發(fā)布時(shí)間：2019-04-04 10:04

【摘要】：目的利用藥效團(tuán)模型和分子對(duì)接方法對(duì)商業(yè)化合物庫(kù)ChemDiv中的G9afocused-libraries進(jìn)行篩選,希望發(fā)現(xiàn)新骨架結(jié)構(gòu)的G9a抑制劑。方法首先,使用Discovery studio 3.1軟件分別構(gòu)建基于配體的藥效團(tuán)模型和基于配體-受體復(fù)合物的藥效團(tuán)模型,并根據(jù)構(gòu)建的2個(gè)模型再重新定義2個(gè)新的藥效團(tuán)模型。然后,構(gòu)建測(cè)試集并測(cè)試藥效團(tuán)模型的預(yù)測(cè)能力。最后,選取最優(yōu)藥效團(tuán)模型對(duì)G9afocused-libraries進(jìn)行篩選,對(duì)篩選出的化合物使用CDOCKER分子對(duì)接進(jìn)行分析與評(píng)價(jià)。結(jié)果測(cè)試結(jié)果顯示,所構(gòu)建的藥效團(tuán)模型具有一定的預(yù)測(cè)能力,通過(guò)該藥效團(tuán)篩選得到了2個(gè)結(jié)構(gòu)新穎的潛在的G9a抑制劑。結(jié)論所構(gòu)建的藥效團(tuán)模型具有一定的可靠性,虛擬篩選發(fā)現(xiàn)的G9a抑制劑還需進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)證明。
[Abstract]:Aim to screen the G9afocused-libraries in the commercial chemical library ChemDiv by using the pharmacophore model and molecular docking method, and hope to find a new G9a inhibitor with a new skeleton structure. Methods firstly, the pharmacophore models based on ligand and ligand-receptor complex were constructed by using Discovery studio 3.1. and two new pharmacodynamics models were redefined according to the two models. Then, the test set is constructed and the predictive ability of the pharmacodynamics model is tested. Finally, the optimal pharmacophore model was selected to screen G9afocused-libraries, and the selected compounds were analyzed and evaluated by CDOCKER molecular docking. Results the experimental results showed that the established pharmacophore model had certain predictive ability. Two potential G9a inhibitors with novel structure were obtained by screening the pharmacophore. Conclusion the established pharmacophore model has certain reliability, and the G9a inhibitors found by virtual screening should be proved by further experiments.
【作者單位】： 四川大學(xué)生物治療國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【分類號(hào)】：R96

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 彭濤,周家駒;基于藥效團(tuán)的三維數(shù)據(jù)庫(kù)搜索[J];物理化學(xué)學(xué)報(bào);2003年09期

2 張燕玲,王耘,喬延江;中藥與天然產(chǎn)物研究中藥效團(tuán)的構(gòu)建與應(yīng)用[J];世界科學(xué)技術(shù);2004年04期

3 彭濤,周家駒;表皮生長(zhǎng)因子受體酪氨酸激酶抑制劑的藥效團(tuán)研究(英文)[J];計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué);2005年06期

4 肖靜;房咪;陳姣;鄭珩;;藥效團(tuán)技術(shù)在抗感染新藥研究中的應(yīng)用[J];抗感染藥學(xué);2013年03期

5 方浩,盧景芬,夏霖;尿道選擇性α_1-腎上腺素受體拮抗劑藥效團(tuán)的構(gòu)建(英文)[J];Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences;2003年04期

6 李嘉賓;夏霖;陳亞?wèn)|;;α_(1A)-亞型腎上腺素受體拮抗劑3D藥效團(tuán)模型的研究[J];化學(xué)學(xué)報(bào);2007年16期

7 季宇彬;田然;劉振明;張亮仁;林文翰;;基于蛋白質(zhì)藥效團(tuán)匹配的化合物功能預(yù)測(cè)[J];哈爾濱商業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2007年06期

8 鮑紅娟;張燕玲;喬延江;;HMG-CoA還原酶抑制劑三維藥效團(tuán)的構(gòu)建[J];物理化學(xué)學(xué)報(bào);2008年02期

9 董光;鄧學(xué)娟;;整合藥效團(tuán)的分子對(duì)接方法研究[J];計(jì)算機(jī)應(yīng)用與軟件;2011年10期

10 艾觀華;顧月清;;采用基于結(jié)構(gòu)的藥效團(tuán)模型和分子對(duì)接方法用于發(fā)現(xiàn)新的表皮生長(zhǎng)因子受體抑制劑[J];藥物生物技術(shù);2014年02期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 王星;張燕玲;喬延江;;藥效團(tuán)技術(shù)在中藥研究中的應(yīng)用[A];中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)中藥分析分會(huì)第五屆學(xué)術(shù)交流會(huì)論文集[C];2012年

2 鮑紅娟;張燕玲;喬延江;;HMG-CoA還原酶抑制劑三維藥效團(tuán)的構(gòu)建[A];中醫(yī)藥優(yōu)秀論文選（上）[C];2009年

3 姜鳳超;劉玲;金華;倪廣慧;;利用天然藥物的磷酸二酯酶抑制劑構(gòu)建藥效團(tuán)模型[A];2006第六屆中國(guó)藥學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2006年

4 劉小利;胡文祥;;芬太尼類化合物藥效團(tuán)模型構(gòu)建與應(yīng)用[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第26屆學(xué)術(shù)年會(huì)有機(jī)化學(xué)分會(huì)場(chǎng)論文集[C];2008年

5 代英杰;王新宇;王大偉;康從民;;苯并咪唑類血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子受體-2抑制劑藥效團(tuán)模型的構(gòu)建與應(yīng)用[A];2011年全國(guó)藥物化學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議——藥物的源頭創(chuàng)新論文摘要集[C];2011年

6 鄭光輝;季興躍;易紅;李卓榮;;作用于MDM2-p53結(jié)合的小分子抑制劑藥效團(tuán)的構(gòu)建[A];2012年中國(guó)藥學(xué)大會(huì)暨第十二屆中國(guó)藥師周論文集[C];2012年

7 鮑紅娟;唐亞林;徐筱杰;向俊峰;鄭智慧;路新華;;二氫乳清酸脫氫酶抑制劑藥效團(tuán)模型的構(gòu)建[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第27屆學(xué)術(shù)年會(huì)第15分會(huì)場(chǎng)摘要集[C];2010年

8 劉翎;劉宗英;孟帥;易紅;金潔;李卓榮;;作用于秋水仙堿結(jié)合位點(diǎn)的微管蛋白抑制劑藥效團(tuán)的構(gòu)建及應(yīng)用[A];2011年中國(guó)藥學(xué)大會(huì)暨第11屆中國(guó)藥師周論文集[C];2011年

9 張生烈;魏寅祥;李乾;孫昊鵬;彭暉;尤啟冬;;基于藥效團(tuán)模型的新型ABCB1抑制劑設(shè)計(jì)以及生物活性評(píng)價(jià)[A];2012年中國(guó)藥學(xué)大會(huì)暨第十二屆中國(guó)藥師周論文集[C];2012年

10 曾露;張醉;趙娟;吳曉靈;姜鳳超;;磷酸二酯酶-4(PDE4)抑制劑藥效團(tuán)模型的構(gòu)建[A];2008年中國(guó)藥學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)暨第八屆中國(guó)藥師周論文集[C];2008年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前1條

1 李和平;中國(guó)醫(yī)科院藥物所整合多學(xué)科研究抗炎新藥[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2005年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 張燕玲;基于三維藥效團(tuán)的活血化瘀中藥虛擬篩選方法學(xué)研究[D];北京中醫(yī)藥大學(xué);2006年

2 董愛國(guó);RXR藥效團(tuán)模建和分子對(duì)接研究[D];天津大學(xué);2009年

3 郭亦然;基于三維數(shù)據(jù)庫(kù)搜尋的中藥信息學(xué)研究[D];北京中醫(yī)藥大學(xué);2006年

4 許哲軍;GPCR配體藥效團(tuán)模擬及其數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建研究[D];華東理工大學(xué);2012年

5 魏靜;腺苷受體拮抗劑藥效團(tuán)模建和分子對(duì)接研究[D];天津大學(xué);2007年

6 張小軼;以人類免疫缺陷病毒整合酶為靶點(diǎn)的藥物設(shè)計(jì)及耐藥機(jī)理研究[D];北京工業(yè)大學(xué);2009年

7 趙鑫;選擇性α_(1A)-腎上腺素受體拮抗劑的藥物分子計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)及細(xì)胞模型篩選研究[D];廣州醫(yī)學(xué)院;2012年

8 成碟;噻吩并吡啶類衍生物的設(shè)計(jì)、合成、活性評(píng)價(jià)及其藥效團(tuán)模型[D];天津大學(xué);2009年

9 孔韌;阻斷病毒進(jìn)入細(xì)胞的抗HIV-1藥物設(shè)計(jì)[D];北京工業(yè)大學(xué);2008年

10 王永華;計(jì)算ADME研究[D];中國(guó)科學(xué)院研究生院（大連化學(xué)物理研究所）;2006年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 朱鈺;醛糖還原酶抑制劑的藥效團(tuán)模型研究[D];中央民族大學(xué);2015年

2 劉冬青;血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子受體-2雙重拮抗劑的設(shè)計(jì)與合成[D];青島科技大學(xué);2015年

3 楊曄;抗病毒相關(guān)藥效團(tuán)的構(gòu)建及評(píng)價(jià)方法研究[D];北京中醫(yī)藥大學(xué);2010年

4 劉維國(guó);抗藥物依賴功效藥效團(tuán)模型的構(gòu)建及其虛擬篩選[D];中央民族大學(xué);2013年

5 李鳳麗;基于藥效團(tuán)和定量構(gòu)效關(guān)系模型的篩選系統(tǒng)平臺(tái)設(shè)計(jì)[D];東北師范大學(xué);2012年

6 白崇亮;PI3K亞型選擇性抑制劑的藥效團(tuán)分析及以PI3K為靶點(diǎn)的虛擬篩選[D];蘭州大學(xué);2012年

7 馬亞瓊;一系列微管聚合抑制劑的活性評(píng)價(jià)、藥效團(tuán)模型及分子對(duì)接研究[D];蘭州大學(xué);2013年

8 何獻(xiàn)卓;整合酶藥效團(tuán)模型構(gòu)建及芳香二酮類化合物的設(shè)計(jì)與合成[D];北京工業(yè)大學(xué);2012年

9 劉強(qiáng);沙坦類抗高血壓藥物的藥效團(tuán)研究及新化合物設(shè)計(jì)評(píng)價(jià)[D];中南大學(xué);2012年

10 芮亞然;金不換抗藥物依賴有效成分的藥效團(tuán)模型的理論研究[D];中央民族大學(xué);2012年

，

本文編號(hào)：2453709