3-9A1T和H. altamirensis OFN S31T在進(jìn)化樹內(nèi)聚成一小簇,并且菌株J12GA03T形成獨(dú)立的分枝；三菌株形成的進(jìn)化枝鄰近分枝桿菌科分枝桿菌屬的進(jìn)化枝。綜合多相分類學(xué)的研究結(jié)果,提出菌株J12GA03T為Hoyosella屬新種,命名為Hoyosella rhizosphera;同時(shí),將Amycolicicoccus subflavus Wang et al2010重新分類為Hoyosella altamirensis Jurado et al.2009的一株異名同種菌株,并對(duì)Hoyosella屬的描述進(jìn)行了補(bǔ)充修訂。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果,提出Hoyosella屬為棒桿菌目分枝桿菌科的一員。四、神仙洞來(lái)源菌株S6R2A4-9的多相分類系統(tǒng)發(fā)育樹顯示菌株S6R2A4-9T位于類諾卡氏菌科騰格里菌屬的進(jìn)化枝內(nèi),并且該菌株與騰格里菌屬Tenggerimyces mesophilus I12A-02601T最為相似,相似度為98.98%。菌株S6R2A4-9T與T. mesophilus I12A-02601T之間的DNA-DNA雜交值為27.6±3.0%。綜合多相分類學(xué)的研究結(jié)果,提出S6R2A4-9T為騰格里屬新種,命名為黃色騰格里菌。
【圖文】：

率在所有ＷＨＯ地區(qū)高于２０邋％，在某些地區(qū)高于８０邋％。全球２０１１－２０１４年三代頭逡逑抱耐藥大腸埃希菌檢出率、碳青霉蹄類耐藥肺炎克雷伯菌檢出率和甲氧西林耐藥金逡逑黃色葡萄球菌檢出率分別見圖１－２、１－３和１－４。歐洲疾控中也的監(jiān)測(cè)網(wǎng)２０１４年的報(bào)逡逑告中旨出，，２２個(gè)國(guó)家中１７個(gè)國(guó)家報(bào)道大腸埃希菌中超廣譜廬內(nèi)酷胺酶的陽(yáng)性率逡逑為８５％－１００％，２１個(gè)國(guó)家中１７個(gè)國(guó)家報(bào)道肺炎克雷伯菌中產(chǎn)超廣譜片－內(nèi)憸胺酶的逡逑陽(yáng)性率同樣高于８５邋％。美國(guó)疾控中屯２０１３年統(tǒng)計(jì)結(jié)果口５］顯示醫(yī)院感染相關(guān)腸桿菌逡逑科細(xì)菌中產(chǎn)超廣譜片內(nèi)憸胺酶的陽(yáng)性率可達(dá)１４邋％，肺炎克雷伯菌中產(chǎn)超廣譜片內(nèi)逡逑憸胺酶的陽(yáng)性率為２３邋％。逡逑。 。皆。聲萬(wàn)U危膩義峽衾洌蒞邋ＳＷ５邋醒邋W６0＊？３邋ＨｓｉＭＯＯ逡逑圖１－２２０１１－２０１４年全球王代頭抱耐藥大腸埃希菌檢出率（摘自美國(guó)動(dòng)態(tài)疾病、經(jīng)逡逑濟(jì)和政策研究中私＂２０１５年全球抗生素現(xiàn)狀＂報(bào)告）逡逑Ｆｉｇｕｒｅ邋１－２邋Ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅ邋ｏｆ邋ｔｈｉｒｄ－ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ邋ｃｅｐｈａｌｏｓｐｏｒｉｎｓ邋ｒｅｓｉｓｔａｎｔ邋ｃｏ／／，邋ｂｙ邋ｃｏｕｎｔｒｙ逡逑ｉｎ邋２０１１－２０１４邋（ｃｉｔｅｄ邋ｆｒｏｍ邋ｉ＾ｅｐｏｒｔ邋＂Ｓｔａｔｅ邋ｏｆ邋ｔｈｅ邋ＷｏｒｌｃＴｓ邋Ａｎｔ邋Ａｉｏｔｉｃｓ

巨邐媝…．》姦６。．＊。Ｂ邋微邋Ｍ＆９邋姦５。－；Ｎ？＜ｊａｔａ逡逑圖１－３邋２０１１－２０１４年全球碳青霉賭類耐藥肺炎克雷伯菌檢出率（摘自美國(guó)動(dòng)態(tài)疾逡逑病、經(jīng)濟(jì)和政策研究中私＂２０１５年全球抗生素現(xiàn)狀＂報(bào)告）逡逑Ｆｉｇｕｒｅ邋１－３邋Ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅ邋ｏｆ邋ｃａｒｂａｐｅｎｅｍ－ｒｅｓｉｓｔａｎｔ邋Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ邋ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ，邋ｂｙ邋ｃｏｕｎｔｒｙ逡逑ｉ打邋２０１１－２０１４邋（ｃｉｔｅｄ邋ｆｔ＂0ｍ邋ｒｅｐｏｉ＇ｔ邋＂Ｓ化化邋ｏｆ邋ｄｉｅ邋Ｗｏｒｌｄ’ｓ邋Ａｎｔ化ｉｏｔｉｃｓ，，ｏｆ邋ＣＤＤＥＰ）逡逑注：數(shù)據(jù)來(lái)源為ＣＤＤＥＰ邋２０１５凹，ＷＨＯ邋２０１４［巧ａｎｄ邋ＰＡＨＯ［２６］。逡逑Ｎｏｔｅ：邋Ｄａ化邋ｗａｓ邋ｆｒｏｍ邋ＣＤＤＥＰ邋２０１５，邋ＷＨＯ邋２０１４邋ａ打ｄ邋ＰＡＨＯ．逡逑－節(jié)巧．逡逑□邋？■巧曊換汾邋Ｂ邋４０－５９邋灥邐ＮｏａＭａ逡逑圖１－４邋２０１１－２０１４年全球麻甲氧西林金黃色葡萄球菌檢出率（摘自美國(guó)動(dòng)態(tài)疾病、逡逑經(jīng)濟(jì)和政策研究中如＂２０１５年全球抗生素現(xiàn)狀＂報(bào)告）逡逑Ｆｉｇｕｒｅ邋１－４邋Ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅ邋ｏｆ邋ｍｅｔｈｉｃＵｌｉｎ邋ｒｅｓｉｓｔａｎｔ邋Ｓｔａｐｈｙ／ｏｃｏｃｃｕｓ邋ａｕｒｅｕｓ＾邋ｂｙ邋ｃｏｕｎｔｒｙ邋ｉｎ逡逑２０１１－２０１４邋（ｃｉｔｅｄ邋ｆｒｏｍ邋ｒｅｐｏｒｔ邋＂Ｓ化化邋ｏｆ邋ｔｈｅ邋ＷｏｒｋＴｓ邋Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ，，ｏｆ邋ＣＤＤＥＰ）逡逑注數(shù)據(jù)來(lái)源為ＣＤＤＥＰ邋２０１５間，ＷＨＯ邋２０ｉ４［２３］ａｎｄ邋ＰＡＨＯ口６］。逡逑Ｎｏ化：Ｄａ化邋ｗａｓ邋ｆｒｏｍ邋ＣＤＤＥＰ邋２０１５
【學(xué)位授予單位】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R915


本文編號(hào)：2561991