海南東寨港紅樹林植物內(nèi)生放線菌藥用資源勘探
本文關鍵詞:海南東寨港紅樹林植物內(nèi)生放線菌藥用資源勘探
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【摘要】:[目的]勘探海南東寨港真紅樹植物內(nèi)生放線菌多樣性,為發(fā)現(xiàn)放線菌新物種和新抗生素奠定基礎。[方法]樣品經(jīng)表面消毒后粉碎,用10種不同培養(yǎng)基分離放線菌;通過PCR擴增、測定并比對16S rRNA基因序列,開展放線菌多樣性分析;通過發(fā)酵、萃取等處理方法得到四類樣品,包括發(fā)酵原液、乙酸乙酯提取液及水層和菌體的丙酮浸泡提取液;采用紙片擴散法對樣品進行抗菌活性篩選;基于PCR的基因篩選技術探測活性菌株可能存在的NRPS、PKSI、PKSⅡ抗生素生物合成基因。[結果]經(jīng)形態(tài)特征排重,從14種真紅樹植物樣品中共得到放線菌146株,16S rRNA基因序列比對表明它們分布于13個科18個屬,其中鏈霉菌屬為優(yōu)勢菌屬,菌株S3Cf-2 和 S3Af-1 的 16S rRNA基因序列分別與有效發(fā)表菌株Couchioplanes caeruleusDSM44103T (X93202)和Microlunatus terrae BS6T(JF806519)的相似率最高,分別為97.45%和97.43%。菌株S3Af-1已由本課題組庹利博士完成多相分類工作,證實菌株為丙酸桿菌科小月菌屬的新種,命名為Microlunatus endophyticus,并撰文發(fā)表在IJSEM (International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology)。菌株S3Cf-2相關多相分類學研究工作已由本實驗室劉少偉博士完成,文章正在撰寫中。對其中46株放線菌發(fā)酵樣品的抗菌活性檢測表明,40株具有抗菌活性,總陽性率為86.96%。其中菌株S3Cf-2對金黃色葡萄球菌有很強的抑菌活性,對糞腸球菌也有較強抑菌活性;菌株S3Af-1對金黃色葡萄球菌有一定抑菌活性;钚跃曛,38株菌存在至少一種所探測的生物合成基因簇,陽性率為95%,其中14株同時具有所探測的3種抗生素生物合成基因簇。[結論]海南東寨港真紅樹植物中存在多樣性豐富的藥用放線菌資源,具有從中發(fā)現(xiàn)放線菌新物種及新抗生素的潛力。
【學位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R915
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,本文編號:1166372
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