多肽序列優(yōu)化降低c-Src蛋白靶向藥物的毒性風(fēng)險(xiǎn)
本文選題:c-Src蛋白 + SH結(jié)構(gòu)域; 參考:《重慶大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年03期
【摘要】:避免c-Src蛋白的多肽類拮抗劑與多個(gè)蛋白發(fā)生混雜性結(jié)合,對于降低抗癌藥物的毒性風(fēng)險(xiǎn)具有重要作用。本研究運(yùn)用生物信息學(xué)方法對氨基酸序列進(jìn)行優(yōu)化設(shè)計(jì),旨在減少混雜性結(jié)合的發(fā)生。本研究綜合利用各種多肽數(shù)據(jù)庫和生物信息學(xué)工具,首先總結(jié)了多肽分子與多個(gè)蛋白SH3結(jié)構(gòu)域之間潛在的混雜性結(jié)合,并發(fā)現(xiàn)了其中的內(nèi)在規(guī)律。隨后,根據(jù)所發(fā)現(xiàn)的規(guī)律,對多肽的氨基酸序列進(jìn)行針對性的優(yōu)化設(shè)計(jì)。結(jié)果表明,大多數(shù)多肽在經(jīng)過優(yōu)化后,所結(jié)合的c-Src以外的蛋白數(shù)量都有所下降,從而顯著提高了多肽與c-Src蛋白之間結(jié)合的特異性(P0.05),并降低了其潛在的毒性風(fēng)險(xiǎn)。本研究所取得的結(jié)果將為設(shè)計(jì)具有高度特異性和低毒性的靶向性多肽藥物提供參考。
[Abstract]:To avoid the hybrid binding of c-Src protein antagonists with multiple proteins, it is important to reduce the risk of toxicity of anticancer drugs. The aim of this study was to reduce the occurrence of hybrid binding by using bioinformatics to optimize the design of amino acid sequences. In this study, using various polypeptide databases and bioinformatics tools, we first summarized the potential hybrid binding between polypeptide molecules and multiple protein SH3 domains, and found the inherent law. Then, the amino acid sequence of polypeptide was optimized according to the law found. The results showed that the number of proteins other than c-Src was decreased after the optimization of most peptides, which significantly increased the specificity of binding between the peptides and c-Src protein (P0.05), and reduced its potential toxicity risk. The results of this study will provide a reference for the design of targeted polypeptide drugs with high specificity and low toxicity.
【作者單位】: 重慶第二師范學(xué)院生物與化學(xué)工程系;重慶第二師范學(xué)院人事處;
【基金】:重慶市科委前沿與應(yīng)用基礎(chǔ)研究計(jì)劃項(xiàng)目(cstc2014jcyjA10104) 重慶第二師范學(xué)院校級科研創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(KYC-cxtd03-2017004) 第二批重慶市高等學(xué)校青年骨干教師資助計(jì)劃~~
【分類號】:R96
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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,本文編號:2057792
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