本文關鍵詞：一個非綜合征型視網膜色素變性家系致病基因的鑒定，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：視網膜色素變性(Retinitis Pigmentosa, RP)是一類最常見的遺傳性視網膜營養(yǎng)不良癥,由視網膜感光細胞(包括視桿細胞和視錐細胞)或色素上皮細胞進行性退化而導致視力進行性損失,中國人群的發(fā)病率可達1/1000。其發(fā)病機制很復雜,涉及多種不同的生物代謝途徑。RP臨床上主要分為綜合征型及非綜合征型兩類,其中非綜合征型視網膜色素變性(Nonsyndromic retinitis pigmentosa, NSRP)占65%,其散發(fā)比例高達42%。RP遺傳方式異常復雜,除了具有典型的孟德爾遺傳方式外,還存在一些罕見的非典型遺傳模式。此外,RP具有高度的臨床異質性與遺傳異質性,目前至少存在65個致病基因,但仍有約40%的RP患者致病原因未知。 目的：對我室至今遺傳診斷未明確的一個NSRP家系進行遺傳學分析,以明確其致病原因及發(fā)病機制,并對家系的患者及其他成員提供遺傳咨詢及生育指導,防止出生缺陷。 方法： 1、在我室前期遺傳學分析的基礎上,對該家系的1名患者進行進一步的目標基因篩查,選取近年來新發(fā)現的2個常染色體顯性RP致病基因：SNRNP200及KLHL7基因,對這2個基因的外顯子及其側翼序列進行PCR加Sanger測序分析； 2、對該家系的1名患者進行多重連接探針擴增技術(MLPA)分析,以明確RHO、RP1、IMPDH1、PRPF31、RP2及RPGR這些RP已知致病基因外顯子的大片段缺失或重復突變； 3、對該家系的2名患者進行外顯子組測序,并結合生物信息學分析以明確該RP家系潛在的致病原因。 結果： 1.Sanger測序分析發(fā)現該家系患者SNRNP200及KLHL7基因編碼區(qū)不存在微小致病突變； 2.MePA分析發(fā)現該家系患者不存在上述RP已知致病基因外顯子的大片段缺失或重復突變； 3、聯合外顯子組測序及生物信息學分析發(fā)現APoE基因存在c.784GA(p.Glu262Lys)及c.787GA(p.Glu263Lys)2個雜合突變,且這2個突變位于同一條染色體上,為APOE基因罕見突變體ApoE7-Suita.該突變體在該家系中與疾病表型共分離,且在200個正常對照中未被發(fā)現。此外,還發(fā)現該家系所有患者均存在PDE6B基因c.2030CA雜合突變,但該突變在家系內與疾病表型不共分離。 結論： 1、本研究通過Sanger測序排除了該家系存在SNRNP200及KLHL7基因編碼區(qū)的微小致病突變,以及通過MLPA分析排除了存在RHO、RP1、IMPDH1、PRPF31、RPGR及RP2基因外顯子的大片段缺失與重復突變。 2、本研究聯合外顯子組測序及生物信息學分析,首次發(fā)現1個APOE基因罕見突變體與RP疾病表型共分離,推測APOE基因突變可能與RP的發(fā)病相關。 3、本研究發(fā)現該家系患者均攜帶已知隱性RP致病基因PDE6B基因c.2030CA雜合突變,不排除該基因與APOE基因共同作用導致RP的可能。
【關鍵詞】：非綜合征型視網膜色素變性 Sanger測序 MLPA 外顯子組測序 APOE基因
【學位授予單位】：中南大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2014
【分類號】：R774.1
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-10
• 主要實驗儀器、試劑與耗材10-13
• 英文縮略詞簡表13-14
• 前言14-17
• 一、研究對象17-20
• 1.1 家系資料17
• 1.2 眼科檢查結果17-20
• 二、遺傳學分析策略20-21
• 三、研究方法21-40
• 3.1 外周血gDNA提取21-22
• 3.2 NSRP相關基因的測序分析22-25
• 3.3 NSRP相關基因的MLPA分析25-28
• 3.4 NSRP外顯子組測序分析28-40
• 四、實驗結果40-54
• 4.1 NSRP相關基因測序分析的結果40
• 4.2 MLPA分析的結果40-42
• 4.3 外顯子組測序分析的結果42-54
• 五、討論54-60
• 5.1 外顯子組測序在RP遺傳診斷中的應用54-55
• 5.2 APOE基因與RP的相關性55-57
• 5.3 RP與非典型孟德爾遺傳現象57-58
• 5.4 外顯子組測序鑒定的共分離基因與連鎖分析定位區(qū)間之間誤差的分析58-59
• 5.5 本研究有待進一步探索的內容59-60
• 六、結論60-61
• 參考文獻61-65
• 綜述65-88
• 參考文獻79-88
• 個人簡歷88-89
• 致謝89

  本文關鍵詞：一個非綜合征型視網膜色素變性家系致病基因的鑒定，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號：329725