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分子模擬和化學(xué)計量學(xué)相結(jié)合研究藥物配體與其受體之間的相互作用

發(fā)布時間:2017-11-22 11:10

  本文關(guān)鍵詞:分子模擬和化學(xué)計量學(xué)相結(jié)合研究藥物配體與其受體之間的相互作用


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【摘要】:本文通過分子對接法和定量構(gòu)效關(guān)系法(QSAR)研究了兩類化合物(孕激素類化合物與肉桂酰胺類化合物)與相應(yīng)受體蛋白(PR、HDAC1)之間的相互作用機(jī)制,為兩類藥物的進(jìn)一步研究分析提供理論指導(dǎo)。本論文主要針對以下四個方面進(jìn)行闡述:第一章,簡要介紹了分子對接法和定量構(gòu)效關(guān)系法的原理和方法,并介紹了文中涉及到的幾款常用軟件。最后對孕激素類衍生物和肉桂酰胺類化合物的研究進(jìn)展進(jìn)行了簡要闡述。第二章,將孕激素類衍生物與PR受體進(jìn)行對接及QSAR分析,兩者的結(jié)果顯示結(jié)合的作用力主要是氫鍵和范德華力;而孕激素類衍生物與SHBG受體之間的對接結(jié)果以及QSAR研究同樣顯示,氫鍵和范德華作用是兩者的主要影響因素。利用QSAR方法建立孕激素類衍生物-PR/SHBG的最優(yōu)模型中的R值分別為0.95,0.92,通過對兩者結(jié)果的綜合分析,發(fā)現(xiàn)范德華作用、氫鍵作用、靜電作用對孕激素類化合物與PR/SHBG的影響作用存在細(xì)微差異,這些差異可以為該類化合物的進(jìn)一步研究提供理論指導(dǎo)。第三章,利用同源建模的方法構(gòu)建了HDAC1蛋白,并將構(gòu)建的受體蛋白與肉桂酰胺類化合物進(jìn)行對接和QSAR分析,其中最優(yōu)模型的R值為0.88,對接結(jié)果及QSAR結(jié)果共同顯示結(jié)合的作用力主要是范德華力;通過建立的QSAR對9個新設(shè)計的化合物的活性值進(jìn)行預(yù)測,得出預(yù)測活值性較好的化合物結(jié)構(gòu),從而對肉桂酰胺類化合物的進(jìn)一步研究提供理論指導(dǎo)。第四章,對本論文進(jìn)行總結(jié),并展望未來可以進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)方向。
【學(xué)位授予單位】:浙江工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R917

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本文編號:1214485

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