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致擴張型心肌病LMNA突變的下游基因篩選與分析

發(fā)布時間:2024-04-28 02:12
  核纖層蛋白A(Lamin A)是核纖層的主要結(jié)構成分,位于核內(nèi)膜下方,主要起結(jié)構支架和支撐作用。編碼Lamin A的基因LMNA位于1號染色體,含12個外顯子,主要編碼蛋白Lamin A和Lamin C。LMNA基因的突變可導致多種疾病,主要影響橫紋肌組織、周圍神經(jīng)及脂肪組織,還有的突變同時影響幾種組織,引起嚴重的表型變化。LMNA突變引起的效應主要包括:細胞核結(jié)構的改變、相互作用蛋白的定位與表達錯誤、多種不同細胞信號通路的激活以及基因表達的改變等。目前,LMNA基因突變的致病機制尚未完全清楚,且不同突變的致病的分子機制并不完全相同。我們前期在伴房室傳導阻滯的擴心病家系中鑒定出一個新的LMNA基因突變,該突變位于9號內(nèi)含子末端,突變后基因缺失10號外顯子。為探究該突變引起的基因表達變化及致病機制,進行以下實驗:(1)HEK-293-TSA細胞在轉(zhuǎn)染LMNA野生及突變質(zhì)粒后,進行轉(zhuǎn)錄組測序;(2)分析差異性表達的基因,并在細胞水平進行驗證。轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果顯示,差異表達的基因為52個,其中上調(diào)6個,下調(diào)46個;其中,編碼蛋白的基因35個,上調(diào)2個,下調(diào)33個。依據(jù)差異倍數(shù)和顯著水平兩個參數(shù)...

【文章頁數(shù)】:63 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1.1LMNA基因編碼的四種A型核纖層蛋白(圖片來源:http://www.umd.be/LMNA/)

圖1.1LMNA基因編碼的四種A型核纖層蛋白(圖片來源:http://www.umd.be/LMNA/)

圖1.1LMNA基因編碼的四種A型核纖層蛋白(圖片來源:http://www.umd.be/LMNA/Figure1.1FourAtypeLaminsencodedbyLMNAgene.2核纖層蛋白結(jié)構核纖層蛋白在整個進化過程中高度保守,蛋白結(jié)構主要由3....


圖1.2核纖層蛋白的結(jié)構示意圖

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圖1.2核纖層蛋白的結(jié)構示意圖[9]Figure1.2ThestructureofLaminproteinsaminA(646aa)首先由基因LMNA翻譯為PrelaminA(664aa),然后工。(1)法尼基轉(zhuǎn)移酶在羧基末端CaaX盒中添加十五....


圖1.3LaminA的翻譯后加工過程

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圖1.2核纖層蛋白的結(jié)構示意圖[9]Figure1.2ThestructureofLaminproteins(646aa)首先由基因LMNA翻譯為PrelaminA(664aa),然1)法尼基轉(zhuǎn)移酶在羧基末端CaaX盒中添加十五碳的法尼基化盒進行....


圖3.1LMNA的RNA水平表達變化與差異表達基因的分析圖

圖3.1LMNA的RNA水平表達變化與差異表達基因的分析圖

圖3.1LMNA的RNA水平表達變化與差異表達基因的分析圖)對細胞轉(zhuǎn)染質(zhì)粒后的LMNA轉(zhuǎn)錄水平表達量,與對照組相比,野生和突變組的LMNA表300多倍(n=3,**=P<0.01,Mean±SD)。(B)樣本間基因差異性表達分析熱圖(n=1代表樣本,縱坐標代表基因聚類,顏....



本文編號:3966022

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