【摘要】：目的利用藥效團模型和分子對接方法對商業(yè)化合物庫ChemDiv中的G9afocused-libraries進行篩選,希望發(fā)現(xiàn)新骨架結(jié)構(gòu)的G9a抑制劑。方法首先,使用Discovery studio 3.1軟件分別構(gòu)建基于配體的藥效團模型和基于配體-受體復(fù)合物的藥效團模型,并根據(jù)構(gòu)建的2個模型再重新定義2個新的藥效團模型。然后,構(gòu)建測試集并測試藥效團模型的預(yù)測能力。最后,選取最優(yōu)藥效團模型對G9afocused-libraries進行篩選,對篩選出的化合物使用CDOCKER分子對接進行分析與評價。結(jié)果測試結(jié)果顯示,所構(gòu)建的藥效團模型具有一定的預(yù)測能力,通過該藥效團篩選得到了2個結(jié)構(gòu)新穎的潛在的G9a抑制劑。結(jié)論所構(gòu)建的藥效團模型具有一定的可靠性,虛擬篩選發(fā)現(xiàn)的G9a抑制劑還需進一步的實驗證明。
[Abstract]:Aim to screen the G9afocused-libraries in the commercial chemical library ChemDiv by using the pharmacophore model and molecular docking method, and hope to find a new G9a inhibitor with a new skeleton structure. Methods firstly, the pharmacophore models based on ligand and ligand-receptor complex were constructed by using Discovery studio 3.1. and two new pharmacodynamics models were redefined according to the two models. Then, the test set is constructed and the predictive ability of the pharmacodynamics model is tested. Finally, the optimal pharmacophore model was selected to screen G9afocused-libraries, and the selected compounds were analyzed and evaluated by CDOCKER molecular docking. Results the experimental results showed that the established pharmacophore model had certain predictive ability. Two potential G9a inhibitors with novel structure were obtained by screening the pharmacophore. Conclusion the established pharmacophore model has certain reliability, and the G9a inhibitors found by virtual screening should be proved by further experiments.
【作者單位】： 四川大學(xué)生物治療國家重點實驗室;
【分類號】：R96

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本文編號：2453709