類黃酮抑制P糖蛋白的三維定量構(gòu)效關(guān)系與作用模式
本文選題:類黃酮 + P糖蛋白; 參考:《高等學(xué);瘜W(xué)學(xué)報(bào)》2017年01期
【摘要】:采用基于R基團(tuán)搜索技術(shù)的Topomer CoMFA建立了30個(gè)類黃酮類P糖蛋白抑制劑的三維定量構(gòu)效關(guān)系(3D-QSAR)模型,并用包括9個(gè)樣本的測(cè)試集驗(yàn)證模型的外部預(yù)測(cè)能力.所得模型的擬合、交互驗(yàn)證以及外部驗(yàn)證的復(fù)相關(guān)系數(shù)分別為r~2=0.971,q~2=0.728和r~2_(pred)=0.816.在此基礎(chǔ)上,運(yùn)用Surflex-dock分子對(duì)接法研究了白楊素及其異戊烯化衍生物與P糖蛋白的作用模式.結(jié)果表明,異戊烯化修飾可顯著提高類黃酮的親脂性,修飾產(chǎn)物能更好地與P糖蛋白的疏水性口袋契合,二者結(jié)合程度高.
[Abstract]:The 3D quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) model of 30 flavonoid P-glycoprotein inhibitors (3D-QSAR) was established by using Topomer CoMFA based on R group search technique. The external predictive ability of the model was verified with a test set of 9 samples. The complex correlation coefficients of the model for fitting, cross validation and external validation are 0.971QK20.728 and 0.8160.28, respectively, and the correlation coefficients of the two models are 0. 728 and 0. 816, respectively. On the basis of this, the interaction pattern of Albus and its isopentenated derivatives with P glycoprotein was studied by Surflex-dock molecular docking method. The results showed that isopentenated modification could significantly improve the lipophilicity of flavonoids, and the modified product could better fit with the hydrophobic pocket of P glycoprotein, and the binding degree of the two products was high.
【作者單位】: 河南科技學(xué)院食品學(xué)院;重慶大學(xué)生物工程學(xué)院生物流變科學(xué)與技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(批準(zhǔn)號(hào):31571782,21166024) 河南省高校科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(批準(zhǔn)號(hào):16IRTSTHN007) 河南省高?萍紕(chuàng)新人才項(xiàng)目(批準(zhǔn)號(hào):14HASTIT019) 河南省基礎(chǔ)與前沿技術(shù)研究計(jì)劃項(xiàng)目(批準(zhǔn)號(hào):162300410177)資助~~
【分類號(hào)】:R96
【相似文獻(xiàn)】
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