一個橋本氏甲狀腺炎家系的致病基因研究及SNP rs12532、rs870142與藏族先心病發(fā)病風險的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時間:2022-02-26 21:42
背景:橋本氏甲狀腺炎(HT)是一類復雜的自身免疫性甲狀腺疾病,其發(fā)病與環(huán)境暴露和特異性易感基因有關(guān)。該疾病中女性發(fā)病率高于男性。到目前為止,前期研究雖已闡明了一些易感位點,包括有PTPN22、FOXP3和CD25等,但該疾病的病因和發(fā)病機制仍未研究清楚。方法:我們收集到一個HT三代家系,其中有6名成員患病,均為女性。選取該家系中先證者及其3名患病親屬進行了全外顯子組測序(WES),根據(jù)已設(shè)計的嚴格標準對測序結(jié)果進行檢測和篩選,識別該家系致病基因突變。利用采集到的該家系中所有成員的外周血樣本進行Sanger測序,以驗證候選致病基因和突變,并通過在線網(wǎng)站對相關(guān)蛋白進行有害性分析。結(jié)果:經(jīng)過全外顯子組測序和生物信息分析,我們識別出一個PTPN22基因罕見錯義突變(NM015967.5;c.77A>G;p.Asn26Ser)。PTPN22 是該疾病的一個易感基因,與多種自身免疫性疾病的發(fā)生風險顯著相關(guān)。公共數(shù)據(jù)庫均顯示該錯義突變是極其罕見的。Sanger測序顯示該家族中所有女性患者均攜帶有該突變。保守性分析顯示該位點在蛋白中較為保守,并且突變導致該位點的氨基酸疏水性...
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學院北京市211工程院校985工程院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
主要英文縮略詞對照表
第一部分 一個橋本氏甲狀腺炎家系的致病基因研究
摘要
Abstract
一、前言
二、材料與方法
2.1 材料
2.2 實驗方法
三、實驗結(jié)果
3.1 家系描述及其臨床表現(xiàn)
3.2 外顯子組測序質(zhì)量
3.3 家系候選變異篩選
3.4 PTPN22罕見錯義突變
3.5 家系成員PTPN22突變驗證
3.6 有害性分析及其蛋白結(jié)構(gòu)
四、討論
五、小結(jié)
第二部分 單核苷酸多態(tài)性位點rs12532和rs870142與藏族人群先天性心臟病發(fā)病風險的關(guān)聯(lián)分析
摘要
Abstract
一、前言
二、材料與方法
2.1 材料
2.2 實驗方法
三、實驗結(jié)果
3.1 臨床特征
3.2 rs12532與CHD發(fā)病相關(guān)性的分析
3.3 rs870142與CHD發(fā)病相關(guān)性的分析
3.4 單體型分析
四、討論
五、小結(jié)
參考文獻
文獻綜述 先天性心臟病的遺傳學研究
參考文獻
致謝
研究生簡歷
【參考文獻】:
期刊論文
[1]高原眼病[J]. 律鵬,張文芳. 高原醫(yī)學雜志. 2004(02)
本文編號:3645029
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學院北京市211工程院校985工程院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
主要英文縮略詞對照表
第一部分 一個橋本氏甲狀腺炎家系的致病基因研究
摘要
Abstract
一、前言
二、材料與方法
2.1 材料
2.2 實驗方法
三、實驗結(jié)果
3.1 家系描述及其臨床表現(xiàn)
3.2 外顯子組測序質(zhì)量
3.3 家系候選變異篩選
3.4 PTPN22罕見錯義突變
3.5 家系成員PTPN22突變驗證
3.6 有害性分析及其蛋白結(jié)構(gòu)
四、討論
五、小結(jié)
第二部分 單核苷酸多態(tài)性位點rs12532和rs870142與藏族人群先天性心臟病發(fā)病風險的關(guān)聯(lián)分析
摘要
Abstract
一、前言
二、材料與方法
2.1 材料
2.2 實驗方法
三、實驗結(jié)果
3.1 臨床特征
3.2 rs12532與CHD發(fā)病相關(guān)性的分析
3.3 rs870142與CHD發(fā)病相關(guān)性的分析
3.4 單體型分析
四、討論
五、小結(jié)
參考文獻
文獻綜述 先天性心臟病的遺傳學研究
參考文獻
致謝
研究生簡歷
【參考文獻】:
期刊論文
[1]高原眼病[J]. 律鵬,張文芳. 高原醫(yī)學雜志. 2004(02)
本文編號:3645029
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