【摘要】：分子相似性是虛擬篩選技術(shù)的重要環(huán)節(jié),在計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)中有著關(guān)鍵作用。在2D Fingerprint相似性判別過(guò)程中,一些典型的分子相似性評(píng)估過(guò)程使用了Hash函數(shù)進(jìn)行分子指紋映射,然而Hash函數(shù)固有的沖突問(wèn)題極易降低分子指紋的映射精度。提出了一種基于計(jì)數(shù)型布隆過(guò)濾器的指紋映射方法,對(duì)相似性判別過(guò)程進(jìn)行了有效改進(jìn),并采用DUD LIB VS 1.0數(shù)據(jù)集對(duì)改進(jìn)方法進(jìn)行了比較驗(yàn)證,將ROCE,AUC,awROCE,awAUC值作為評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)。與其他原始分子相似性方法相比,所提方法有效地提高了相似性判斷的準(zhǔn)確性和骨架躍遷能力。
[Abstract]:Molecular similarity is an important part of virtual screening technology and plays a key role in computer aided drug design. In the process of 2D Fingerprint similarity discrimination, some typical molecular similarity evaluation processes use Hash function to map the molecular fingerprint. However, the inherent conflict problem of Hash function can easily reduce the mapping accuracy of the molecular fingerprint. A fingerprint mapping method based on counting Bron filter is proposed. The similarity discriminating process is improved effectively. The improved method is compared with DUD LIB VS 1.0 data set, and ROCE,AUC,awROCE, is compared. The awAUC value was used as the evaluation standard. Compared with other primitive molecular similarity methods, the proposed method can effectively improve the accuracy of similarity judgment and the ability of skeleton transition.
【作者單位】： 寧夏大學(xué)信息工程學(xué)院;中國(guó)人民武裝警察部隊(duì)工程大學(xué);
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(71561023) 寧夏高等學(xué)校科學(xué)研究(NGY2015035) 國(guó)家社科基金(15GJ003-290) 寧夏大學(xué)創(chuàng)新項(xiàng)目基金(GIP201626)資助
【分類號(hào)】：R91;TP391.7

【相似文獻(xiàn)】

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3 薛夢(mèng)竹;劉曉峰;李洪林;;新型3D分子相似性計(jì)算程序SHAFTS的開(kāi)發(fā)及應(yīng)用[A];2011年全國(guó)藥物化學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議——藥物的源頭創(chuàng)新論文摘要集[C];2011年

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1 任偉;生物相關(guān)性的表征及其在藥物發(fā)現(xiàn)中的初步應(yīng)用研究[D];山東理工大學(xué);2009年

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本文編號(hào)：2315016