目的:構(gòu)建急性Stanford A型主動脈夾層升主動脈血管壁中膜組織中circRNA的差異表達(dá)譜,初步分析差異性表達(dá)的circRNAs參與急性Stanford A型主動脈夾層可能的分子發(fā)病機(jī)制。方法:收集2018年1月至2018年12月在深圳孫逸仙心血管醫(yī)院心外科行手術(shù)治療的急性Stanford A型主動脈夾層升主動脈血管壁中膜組織5例,同時(shí)收集行心臟移植手術(shù)的供體心臟升主動脈血管壁中膜組織或主動脈瓣置換術(shù)者升主動脈血管壁中膜組織5例。通過Agilent人類circRNA基因表達(dá)譜芯片篩選差異表達(dá)的circRNAs,利用KOBAS、Kegg等數(shù)據(jù)庫及miRanda、Cytoscape等軟件系統(tǒng)進(jìn)行相關(guān)生物信息學(xué)分析,探索急性Stanford A型主動脈夾層可能的信號通路及調(diào)控機(jī)制。結(jié)果:1、通過組間比對,急性Stanford A型主動脈夾層組與對照組存在588個(gè)差異表達(dá)的circRANs,差異表達(dá)上調(diào)的363個(gè),差異表達(dá)下調(diào)的225個(gè)。2、GO分析顯示急性Stanford A型主動脈夾層組差異表達(dá)的circRNAs涉及細(xì)胞組分31條,包括extracellular space,lami... 

【文章來源】：南華大學(xué)湖南省

【文章頁數(shù)】：79 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

所有10例組織樣本提取總RNA的掃描圖

圖 3.1 所有 10 例組織樣本提取總 RNA 的甲醛變性凝膠電泳圖3.2.3 基因芯片掃描圖本實(shí)驗(yàn)研究利用 Agilent 芯片掃描儀（G2565CA）對清洗后的芯片進(jìn)行掃描，得到 10 張掃描圖片（圖 3.2）。每個(gè)基因在圖片上顯示為一個(gè)光點(diǎn)，光點(diǎn)越亮則表示該基因的表達(dá)量越高。而后該掃描圖可經(jīng)軟件（本實(shí)驗(yàn)利用 Agilent GeneSpring 軟件）把圖中的每一光點(diǎn)及其亮度轉(zhuǎn)化為數(shù)值表達(dá)并輸出文本，以用于后續(xù)進(jìn)一步差異分析。

3.3 火山圖（Volcano Plot）直觀的顯示急性 Stanford A 型主動脈夾表達(dá)的 circRNAs：圖中水平灰線對應(yīng) p 值=0.5，兩條垂直灰線對應(yīng)差異倍數(shù)為 2。紅色圓調(diào)的 circRNAs，綠色圓點(diǎn)代表差異表達(dá)下調(diào)的 circRNAs，黑色圓點(diǎn)代表差異的 circRNAs。 差異表達(dá)的 circRNAs 的聚類分析層聚類分析是分析 circRNAs 表達(dá)數(shù)據(jù)運(yùn)用比較普遍的聚類分析ster3.0 軟件對差異表達(dá)的 circRNAs 數(shù)據(jù)進(jìn)行分層聚類分析并制 Stanford A 型主動脈夾層組與對照組升主動脈血管壁中As 表達(dá)水平的聚類分析結(jié)果圖，直觀的顯示了兩組組織樣本間RNAs，且圖中顯示超過一半差異表達(dá)的 circRNAs 在急性 Stanfo層組織中呈現(xiàn)高表達(dá)。圖中縱坐標(biāo)中每一刻度代表一個(gè) circRNA

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[4]炎癥、基質(zhì)金屬蛋白酶降解、氧化應(yīng)激在腹主動脈瘤發(fā)病機(jī)制中的研究進(jìn)展[J]. 李方達(dá),任華亮,鄭月宏.  血管與腔內(nèi)血管外科雜志. 2015(01)
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[9]應(yīng)用基因芯片初步分析主動脈夾層與正常主動脈微小RNA的差異表達(dá)[J]. 胡孜陽,羅建方,鐘詩龍,薛凌,陳逸飛,范瑞新.  中華心血管病雜志. 2012 (05)

博士論文
[1]Stanford A型主動脈夾層LncRNA/mRNA表達(dá)譜的研究與生物信息學(xué)分析[D]. 鄭佳予.復(fù)旦大學(xué) 2014

碩士論文
[1]Stanford A型急性主動脈夾層LncRNA/mRNA差異性表達(dá)分析[D]. 盧耀星.南華大學(xué) 2016



本文編號：3618709