本文選題：細(xì)菌耐藥性 + 抗菌肽�。� 參考：《中國(guó)抗生素雜志》2017年05期

【摘要】：目的建立細(xì)菌素?cái)?shù)據(jù)庫(kù),并對(duì)已知的細(xì)菌素信息進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)和分析,可為新型細(xì)菌素的設(shè)計(jì)和研發(fā)提供幫助。方法檢索大型蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù),收集文獻(xiàn)中報(bào)道的細(xì)菌素;使用My SQL、Perl、php My Admin、Apache、File Zilla、HTML和PHP等軟件和語(yǔ)言進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站的建立。結(jié)果收集到了407條細(xì)菌素,包括43個(gè)PDB結(jié)構(gòu)和2105條活性數(shù)據(jù),對(duì)細(xì)菌素序列信息、結(jié)構(gòu)信息、修飾信息、來(lái)源信息、分類信息、活性信息和物化信息進(jìn)行了詳細(xì)描述,建立了免費(fèi)的AMPs from bacterial數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站(網(wǎng)址:http://bacteriocins.cpu-bioinfor.org/),提供了搜索(search)、瀏覽(browse)和相似性比對(duì)(blast)等功能。結(jié)論本研究建立的細(xì)菌素?cái)?shù)據(jù)庫(kù)收集了較全面的信息,對(duì)于新型細(xì)菌素的研發(fā)可起到促進(jìn)作用。
[Abstract]:Objective to establish the database of bacteriocin and analyze the known information of bacteriocin, which can be helpful for the design and development of new bacteriocin. Methods A large protein database was searched and the bacteriocins reported in the literature were collected. Results 407 bacteriocins were collected, including 43 PDB structures and 2105 active data. The sequence information, structural information, modification information, source information, classification information, activity information and physicochemical information of bacteriocin were described in detail. A free AMPs from bacterial database (+ http.cpu-bioinfor.org / r.org.or.org.or.org. com) has been set up to provide search, browse browseand similarity comparison for blast.org. Conclusion the database of bacteriocin collected comprehensive information, which can promote the development of new bacteriocin.
【作者單位】： 中國(guó)藥科大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;南京外國(guó)語(yǔ)學(xué)校;
【基金】：國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃資助項(xiàng)目(863計(jì)劃)(No.2012AA020304) 江蘇高校優(yōu)勢(shì)學(xué)科建設(shè)工程資助項(xiàng)目(PAPD)
【分類號(hào)】：R915;TP311.13

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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本文編號(hào)：1815668