本文選題：HIV-蛋白酶 + 溶解相互作用能方法��； 參考：《原子與分子物理學(xué)報(bào)》2017年01期

【摘要】：HIV-1蛋白酶PR(HIV-1 protease)的變異對(duì)抑制劑產(chǎn)生抗藥性,嚴(yán)重消弱抗艾滋病的治療效果.I50V變異是HIV-1蛋白酶殘基變異中最重要的一個(gè).采用分子動(dòng)力學(xué)模擬和溶解相互作用能方法SIE(solvated interaction energy)研究I50V變異對(duì)抑制劑APV(amprenavir)抗藥機(jī)制.分子動(dòng)力學(xué)分析表明I50V變異誘導(dǎo)HIV-1蛋白酶整體柔性的增加,影響了抑制劑與蛋白酶的相互作用.結(jié)合自由能計(jì)算表明范德華作用的下降驅(qū)動(dòng)了I50V變異對(duì)APV的抗藥性.基于殘基的能量分解證明V50/V50'與APV的相互作用相對(duì)于野生型的I50/I50'明顯減弱,誘導(dǎo)了抗藥性.本研究能為高效的緩解抗藥性抑制劑的研發(fā)提供一定的理論指導(dǎo).
[Abstract]:The mutation of HIV-1 protease PR(HIV-1 is one of the most important mutations of HIV-1 protease residues. Molecular dynamics simulation and SIE(solvated interaction energy method were used to study the resistance mechanism of I50V mutation to APV amprenavirl. Molecular dynamics analysis showed that I50V variation induced the increase of overall flexibility of HIV-1 protease and affected the interaction between inhibitor and protease. The combined free energy calculation showed that the decrease of van der Waals effect drove the resistance of I50V mutation to APV. The energy decomposition based on residue showed that the interaction between V50 / V50 'and APV was weaker than that of wild type I50', which induced drug resistance. This study can provide some theoretical guidance for the research and development of high-efficiency drug-resistant inhibitors.
【作者單位】： 山東交通學(xué)院理學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(11504206,11274206) 山東省高等學(xué)校科技計(jì)劃項(xiàng)目(J14LJ07)
【分類號(hào)】：R96

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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7 陸中s，

本文編號(hào)：1880406