【摘要】：N-甲基-D-天冬氨酸受體(NMDAR)拮抗劑用于治療患者的疼痛,常用于緩解癌痛,近期文獻(xiàn)中報(bào)道了NMDAR信號(hào)通路可以促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)和侵襲的能力,目的:本文中運(yùn)用3D-QSAR建模的方法對(duì)NMDAR拮抗劑進(jìn)行構(gòu)效關(guān)系分析并對(duì)其化合物結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化改造。方法:基于共同骨架對(duì)分子進(jìn)行疊合,并在此基礎(chǔ)上采用Sybyl-X2.1中的三維定量構(gòu)效關(guān)系(3D-QSAR)模塊建立了Co MFA和Co MSIA模型。結(jié)果:其中,基于公共骨架疊合方法所得3D-QSAR模型的評(píng)價(jià)參數(shù)中最佳結(jié)果如下所示,Co MFA:Q~2=0.691,R~2=0.995,F=511.269,SEE=0.083;Co MSIA:Q~2=0.715,R~2=0.998,F=1396.317,SEE=0.051,(Q~2為交叉驗(yàn)證系數(shù),R~2為非交叉驗(yàn)證系數(shù))。結(jié)論:數(shù)據(jù)證明模型具有較好的預(yù)測(cè)能力,可以較好地指導(dǎo)四氫喹啉類NMDAR拮抗劑的設(shè)計(jì)和改造,得到活性更好地化合物。
[Abstract]:N-methyl-D-aspartic acid receptor (NMDAR) antagonists are used to treat pain in patients and to relieve cancer pain. Recently, it has been reported that NMDAR signaling pathway can promote the ability of tumor growth and invasion. Aim: to analyze the structure-activity relationship of NMDAR antagonist and optimize its compound structure by using 3D-QSAR modeling method. Methods: the Co MFA and Co MSIA models were established by using the three-dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) module of Sybyl-X2.1. Results: the optimal evaluation parameters of the 3D-QSAR model based on the common skeleton superposition method are as follows: Co MFA:Q~2=0.691,R~2=0.995,F=511.269,SEE=0.083; Co MSIA:Q~2=0.715,R~2=0.998,F=1396.317,SEE=0.051, (Q2 is cross validation coefficient, RN 2 is non cross validation coefficient). Conclusion: the model has good predictive ability and can guide the design and modification of tetrahydroquinoline NMDAR antagonists and obtain more active compounds.
【作者單位】： 重慶理工大學(xué)藥學(xué)與生物工程學(xué)院;重慶大學(xué)生物工程學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31170747,81171508) 重慶市自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(CSTC2013JJB10004) 重慶理工大學(xué)研究生創(chuàng)新基金項(xiàng)目(YCX2013221)
【分類號(hào)】：O626.323;R91

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本文編號(hào)：2415420