研究背景慢性缺氧普遍存在于心臟的生理或病理狀態(tài),如胚胎發(fā)育、冠心病、紫紺型先天性心臟病和動脈粥樣硬化等。尤其對于紫紺型先天性心臟病患者,長期處于慢性缺氧和異常血循環(huán)的雙重負擔下,其手術風險增加,遠期生存率下降。然而,在臨床上發(fā)現(xiàn)許多這類輕-中度紫紺的患兒在較長的時間內(nèi)能順利存活,同時在接受心臟外科手術時能夠較好地耐受手術,且在圍手術期也少有進展到心衰,提示在長期患病的過程中心臟對慢性缺氧產(chǎn)生了一定程度的保護性適應。因此,深入研究心肌在慢性缺氧條件下的損傷與適應機制對于改善缺氧心肌保護的策略將大有裨益。許多研究圍繞這些機制進行了探討,其涉及到的基因數(shù)目眾多。為了能更加準確地找到相關基因,生物信息學和高通量測序技術的結合能提供強大的幫助。因此,對紫紺型先天性心臟病心肌標本的下一代測序（next-generation sequencing,NGS）數(shù)據(jù)進行生物信息學分析,可以為找到心肌組織中與缺氧高度相關的基因提供有力的線索。c-Jun為原癌基因JUN（Jun proto-oncogene,JUN）編碼的蛋白,是活化蛋白-1（activator protein-1,AP-1）的重要組成部分之... 

【文章來源】：中國人民解放軍陸軍軍醫(yī)大學重慶市

【文章頁數(shù)】：113 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

HISAT2-HTSeq-DESeq2分析流程

聚類分析 A.對 29 個初始樣本進行首次聚類分析；B.排除 5 個離散樣本后對其余 24 個進行再次聚類分析。Control 為健康心肌組，TOF 為法洛氏四聯(lián)癥組。2.2.4 差異分析利用 DESeq2 進行差異分析后，共篩選出 1260 個差異倍數(shù)>2 倍的基因。相較組織而言，TOF 心肌中上調(diào)基因 494 個，下調(diào)基因 766 個。利用 pheatmap 調(diào)前 25 個基因的熱圖，并用 ggplot2 繪制 1260 個 DEGs 的火山圖（圖 3，圖

前50個差異化表達基因熱圖*紅色：上調(diào)；綠色：下調(diào)

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Role of JNK activation in apoptosis:Adouble-edged sword[J]. Jing LIU, Anning LIN* Ben May Institute for Cancer Research, The University of Chicago, 5841 S. Maryland Avenue, MC 6027, Chicago, IL 60637, USA.  Cell Research. 2005(01)
[2]MAPK signal pathways in the regulation of cell proliferation in mammalian cells[J]. WEI ZHANG, Hui Tu LIU The Key Laboratory of Cell Proliferation and Regulation Biology of Ministry of Education, College of Life Sciences, Beijing Normal University, Beijing 100875, China.  Cell Research. 2002(01)



本文編號：3580395