發(fā)布時(shí)間：2018-03-23 18:46

  本文選題：雙特異性蛋白磷酸酶　切入點(diǎn)：Cdc磷酸酯酶　出處：《山東醫(yī)藥》2015年23期

【摘要】：目的觀察羥基苯甲腈類抑制劑與Cdc25B磷酸酯酶相互作用的結(jié)合位點(diǎn)殘基。方法利用分子動(dòng)力學(xué)模擬的方法觀察羥基苯甲腈類抑制劑A8H、3M8與Cdc25B磷酸酯酶之間的氫鍵作用和相互作用能,確定羥基苯甲腈類抑制劑與Cdc25B磷酸酯酶相互作用的結(jié)合位點(diǎn)殘基。結(jié)果 A8H與Cdc25B結(jié)合位點(diǎn)殘基Y382、D397、K399、R485、R488、R492形成氫鍵的概率分別為0、2.00%、0.40%、0.60%、0、0,而3M8與Cdc25B結(jié)合位點(diǎn)殘基Y382、D397、K399、R485、R488、R492形成氫鍵的概率分別為11.38%、12.97%、0.80%、4.19%、94.41%、97.21%。D397、L398、C484、R485、R488、M505與A8H形成了較強(qiáng)相互作用(相互作用能數(shù)值分別為-2.40、-2.50、-2.30、-3.20、-4.00、-1.80 kcal/mol),Y382、D397、L398、C484、R485、R488、R492、M505與3M8形成了較強(qiáng)相互作用(相互作用能數(shù)值分別為-1.90、-5.30、-3.40、-1.00、-5.10、-19.40、-21.60、-1.50 kcal/mol)。結(jié)論羥基苯甲腈類抑制劑與Cdc25B磷酸酯酶的結(jié)合位點(diǎn)殘基為Y382、D397、L398、C484、R485、R488、R492、M505。
[Abstract]:Objective to observe the binding site residues of hydroxybenzonitrile inhibitors interacting with Cdc25B phosphatase. Methods the hydrogen bond and interaction energy between hydroxybenzonitrile inhibitors A8Hn3M8 and Cdc25B phosphatase were observed by molecular dynamics simulation. The binding site residues of hydroxybenzonitrile inhibitors interacting with Cdc25B phosphatase were determined. Results the probability of forming hydrogen bond between A8H and Cdc25B binding site Y382D397N K399N R485N R488N R492 was 0.400.600.The hydrogen bond between 3M8 and Cdc25B binding site Y382D397K399N R485R488R492 was obtained. The rates were 11.3812.970.800.197.21. D397L398C488R485R488M505 formed a stronger interaction with A8H (the interaction energy values were -2.40-2.30-2.30-3.20- 4.00-1.80 kcalmol / r = 3.382D397N / L 398R484R488R492M505) and 3M8 (the interaction energy values were -1.90um -5.30- -3.40-1.00-1.40-1.60-1.60-1.50kmol / mol = 1.80 kcalmol / r = 1.80 kcalmol / r = 1.382D397N / L 398C484R484R488R492M505 and 3M8 respectively. Conclusion the interaction energy is -1.90nil -5.30- 1.40-1.60-1.50kmol / mol = 1.50kmol / L = 1.80kcalmol / r = 1.80 kcalmol / r = 1.382D397N / L 398R484R488R492M505 / R488R492M505 / R488R492M505 / R488R492M505 / R488R492M505, respectively. The binding site residue is Y382D397L398C484C485C488R488C492M505.
【作者單位】： 天津醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院;
【分類號(hào)】：R96

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本文編號(hào)：1654721