發(fā)布時(shí)間：2018-07-24 19:36

【摘要】：聚酮類化合物(polyketide,PK)和非核糖多肽(nonribosonmal peptide,NRP)是兩大類重要的微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物,其生物合成需要聚酮合成酶(polyketide synthases,PKSs)和非核糖體多肽合成酶(non-ribosomal peptide synthetases,NRPSs)。隨著測(cè)序技術(shù)和生物信息分析手段的快速發(fā)展,PKS/NRPS基因簇及其合成產(chǎn)物的信息飛速增長(zhǎng)。整合資源,創(chuàng)建PKS/NRPS數(shù)據(jù)庫(kù),以方便科學(xué)家進(jìn)行序列分析,產(chǎn)物結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),以及實(shí)現(xiàn)分子改造合成新型化合物等的研究。筆者主要介紹近5年開發(fā)的與PKS/NRPS相關(guān)的重要的數(shù)據(jù)庫(kù),包括PKMiner,NRPSsp,Na PDo S,Cluster Mine360和IMG-ABC,為相關(guān)領(lǐng)域的研究人員提供參考。
[Abstract]:Polyketenoids (PK) and nonribosonmal peptides (NRP) are two important secondary metabolites of microorganisms. Their biosynthesis requires polyketide synthase (polyketide synthase) and non-ribosomal polypeptide synthetase (non-ribosomal peptide synthetic polypeptide synthetase). With the rapid development of sequencing technology and biological information analysis, the information of PKS / NRPS gene cluster and its synthesis products is increasing rapidly. Resources are integrated and PKS/NRPS database is created to facilitate the study of sequence analysis, prediction of product structure, and the realization of molecular transformation and synthesis of new compounds. This paper mainly introduces the important databases related to PKS/NRPS developed in the past five years, including PKMinern NRPSspPKS/NRPS Na PDo Scluster Mine360 and IMG-ABC, which provide reference for researchers in related fields.
【作者單位】： 浙江工業(yè)大學(xué)藥學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(30973681) 浙江省博士后擇優(yōu)資助項(xiàng)目(BSH1502144) 浙江工業(yè)大學(xué)自然科學(xué)研究基金資助項(xiàng)目(2014XY017);浙江工業(yè)大學(xué)藥學(xué)院華海創(chuàng)新計(jì)劃SIPH;浙江工業(yè)大學(xué)運(yùn)河杯大學(xué)生課外學(xué)術(shù)科技基金資助項(xiàng)目(2015YH0528)
【分類號(hào)】：TP311.13;R915

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本文編號(hào)：2142441