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2012年大連市流行性角膜炎疫情的病原鑒定及人腺病毒56型基因特征分析

發(fā)布時(shí)間:2016-12-03 15:24

  本文關(guān)鍵詞:2012年大連市流行性角膜炎疫情的病原鑒定及人腺病毒56型基因特征分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


《大連醫(yī)科大學(xué)》 2014年

2012年大連市流行性角膜炎疫情的病原鑒定及人腺病毒56型基因特征分析

劉大鵬  

【摘要】:目的:確定2012年大連市流行性角結(jié)膜炎疫情的病原體,鑒定其型別;分析此次疫情病原體人腺病毒56型的主要結(jié)構(gòu)基因特征及重組情況,為今后新型重組D亞屬人腺病毒所致疾病的預(yù)防控制提供理論依據(jù)。 方法: 1.病原確定:采集2012年大連市流行性角結(jié)膜炎疫情的典型病例眼結(jié)膜拭子標(biāo)本30份,,采用熒光PCR方法分別以人腺病毒通用引物及腸道病毒通用引物進(jìn)行檢測(cè)確定病原,并對(duì)其特定片段測(cè)序進(jìn)行分子定型。 2.基因特征分析:對(duì)檢測(cè)結(jié)果為人腺病毒陽性標(biāo)本進(jìn)行病毒分離,針對(duì)其主要結(jié)構(gòu)基因六鄰體(Hexon)、五鄰體(Penton)及纖突(Fiber)基因進(jìn)行全長測(cè)序,與人腺病毒標(biāo)準(zhǔn)毒株進(jìn)行比對(duì)、系統(tǒng)進(jìn)化及重組分析。 結(jié)果: 1.共有21份標(biāo)本熒光PCR檢測(cè)結(jié)果為腺病毒陽性,核酸檢測(cè)陽性率為70.0%(21/30),Hexon基因L1片段核苷酸序列與人腺病毒15、29、56及其重組型高度同源,多重序列比對(duì)后構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹上與人腺病毒56(HAdV-D56)及其重組型位于同一分支。 2.針對(duì)其Hexon、Penton及Fiber基因的全長序列系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示,該毒株為人腺病毒56型,其Hexon基因序列與HAdV-D56標(biāo)準(zhǔn)毒株一致性為100%。Penton基因序列存在15個(gè)堿基位點(diǎn)突變,其中14個(gè)為同義突變,1個(gè)核苷酸突變引起氨基酸改變。Fiber基因序列存在1個(gè)堿基位點(diǎn)突變,引起氨基酸序列的改變。系統(tǒng)進(jìn)化及重組分析顯示該毒株P(guān)enton基因可能有HAdV-D39參與重組。 結(jié)論:此次流行性角結(jié)膜炎疫情為人腺病毒56型引起,國內(nèi)未見對(duì)該型病毒的正式報(bào)道,全球范圍內(nèi)未見由該型病毒引起的大規(guī)模流行性角結(jié)膜炎疫情的報(bào)道。其Penton、Fiber片段氨基酸位點(diǎn)改變是否導(dǎo)致毒株侵襲性增強(qiáng)而引起此次大規(guī)模疫情爆發(fā),有待進(jìn)一步研究論證。

【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:大連醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R777.31
【目錄】:

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):203406

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