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實時熒光PCR檢測真菌性角膜炎常見致病菌種方法的建立

發(fā)布時間:2017-04-25 00:18

  本文關(guān)鍵詞:實時熒光PCR檢測真菌性角膜炎常見致病菌種方法的建立,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:實時熒光PCR檢測真菌性角膜炎常見致病菌種方法的建立 目的:真菌性角膜炎是一種由致病真菌引發(fā)的致盲率很高的眼科常見的角膜感染性疾病,在我國,鐮刀菌是真菌性角膜炎最常見致病菌,其中又以茄病鐮刀菌、尖孢鐮刀菌、串珠鐮刀菌為著,本研究旨在建立真菌性角膜炎常見致病菌中茄病鐮刀菌、尖孢鐮刀菌、串珠鐮刀菌的實時熒光PCR檢測方法。 方法:通過檢索GenBank真菌的COI基因序列,首次設(shè)計茄病鐮刀菌、尖孢鐮刀菌、串珠鐮刀菌的種特異性引物,對模板DNA進行倍比稀釋,確定反應(yīng)的靈敏度;使用青霉、煙曲霉、白色念珠菌等真菌進行實時熒光PCR,觀察設(shè)計引物的特異性。優(yōu)化實驗反應(yīng)條件,建立了SYBR Green Ⅰ實時熒光PCR對鐮刀菌快速檢測的方法。 結(jié)果:所設(shè)計引物特異性強、敏感性高,可對茄病鐮刀菌、尖孢鐮刀菌及串珠鐮刀菌的靶DNA進行定量分析,該檢測方法的靈敏度達1pg級。引物特異性檢測實驗結(jié)果表明,只有與引物對應(yīng)的目的菌種DNA發(fā)生擴增,,產(chǎn)生特異的單峰熔解曲線,其它種屬真菌均未發(fā)生擴增,表明設(shè)計的引物具有良好的種特異性 結(jié)論:研究中建立的實時熒光PCR方法能特異、靈敏的檢測出臨床真菌性角膜炎中三種最常見鐮刀菌的感染,為臨床鐮刀菌感染的診斷提供了一種快速、準確的方法。
【關(guān)鍵詞】:實時熒光PCR 真菌性角膜炎 鐮刀菌 COI基因
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R772.21
【目錄】:
  • 中文摘要4-5
  • Abstract5-9
  • 第一章 前言9-13
  • 第二章 材料與方法13-21
  • 2.1 材料13-16
  • 2.1.1 實驗菌株13
  • 2.1.2 主要試劑13-14
  • 2.1.3 試劑配制14-15
  • 2.1.4 主要儀器設(shè)備15-16
  • 2.2 方法16-21
  • 2.2.1 種特異性引物的設(shè)計16
  • 2.2.2 菌株分離培養(yǎng)、活化16
  • 2.2.3 實驗菌株 DNA 的提取16-17
  • 2.2.4 COI 基因種特異性引物 PCR 反應(yīng)條件優(yōu)化17-18
  • 2.2.5 COI 基因種特異性引物 PCR 反應(yīng)擴增18
  • 2.2.6 瓊脂糖凝膠電泳18-19
  • 2.2.7 實時熒光 PCR 反應(yīng)體系及反應(yīng)條件19
  • 2.2.8 實時熒光 PCR 反應(yīng)標(biāo)準曲線的繪制及確定檢測的靈敏度19-20
  • 2.2.9 實時熒光 PCR 特異性驗證20-21
  • 第三章 結(jié)果21-30
  • 3.1 菌種鑒定21-22
  • 3.2 COI 基因種特異性引物 PCR 反應(yīng)條件優(yōu)化22-24
  • 3.3 COI 基因種特異性引物的 PCR 擴增24
  • 3.4 實時熒光 PCR 反應(yīng)標(biāo)準曲線的繪制及確定檢測的靈敏度24-26
  • 3.5 實時熒光 PCR 檢測的的特異性26-30
  • 第四章 討論30-36
  • 第五章 結(jié)論36-37
  • 參考文獻37-40
  • 綜述40-61
  • 參考文獻53-61
  • 作者簡介及在學(xué)期間所取得的科研成果61-62
  • 致謝62

【參考文獻】

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  本文關(guān)鍵詞:實時熒光PCR檢測真菌性角膜炎常見致病菌種方法的建立,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:325263

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