環(huán)丙沙星對(duì)腸致病性大腸埃希菌轉(zhuǎn)錄譜基因表達(dá)的影響
本文選題:腸致病性大腸埃希菌 + 環(huán)丙沙星; 參考:《中國(guó)病原生物學(xué)雜志》2015年02期
【摘要】:目的探討不同濃度環(huán)丙沙星對(duì)腸致病性大腸埃希菌轉(zhuǎn)錄基因表達(dá)的影響。方法在腸致病性大腸埃希菌對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期加入不同濃度環(huán)丙沙星(高濃度組4μg/ml,低濃度組2μg/ml),對(duì)照組加入生理鹽水,分別于0、45、90、135和180min時(shí)收集菌液,提取細(xì)菌總RNA,使用表達(dá)譜芯片檢測(cè)環(huán)丙沙星作用后腸致病性大腸埃希菌在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的基因變化,分析各時(shí)間點(diǎn)大腸埃希菌轉(zhuǎn)錄水平差異;篩選差異基因,采用熒光定量PCR驗(yàn)證差異基因表達(dá)。結(jié)果與生理鹽水組比較,4μg/ml環(huán)丙沙星組大腸埃希菌共有1 724個(gè)基因轉(zhuǎn)錄上調(diào),1 806個(gè)基因轉(zhuǎn)錄下調(diào),2μg/ml組中共有988個(gè)基因轉(zhuǎn)錄上調(diào),2 297個(gè)基因轉(zhuǎn)錄下調(diào)。在表達(dá)差異的基因中,以編碼假設(shè)合成蛋白及轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白基因數(shù)最多。兩組中有共性的基因?yàn)?1個(gè),這些基因在不同濃度及所有的5個(gè)時(shí)間點(diǎn)均下調(diào)表達(dá),表達(dá)的基因包括編碼ABC轉(zhuǎn)運(yùn)膜蛋白基因和菌毛蛋白基因。在2μg/ml與4μg/ml組的對(duì)比中,未觀察到環(huán)丙沙星影響腸致病性大腸埃希菌致病島毒力基因的表達(dá)差異(P0.05)。差異表達(dá)的基因通過(guò)熒光定量PCR檢測(cè)均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(分別與生理鹽水組比較,P0.05)。結(jié)論不同濃度環(huán)丙沙星體外對(duì)腸致病性大腸埃希菌毒力基因轉(zhuǎn)錄的影響無(wú)顯著性差別,但對(duì)耐藥相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄具有顯著影響,這些影響是否與對(duì)腸致病性大腸埃希菌對(duì)環(huán)丙沙星耐藥有關(guān)仍需進(jìn)一步研究。
[Abstract]:Objective to investigate the effects of ciprofloxacin (ciprofloxacin) at different concentrations on the expression of transcriptional genes in enteropathogenic Escherichia coli. Methods different concentrations of ciprofloxacin (4 渭 g / ml in high concentration group, 2 渭 g / ml in low concentration group and normal saline in control group) were added to the logarithmic growth phase of Escherichia coli. The bacterial total RNAs were extracted, and the gene changes in the transcriptional process of Escherichia coli after ciprofloxacin treatment were detected by using the expression microarray, and the transcription level of Escherichia coli was analyzed at different time points, and the differentially expressed genes were screened. The differentially expressed genes were verified by fluorescence quantitative PCR. Results compared with saline group, 1 724 genes of Escherichia coli in 4 渭 g/ml ciprofloxacin group were up-regulated and 1 806 genes were down-regulated. In 2 渭 g/ml group, 988 genes were up-regulated and 2 297 genes were down-regulated. Among the differentially expressed genes, the number of genes encoding hypothetical synthetic protein and transcriptional regulatory protein was the highest. There were 21 common genes in the two groups. These genes were down-regulated at different concentrations and at all 5 time points. The expressed genes included the ABC transporter membrane protein gene and the fimbrial protein gene. In the comparison of 2 渭 g/ml and 4 渭 g/ml groups, there was no significant difference in the expression of virulence gene between ciprofloxacin and 4 渭 g/ml in pathogenic Escherichia coli. The differentially expressed genes were detected by fluorescence quantitative PCR. Conclusion the effects of ciprofloxacin at different concentrations on virulence gene transcription of Enteropathogenic Escherichia coli were not significantly different in vitro, but had significant effects on drug resistance related gene transcription. Whether these effects are related to the resistance of Escherichia coli to ciprofloxacin needs further study.
【作者單位】: 廣東醫(yī)學(xué)院附屬深圳市南山區(qū)人民醫(yī)院感染科 深圳市內(nèi)源性感染診治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81170370/H0312) 深圳市科創(chuàng)委項(xiàng)目(No.JCYJ20130402151227180) 深圳市衛(wèi)人委項(xiàng)目(No.201203203,201203211,201302199,201303186,201401083,201401084,201402130,201402131,201402133) 深圳市醫(yī)學(xué)重點(diǎn)學(xué)科經(jīng)費(fèi)資助項(xiàng)目
【分類(lèi)號(hào)】:R96
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1803128
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