本文選題：乙肝病毒　切入點(diǎn)：抑制劑　出處：《山東大學(xué)》2017年博士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：乙肝是由乙型肝炎病毒(HBV)所致的重大傳染性疾病,長(zhǎng)期發(fā)展可導(dǎo)致急慢性病毒性肝炎、肝硬化(livercirrhosis,LC)、肝代謝失常和肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)等疾病。據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)報(bào)道,全球大約有2.4億人為慢性HBV感染者,每年約有68.6萬(wàn)人死于HBV感染所致的急、慢性肝炎及相關(guān)并發(fā)癥。我國(guó)約有9000萬(wàn)HBV攜帶者,平均每年約28萬(wàn)人因感染乙肝病毒而死亡,嚴(yán)重影響我國(guó)人民身體健康和社會(huì)發(fā)展,研究有效防治HBV的藥物已成為我國(guó)藥物研發(fā)的當(dāng)務(wù)之急。HBV屬嗜肝DNA病毒科(hepadnaviridae),基因組為部分雙鏈環(huán)狀DNA,其復(fù)制過(guò)程主要包括:靶細(xì)胞的吸附、融合、脫殼、DNA的修補(bǔ)、轉(zhuǎn)錄、翻譯、逆轉(zhuǎn)錄和DNA的復(fù)制、病毒顆粒的組裝和出芽等過(guò)程�；趯�(duì)HBV生命周期的認(rèn)識(shí)和分子生物學(xué)的研究,目前用于預(yù)防和治療慢性乙型肝炎(CHB)的藥物主要有疫苗、干擾素、免疫調(diào)節(jié)藥以及DNA聚合酶抑制劑。其中HBV疫苗只能預(yù)防而不能治療HBV的感染;α干擾素(IFN-α)雖然具有免疫調(diào)節(jié)和抗病毒的雙重作用,但其只對(duì)30%～40%的患者有效,且不良反應(yīng)多,限制了它的臨床應(yīng)用;α1-胸腺肽(thymosin-α1,Tα1)等免疫調(diào)節(jié)藥可以提高人體對(duì)HBV的特異性免疫,但是缺乏針對(duì)性,一般作為輔助用藥或與其他HBV藥物聯(lián)合治療;靶向于HBVDNA聚合酶的核苷(酸)類抑制劑,因其對(duì)HBV顯著的抑制作用以及臨床上良好的耐受性而被廣泛應(yīng)用。然而,由于HBV基因組的遺傳異質(zhì)性,病毒極易對(duì)該類藥物產(chǎn)生耐藥性,且不能夠根治。因此,研究開發(fā)高效、低毒和抗耐藥的新型HBV抑制劑依然是當(dāng)前抗乙肝藥物研發(fā)的熱點(diǎn)。核心蛋白是HBV核殼體組成的主要結(jié)構(gòu)蛋白,在病毒進(jìn)化過(guò)程中相對(duì)保守,并且核心蛋白的組裝在乙肝病毒生命周期中發(fā)揮著重要的作用。本論文第二章以核衣殼蛋白裝配抑制劑AT-130及臨床藥物異噻氟啶(NZ-4)為先導(dǎo)化合物,基于骨架躍遷、電子等排和藥效團(tuán)雜合的原理設(shè)計(jì)合成了吡唑類、噻唑類、吡嗪類、嘧啶類和吡啶類共8個(gè)小系列的雜環(huán)化合物。其中,Series Ⅰ系列將噻唑環(huán)通過(guò)電子等排替換為吡唑環(huán),同時(shí)在1位選擇優(yōu)勢(shì)基團(tuán)噻唑環(huán),重點(diǎn)探討了 4位取代基對(duì)抗病毒活性的影響;SeriesⅡ系列將噻唑環(huán)通過(guò)電子等排替換為吡唑環(huán),同時(shí)探討1位取代對(duì)抗病毒活性的影響,另外,討論將1位噻唑環(huán)替換為3-氟苯環(huán)后對(duì)活性的影響;Series Ⅲ系列將噻唑環(huán)通過(guò)電子等排替換為吡唑環(huán),并重點(diǎn)探討3位取代基對(duì)抗病毒活性的影響;Series ⅣV系列依然采用并二噻唑優(yōu)勢(shì)骨架,對(duì)4位進(jìn)行修飾,以期得到高效低毒的先導(dǎo)化合物;Series V-VⅦ系列將噻唑環(huán)分別換成吡嗪、嘧啶和吡啶等六元環(huán),增加結(jié)構(gòu)的多樣性,同時(shí)初步探討六元環(huán)骨架對(duì)活性的影響,為進(jìn)一步優(yōu)化奠定基礎(chǔ);SeriesⅧ系列仍然采用噻唑環(huán),但是取代基的位置發(fā)生了變化,對(duì)2位和5位取代基進(jìn)行了多樣性修飾,探討將氫鍵受體N和S置換后對(duì)活性的影響。體外細(xì)胞活性篩選結(jié)果顯示,噻唑環(huán)骨架優(yōu)于吡唑類,優(yōu)于嘧啶、吡嗪和吡啶骨架;化合物ⅣV-8c表現(xiàn)了最好的抑制HBVDNA復(fù)制活性,其IC50為2.2±1.1 μM,優(yōu)于先導(dǎo)化合物ⅣV-8a(NZ-4, 2.3±0.5μM);化合物Ⅰ-8g抑制HBVDNA復(fù)制活性的IC50為3.8±0.3μM,與先導(dǎo)化合物活性相當(dāng),但是其抑制HBVDNA復(fù)制的選擇性系數(shù)大于26.3,優(yōu)于先導(dǎo)化合物的選擇性系數(shù)(SI=25.7),可以作為先導(dǎo)化合物進(jìn)一步修飾。表面等離子共振實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了該類化合物的作用靶點(diǎn)為HBV核心蛋白,且化合物Ⅰ-8g和ⅢV-8c與核心蛋白的親和力常數(shù)分別為60.8μ 和60.0 μM,與先導(dǎo)化合物NZ-4 (KD=50.6μM)相當(dāng),其結(jié)果與細(xì)胞活性基本一致,可以作為先導(dǎo)化合物供進(jìn)一步研究。本論文第三章基于文獻(xiàn)報(bào)道的二氫嘧啶類HBV抑制劑的構(gòu)效關(guān)系、CoMFA和CoMSIA的等勢(shì)圖以及核心蛋白與配體的晶體復(fù)合物結(jié)構(gòu),設(shè)計(jì)合成了一類新穎的二氫嘧啶-三氮唑化合物。其中,將嗎啉環(huán)替換為三氮唑基團(tuán)提高其代謝穩(wěn)定性;通過(guò)連接一些親水基團(tuán)與周圍氨基酸殘基Ser121形成氫鍵,較大的疏水基團(tuán)可與氨基酸殘基Pro138形成疏水作用力,增強(qiáng)其抗病毒活性;R基團(tuán)為2-氨基苯目標(biāo)化合物與先導(dǎo)化合物GLS4能夠較好的疊合;2'-氟-4'-溴取代的苯環(huán)位于 Pro25、Asp29、Leu30、Thr33、Trp102、Ile105 和 Ser106 殘基形成的疏水口袋,溴原子朝向蛋白且伸入疏水口袋內(nèi),氟原子與相鄰蛋白的VaI124殘基作用;噻唑基團(tuán)位于Trp102、Phe23、Phe122和Tyr118殘基形成的疏水口袋,氮原子與Leu140通過(guò)水橋形成氫鍵作用;酯基位于氨基酸殘基Thr109、Phe110、Thr33和Leu37形成的腔穴頂端�；钚越Y(jié)果表明,微小的取代基的改變可能會(huì)造成活性的顯著變化,甚至消失;R基團(tuán)中,鄰位為極性基團(tuán)有利于抑制HBVDNA復(fù)制活性;但是,R基團(tuán)指向溶劑開口區(qū),取代基的大小對(duì)活性影響很大,較大體積的酰胺和磺酰胺取代基導(dǎo)致活性的喪失。篩選的多個(gè)化合物都具有較好的抗病毒活性,其中,化合物X-5a的細(xì)胞毒性比先導(dǎo)化合物小,且其抑制HBVDNA復(fù)制的活性(IC50為0.35±0.04μM)優(yōu)于上市藥物拉米夫定(0.54±0.18μM);另外,其抑制HBVDNA復(fù)制的選擇性系數(shù)(SI)優(yōu)于或相當(dāng)于先導(dǎo)化合物GLS4和上市藥物拉米夫定,可以作為先導(dǎo)化合物進(jìn)一步修飾。本論文第四章以噻唑尼特和天然產(chǎn)物修飾得到的高活性2-吡啶酮類衍生物為先導(dǎo)化合物,基于藥效團(tuán)模型,通過(guò)電子等排和分子雜合原理設(shè)計(jì)合成了一系列新穎的3-芳基-5-酰胺取代2-吡啶酮類化合物,以期提高其水溶性和抗病毒活性。其中,2-吡啶酮骨架中引入NH基團(tuán)提高其親水性;同時(shí),將右翼的C-C鍵替換C-N鍵,在左翼引入酰胺基團(tuán)提高其抗病毒活性及其水溶性。細(xì)胞水平的抗病毒活性結(jié)果顯示,多個(gè)化合物表現(xiàn)了較好的抑制HBVDNA復(fù)制活性,其中化合物XⅫ-5u表現(xiàn)了最好的抑制HBVDNA復(fù)制活性,其IC50為4.5±2.3μM,與先導(dǎo)化合物XⅪ-6活性相當(dāng),稍弱于上市藥物拉米夫定,且具有一定的抑制HBeAg分泌活性(IC50= 9.8 ±2.8 μM)。另外,通過(guò)HPLC方法測(cè)定了化合物XⅫ-5u的水溶性,在純水和pH=7.4的PBS緩沖液中溶解度分別為13.26μg/mL和28.68μg/mL,提高了一定的水溶性,驗(yàn)證了實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思想,可作為先導(dǎo)化合物進(jìn)一步修飾。本論文第五章通過(guò)對(duì)核苷(酸)類似物與HBV逆轉(zhuǎn)錄酶作用機(jī)制、構(gòu)效關(guān)系以及抗耐藥性策略的充分理解和認(rèn)識(shí),以上市藥物替比夫定為先導(dǎo),構(gòu)建以新型苯并噻二嗪為堿基核苷酸類的HBV逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑。其中,堿基部分采用苯并噻二嗪雜環(huán),由于堿基的羰基被具有更強(qiáng)吸電子能力的砜基取代,可增強(qiáng)其鄰位NH在氫鍵形成中的供氫能力,同時(shí)本身作為氫鍵受體,可增強(qiáng)抑制劑與天然堿基之間氫鍵的結(jié)合能力,提高其在病毒DNA合成中的摻入率;核糖部分采用臨床藥物中活性較好的優(yōu)勢(shì)開環(huán)核糖,以提高其抗耐藥性并降低藥物毒副作用;同時(shí)對(duì)核糖部分以各種磷酸酯修飾,提高其抗病毒活性,并改善其藥動(dòng)學(xué)性質(zhì),提高生物利用度。細(xì)胞水平的抗病毒活性結(jié)果顯示,在50 μ濃度下,化合物ⅩⅣ-5、ⅩⅣ-7a和ⅩⅣ-7c表現(xiàn)了一定的抑制HBVDNA復(fù)制活性,其抑制率分別為68.3%、64.1%和57.6%,弱低于上市藥物拉米夫定(88.9%)。創(chuàng)新性總結(jié):本論文基于骨架躍遷、電子等排、藥效團(tuán)雜合、前藥和靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)的合理藥物設(shè)計(jì)等原理設(shè)計(jì)合成了吡唑類、噻唑類、吡嗉類、嘧啶類、吡啶類、吡啶酮類、苯并唾二嗪類和二氫嘧啶類等共8類HBV抑制劑,其中,吡唑環(huán)、吡嗪環(huán)、嘧啶環(huán)、吡啶環(huán)和苯并噻二嗪環(huán)為全新骨架HBV抑制劑�；谀繕�(biāo)化合物的結(jié)構(gòu),通過(guò)文獻(xiàn)調(diào)研和逆向合成分析設(shè)計(jì)了合理可行的合成路線,共設(shè)計(jì)合成了 14條合成路線,50個(gè)中間體和112個(gè)目標(biāo)化合物,其中,超過(guò)130個(gè)化合物未見文獻(xiàn)報(bào)道。對(duì)所合成的108個(gè)目標(biāo)化合物進(jìn)行了活性研究。通過(guò)CCK-8法測(cè)定了化合物的細(xì)胞毒性,通過(guò)PCR法測(cè)定了化合物抑制HBVDNA復(fù)制活性,通過(guò)酶聯(lián)免疫法測(cè)定了目標(biāo)化合物對(duì)HBsAg和HBeAg抗原的分泌抑制活性,通過(guò)表面等離子共振實(shí)驗(yàn)測(cè)定了目標(biāo)化合物與核心蛋白的親和力。其中,化合物Ⅳ-8c表現(xiàn)了較好的抑制HBVDNA復(fù)制活性,其IC50為2.2±1.1μM,優(yōu)于先導(dǎo)化合物Ⅳ-8a (NZ-4, 2.3±0.5μM);化合物X-5a的細(xì)胞毒性比先導(dǎo)化合物小,且其抑制HBVDNA復(fù)制的活性(IC50為0.35±0.04 μM)優(yōu)于上市藥物拉米夫定(0.54±0.18 μM);化合物 Ⅻ-5u 抑制 HBV DNA 復(fù)制的 IC50 為 4.5±2.3 μM,與先導(dǎo)化合物活性相當(dāng),且水溶性有一定的提高,為抗HBV藥物研發(fā)提供了有價(jià)值的信息。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：山東大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：R914;R96

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1578011