實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)真菌性角膜炎常見(jiàn)致病菌種方法的建立
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【摘要】:實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)真菌性角膜炎常見(jiàn)致病菌種方法的建立 目的:真菌性角膜炎是一種由致病真菌引發(fā)的致盲率很高的眼科常見(jiàn)的角膜感染性疾病,在我國(guó),鐮刀菌是真菌性角膜炎最常見(jiàn)致病菌,其中又以茄病鐮刀菌、尖孢鐮刀菌、串珠鐮刀菌為著,本研究旨在建立真菌性角膜炎常見(jiàn)致病菌中茄病鐮刀菌、尖孢鐮刀菌、串珠鐮刀菌的實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)方法。 方法:通過(guò)檢索GenBank真菌的COI基因序列,首次設(shè)計(jì)茄病鐮刀菌、尖孢鐮刀菌、串珠鐮刀菌的種特異性引物,對(duì)模板DNA進(jìn)行倍比稀釋?zhuān)_定反應(yīng)的靈敏度;使用青霉、煙曲霉、白色念珠菌等真菌進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR,觀察設(shè)計(jì)引物的特異性。優(yōu)化實(shí)驗(yàn)反應(yīng)條件,建立了SYBR Green Ⅰ實(shí)時(shí)熒光PCR對(duì)鐮刀菌快速檢測(cè)的方法。 結(jié)果:所設(shè)計(jì)引物特異性強(qiáng)、敏感性高,可對(duì)茄病鐮刀菌、尖孢鐮刀菌及串珠鐮刀菌的靶DNA進(jìn)行定量分析,該檢測(cè)方法的靈敏度達(dá)1pg級(jí)。引物特異性檢測(cè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,只有與引物對(duì)應(yīng)的目的菌種DNA發(fā)生擴(kuò)增,,產(chǎn)生特異的單峰熔解曲線(xiàn),其它種屬真菌均未發(fā)生擴(kuò)增,表明設(shè)計(jì)的引物具有良好的種特異性 結(jié)論:研究中建立的實(shí)時(shí)熒光PCR方法能特異、靈敏的檢測(cè)出臨床真菌性角膜炎中三種最常見(jiàn)鐮刀菌的感染,為臨床鐮刀菌感染的診斷提供了一種快速、準(zhǔn)確的方法。
【關(guān)鍵詞】:實(shí)時(shí)熒光PCR 真菌性角膜炎 鐮刀菌 COI基因
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類(lèi)號(hào)】:R772.21
【目錄】:
- 中文摘要4-5
- Abstract5-9
- 第一章 前言9-13
- 第二章 材料與方法13-21
- 2.1 材料13-16
- 2.1.1 實(shí)驗(yàn)菌株13
- 2.1.2 主要試劑13-14
- 2.1.3 試劑配制14-15
- 2.1.4 主要儀器設(shè)備15-16
- 2.2 方法16-21
- 2.2.1 種特異性引物的設(shè)計(jì)16
- 2.2.2 菌株分離培養(yǎng)、活化16
- 2.2.3 實(shí)驗(yàn)菌株 DNA 的提取16-17
- 2.2.4 COI 基因種特異性引物 PCR 反應(yīng)條件優(yōu)化17-18
- 2.2.5 COI 基因種特異性引物 PCR 反應(yīng)擴(kuò)增18
- 2.2.6 瓊脂糖凝膠電泳18-19
- 2.2.7 實(shí)時(shí)熒光 PCR 反應(yīng)體系及反應(yīng)條件19
- 2.2.8 實(shí)時(shí)熒光 PCR 反應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)的繪制及確定檢測(cè)的靈敏度19-20
- 2.2.9 實(shí)時(shí)熒光 PCR 特異性驗(yàn)證20-21
- 第三章 結(jié)果21-30
- 3.1 菌種鑒定21-22
- 3.2 COI 基因種特異性引物 PCR 反應(yīng)條件優(yōu)化22-24
- 3.3 COI 基因種特異性引物的 PCR 擴(kuò)增24
- 3.4 實(shí)時(shí)熒光 PCR 反應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)的繪制及確定檢測(cè)的靈敏度24-26
- 3.5 實(shí)時(shí)熒光 PCR 檢測(cè)的的特異性26-30
- 第四章 討論30-36
- 第五章 結(jié)論36-37
- 參考文獻(xiàn)37-40
- 綜述40-61
- 參考文獻(xiàn)53-61
- 作者簡(jiǎn)介及在學(xué)期間所取得的科研成果61-62
- 致謝62
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):325263
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