本文關(guān)鍵詞：一個(gè)常染色體顯性非綜合征型耳聾家系的遺傳學(xué)特征分析及致病基因的初步探索

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【摘要】：研究背景：聽(tīng)力障礙是最常見(jiàn)的一種感覺(jué)缺陷性疾病,全世界范圍內(nèi)估計(jì)有2.78億人承受著這種疾病的痛苦,約每500個(gè)新生兒就有1個(gè)為耳聾患兒,兒童聽(tīng)覺(jué)系統(tǒng)疾患嚴(yán)重影響了兒童的成長(zhǎng)、教育、社會(huì)活動(dòng)以及個(gè)體的生活質(zhì)量。隨著現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的進(jìn)步和發(fā)展,環(huán)境因素致聾比例逐漸降低,現(xiàn)聽(tīng)力障礙人群中近60%被認(rèn)為是遺傳性因素所導(dǎo)致,鑒定所有的耳聾致病基因?qū)θ祟?lèi)遺傳學(xué)來(lái)說(shuō)是一項(xiàng)艱辛而富有挑戰(zhàn)性的工作。 遺傳性耳聾中近70%是非綜合征型耳聾(nonsydromic hearing loss, NSHL),其中50%被認(rèn)為是單基因遺傳病,NSHL中近80%是常染色體隱性遺傳,約20%為常染色體顯性遺傳,X染色體連鎖遺傳和線粒體遺傳占1%～3%。目前共定位143個(gè)非綜合征型耳聾基因座位。已報(bào)道的NSHL致病基因的定位克隆主要是依據(jù)家系研究,所以對(duì)臨床耳聾家系的收集、保存和分析對(duì)遺傳性耳聾基因研究非常關(guān)鍵。 目的：對(duì)收集到的一個(gè)常染色體顯性非綜合征耳聾家系的聽(tīng)力學(xué)和遺傳學(xué)特征進(jìn)行分析,并對(duì)其致病基因進(jìn)行探索。 方法：通過(guò)家系調(diào)查,對(duì)家系成員進(jìn)行聽(tīng)力學(xué)檢測(cè)和全身體格檢查,采集、保存血液樣本,繪制家系圖譜,整理、分析家系的聽(tīng)力學(xué)和遺傳學(xué)特征；提取外周血DNA,對(duì)已知常見(jiàn)6個(gè)耳聾基因GJB2、 GJB3、COCH、EYA4、PDS以及線粒體基因進(jìn)行篩查；應(yīng)用新一代全外顯子組測(cè)序技術(shù)對(duì)該家系致病基因進(jìn)行探索。 結(jié)果：收集到一個(gè)連續(xù)5代遺傳的湖南籍耳聾家系,該家系由53名成員組成,現(xiàn)存家系成員42人,其中確診患者11人(7男4女),其中年齡最大者78歲,最小者27歲,共收集血液樣本14份。家系患者的聽(tīng)力均表現(xiàn)為語(yǔ)后、對(duì)稱(chēng)性感音神經(jīng)性耳聾,12～36歲之間發(fā)病,起初為高頻聽(tīng)力下降,隨著年齡的增長(zhǎng),聽(tīng)力損失呈進(jìn)行加重,累及中-低頻聽(tīng)力,45～50歲之后表現(xiàn)為極重度耳聾,聽(tīng)力曲線為陡降型或島狀型。該家系連續(xù)四代成員中均出現(xiàn)耳聾患者,耳聾表型代代相傳,呈連續(xù)遺傳現(xiàn)象；每一代家系成員中男女均可患病,且機(jī)率均等,無(wú)明確遺傳早先現(xiàn)象。篩查6個(gè)常見(jiàn)耳聾基因的全部57個(gè)外顯子以及線粒體基因全序列,共發(fā)現(xiàn)42個(gè)已報(bào)道的多態(tài),1個(gè)COCH基因的非高度保守區(qū)的堿基變異,排除常見(jiàn)已知耳聾基因致病的可能。對(duì)家系兩名患者和一個(gè)正常人進(jìn)行全外顯子組測(cè)序,篩選出344個(gè)突變候選基因,結(jié)合家系遺傳方式、基因功能分析,其中10個(gè)候選基因突變致病機(jī)率較高,比對(duì)已克隆的91個(gè)非綜合征型耳聾基因無(wú)重疊。 結(jié)論：1.收集了一個(gè)常染色體顯性非綜合征型遺傳性耳聾家系,表現(xiàn)為語(yǔ)后、對(duì)稱(chēng)性、遲發(fā)性、進(jìn)行性、高頻下降為主的表型特征。2.通過(guò)人群常見(jiàn)耳聾致病基因GJB2、GJB3、COCH、EYA4、PDS及線粒體基因直接測(cè)序篩查和驗(yàn)證,初步排除這幾個(gè)已知基因致聾的可能性。3.通過(guò)對(duì)三名家系成員進(jìn)行全基因組外顯子測(cè)序,預(yù)測(cè)到10個(gè)候選致病基因。
【關(guān)鍵詞】：常染色體顯性遺傳 遺傳性耳聾 外顯子測(cè)序 基因突變
【學(xué)位授予單位】：中南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類(lèi)號(hào)】：R764.43
【目錄】：

• 中文摘要5-7
• ABSTRACT7-12
• 英文~.略詞表12-13
• 前言13-15
• 第一部分 遺傳性高頻聽(tīng)力損失耳聾家系資料收集及臨床遺傳學(xué)特征分析15-24
• 1.1 材料及方法15-17
• 1.1.1 家系資料的采集15
• 1.1.2 病史資料采集15-16
• 1.1.3 全身及專(zhuān)科體格檢查16
• 1.1.4 聽(tīng)力學(xué)檢測(cè)及評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)16-17
• 1.1.5 耳聾家系遺傳方式分析17
• 1.2 結(jié)果17-21
• 1.2.1 耳聾家系的基本資料17-18
• 1.2.2 家系耳聾患者臨床表型特征及評(píng)估18-21
• 1.2.3 家系的系譜圖分析及遺傳學(xué)評(píng)估21
• 1.3 討論21-24
• 第二部分 遺傳性高頻聽(tīng)力損失耳聾家系候選基因篩查24-36
• 2.1 研究對(duì)象24
• 2.2 實(shí)驗(yàn)材料24-26
• 2.2.1. 實(shí)驗(yàn)試劑24-25
• 2.2.2. 實(shí)驗(yàn)儀器25-26
• 2.3 研究方法26-29
• 2.3.1 樣本DNA提取及模板處理26-27
• 2.3.2 PCR-Sanger測(cè)序27-29
• 2.4 結(jié)果29-33
• 2.5 討論33-36
• 第三部分 應(yīng)用新一代全外顯子組測(cè)序技術(shù)對(duì)遺傳性耳聾家系致病基因的初步探索36-45
• 3.1 研究對(duì)象36-37
• 3.2 研究方法和流程37-40
• 3.2.1 樣品檢測(cè)37
• 2.2.2 建庫(kù)捕獲37-38
• 3.2.3 上機(jī)測(cè)序38-39
• 3.2.4 原始數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換及生物信息分析策略39
• 3.2.5 測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出和生物學(xué)功能費(fèi)分析39
• 3.2.6 突變位點(diǎn)篩選方法39
• 3.2.7 候選基因分析和功能注釋39-40
• 3.3 結(jié)果40-43
• 3.3.1 WES測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估40
• 3.3.2 測(cè)序深度、覆蓋度統(tǒng)計(jì)40
• 3.3.3 SNP檢測(cè)結(jié)果40-41
• 3.3.4 InDel檢測(cè)結(jié)果41-42
• 3.2.5 突變位點(diǎn)數(shù)目42-43
• 3.4 討論43-45
• 結(jié)論45-46
• 參考文獻(xiàn)46-53
• 綜述53-62
• 參考文獻(xiàn)59-62
• 附錄62-65
• 致謝65

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 朱玉華;孫藝;李建忠;金占國(guó);程靜;盧宇;韓冰;戴樸;袁慧軍;翟所強(qiáng);;常染色體顯性遺傳非綜合征型耳聾家系聽(tīng)力學(xué)及遺傳學(xué)特征分析[J];中華耳科學(xué)雜志;2010年01期

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本文編號(hào)：555090