Holt-Oram綜合征家系致病基因TBX5的新突變鑒定及功能研究
發(fā)布時間:2021-12-15 19:23
背景Holt-Oram綜合征,又稱心手綜合征,患者有先天性心臟病伴上肢畸形的臨床表現(xiàn)。該疾病屬于常染色體顯性遺傳病,具有完全外顯性,臨床表現(xiàn)包括先天性房間隔和室間隔缺失、心臟傳導功能障礙、上肢骨骼異常、拇指畸形;颊叩淖哟杏50%的可能性發(fā)生新生兒出生缺陷,嚴重者會導致胎兒死亡或夭折,給患者家庭造成極大負擔。研究發(fā)現(xiàn),TBX5基因突變是Holt-Oram綜合征的主要遺傳學因素,約70%的患者存在該基因異常。該基因位于12號染色體,轉(zhuǎn)錄后形成的TBX5蛋白是胚胎發(fā)育過程中調(diào)控心臟和上肢發(fā)育的重要轉(zhuǎn)錄因子。目前在TBX5基因編碼區(qū)、剪接區(qū)和調(diào)控區(qū)均發(fā)現(xiàn)了導致Holt-Oram綜合征的基因突變。另外,約30%該疾病患者病因尚不明確,可能存在其他影響心臟和上肢胚胎發(fā)育的調(diào)控元件。TBX5基因突變的異質(zhì)性和其與Holt-Oram綜合征的相關(guān)性提示,該基因在胚胎發(fā)育中具有重要調(diào)控作用和研究價值。目的鑒定Holt-Oram綜合征家系的致病基因和遺傳方式,為患者提供遺傳咨詢;鑒定TBX5基因新突變,豐富Holt-Oram綜合征基因突變異質(zhì)性研究,拓寬基因突變譜;針對TBX5基因新突變的功能研究,揭示...
【文章來源】:鄭州大學河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.1?T5X5?cDNA原質(zhì)粒圖譜及PCR引物結(jié)合區(qū)域??(A:?:T5Z5cDNA原質(zhì)粒圖譜;B和C:質(zhì)粒N端和C端PCR引物結(jié)合區(qū)域)??
?材料與方法???藍指示位置超過凝膠1/2時可結(jié)束電泳。??顯影:使用ChemiDoc?MP成像儀顯影,選擇Image?Lab程序并預熱,將加??樣孔朝上置于成像板內(nèi)并驅(qū)除接觸面的氣泡。顯影后根據(jù)Marker指示確定目標??條帶位置(約1.6?kb)并保存圖片,條帶位置見圖2.2。??Marker?wt?flag-TBX5??圖2.2?75X5基因擴增后的瓊脂糖凝膠電泳圖??e)膠回收得到純化的目的基因片段:??佩戴紫外線防護眼鏡,使用E-Gel?Safe?Imager透射儀直視下切割目的片段,??盡量靠近目的區(qū)域以減小切割體積,將切下的凝膠塊裝入1.5?ml離心管內(nèi)并稱??重。膠回收的純化過程均在室溫下進行,離心轉(zhuǎn)速>12000?g。??按照1:1的比例向凝膠內(nèi)加入Binding?Buffer,置于55°C金屬浴中孵育10??min使凝膠完全溶解;將溶解后的凝膠轉(zhuǎn)移至GeneJET純化柱內(nèi),離心1?min,??倒掉收集管內(nèi)的液體;向純化柱內(nèi)加入700ulWashBuffer?(已加入需要量的無水??乙醇),離心lmin,倒掉收集管內(nèi)的液體,再離心1mm以去除殘留的乙醇成分;??將純化柱轉(zhuǎn)移至干凈的1.5ml離心管內(nèi),向純化柱膜中央滴加20ul洗脫液,離??心lmm,離心管內(nèi)即得到純化的目的片段。測量濃度,并記錄。??③酶切目的基因和質(zhì)粒載體并純化回收:??連有Hag標簽的目的基因TAY5兩側(cè)有限制性核酸內(nèi)切酶BamHI和Pmel??序列,質(zhì)粒載體pCMV6的開放閱讀框兩側(cè)也含有BamHI和Pmel序列,雙酶切??可獲得BamHI酶切后的黏末端和Pmel酶切后的平末端。通過瓊脂糖凝膠電泳,??根據(jù)片段長度對
?材料與方法???a)目的基因和質(zhì)粒載體的酶切???試劑名稱????BamHI?酶?1?ul??Pmel?酶?1?ul??lOxNEBuffer?5?ul??目的基因/質(zhì)粒載體DNA?1?ug??去離子水?S?50?ul???按照上表配制50ul的酶切體系,注意酶最后加入并吹打混勻。置于37°C孵??育1?h,使酶充分發(fā)揮作用。??b)純化回收目的片段??將酶切后的反應體系進行瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果見圖2.3:連有Flag標簽的??目的基因片段大小約1.6?kb,質(zhì)粒載體酶切后獲得約4.8?kb大小的pCMV6??骨架和約1.6?kb大小的開放閱讀框區(qū)域。切膠回收目的基因的1.6?kb區(qū)域和質(zhì)??粒載體的4.8?kb區(qū)域。具體步驟同2.2.4-(1)-②-c).d).e)所述。??圓??圖2.3目的基因和質(zhì)粒載體pCMV6酶切后的瓊脂糖凝膠電泳圖??④連接目的基因和質(zhì)粒載體:??使用T4?DNA連接酶使質(zhì)粒載體和目的基因上經(jīng)過BamHI酶切形成的黏末??端互補配對結(jié)合并連接,同時Pmel酶切形成的平末端相連,形成閉合完整的環(huán)??狀質(zhì)粒結(jié)構(gòu)。???試劑名稱????T4?DNA?Ligase?1?ul??l〇xT4?DNA?Ligase?Buffer?2?ul??質(zhì)粒載體?DNA(4.8?kb)?60?ng?(0.032?pmol)??目的基因?DNA(1.6?kb)?60?ng?(0.096?pmol)??去離子水?至20ul???15??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]遺傳變異分類標準與指南[J]. 王秋菊,沈亦平,鄔玲仟,陳少科,陳子江,方向東,傅松濱,龔瑤琴,黃國英,黃國寧,黃荷鳳,黃山,郝曉柯,冀小平,李紅,梁波,廖燦,喬杰,蘇海翔,魏軍,王磊,王樹玉,王曉紅,邢清和,徐湘民,袁慧軍,楊正林,周從容,周文浩,曾勇,張學軍,黃濤生,鄭茜,秦勝營,于世輝,關(guān)靜,王洪陽,王大勇,趙立東,王慧君,孔令印,宣黎明,冒燕,祝軼君,徐君玲,王劍青,王莉,趙婷,秦一丁,夏瀅穎,樊麗霞,趙丁丁,邱浩,賀林. 中國科學:生命科學. 2017(06)
本文編號:3537006
【文章來源】:鄭州大學河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.1?T5X5?cDNA原質(zhì)粒圖譜及PCR引物結(jié)合區(qū)域??(A:?:T5Z5cDNA原質(zhì)粒圖譜;B和C:質(zhì)粒N端和C端PCR引物結(jié)合區(qū)域)??
?材料與方法???藍指示位置超過凝膠1/2時可結(jié)束電泳。??顯影:使用ChemiDoc?MP成像儀顯影,選擇Image?Lab程序并預熱,將加??樣孔朝上置于成像板內(nèi)并驅(qū)除接觸面的氣泡。顯影后根據(jù)Marker指示確定目標??條帶位置(約1.6?kb)并保存圖片,條帶位置見圖2.2。??Marker?wt?flag-TBX5??圖2.2?75X5基因擴增后的瓊脂糖凝膠電泳圖??e)膠回收得到純化的目的基因片段:??佩戴紫外線防護眼鏡,使用E-Gel?Safe?Imager透射儀直視下切割目的片段,??盡量靠近目的區(qū)域以減小切割體積,將切下的凝膠塊裝入1.5?ml離心管內(nèi)并稱??重。膠回收的純化過程均在室溫下進行,離心轉(zhuǎn)速>12000?g。??按照1:1的比例向凝膠內(nèi)加入Binding?Buffer,置于55°C金屬浴中孵育10??min使凝膠完全溶解;將溶解后的凝膠轉(zhuǎn)移至GeneJET純化柱內(nèi),離心1?min,??倒掉收集管內(nèi)的液體;向純化柱內(nèi)加入700ulWashBuffer?(已加入需要量的無水??乙醇),離心lmin,倒掉收集管內(nèi)的液體,再離心1mm以去除殘留的乙醇成分;??將純化柱轉(zhuǎn)移至干凈的1.5ml離心管內(nèi),向純化柱膜中央滴加20ul洗脫液,離??心lmm,離心管內(nèi)即得到純化的目的片段。測量濃度,并記錄。??③酶切目的基因和質(zhì)粒載體并純化回收:??連有Hag標簽的目的基因TAY5兩側(cè)有限制性核酸內(nèi)切酶BamHI和Pmel??序列,質(zhì)粒載體pCMV6的開放閱讀框兩側(cè)也含有BamHI和Pmel序列,雙酶切??可獲得BamHI酶切后的黏末端和Pmel酶切后的平末端。通過瓊脂糖凝膠電泳,??根據(jù)片段長度對
?材料與方法???a)目的基因和質(zhì)粒載體的酶切???試劑名稱????BamHI?酶?1?ul??Pmel?酶?1?ul??lOxNEBuffer?5?ul??目的基因/質(zhì)粒載體DNA?1?ug??去離子水?S?50?ul???按照上表配制50ul的酶切體系,注意酶最后加入并吹打混勻。置于37°C孵??育1?h,使酶充分發(fā)揮作用。??b)純化回收目的片段??將酶切后的反應體系進行瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果見圖2.3:連有Flag標簽的??目的基因片段大小約1.6?kb,質(zhì)粒載體酶切后獲得約4.8?kb大小的pCMV6??骨架和約1.6?kb大小的開放閱讀框區(qū)域。切膠回收目的基因的1.6?kb區(qū)域和質(zhì)??粒載體的4.8?kb區(qū)域。具體步驟同2.2.4-(1)-②-c).d).e)所述。??圓??圖2.3目的基因和質(zhì)粒載體pCMV6酶切后的瓊脂糖凝膠電泳圖??④連接目的基因和質(zhì)粒載體:??使用T4?DNA連接酶使質(zhì)粒載體和目的基因上經(jīng)過BamHI酶切形成的黏末??端互補配對結(jié)合并連接,同時Pmel酶切形成的平末端相連,形成閉合完整的環(huán)??狀質(zhì)粒結(jié)構(gòu)。???試劑名稱????T4?DNA?Ligase?1?ul??l〇xT4?DNA?Ligase?Buffer?2?ul??質(zhì)粒載體?DNA(4.8?kb)?60?ng?(0.032?pmol)??目的基因?DNA(1.6?kb)?60?ng?(0.096?pmol)??去離子水?至20ul???15??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]遺傳變異分類標準與指南[J]. 王秋菊,沈亦平,鄔玲仟,陳少科,陳子江,方向東,傅松濱,龔瑤琴,黃國英,黃國寧,黃荷鳳,黃山,郝曉柯,冀小平,李紅,梁波,廖燦,喬杰,蘇海翔,魏軍,王磊,王樹玉,王曉紅,邢清和,徐湘民,袁慧軍,楊正林,周從容,周文浩,曾勇,張學軍,黃濤生,鄭茜,秦勝營,于世輝,關(guān)靜,王洪陽,王大勇,趙立東,王慧君,孔令印,宣黎明,冒燕,祝軼君,徐君玲,王劍青,王莉,趙婷,秦一丁,夏瀅穎,樊麗霞,趙丁丁,邱浩,賀林. 中國科學:生命科學. 2017(06)
本文編號:3537006
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/xxg/3537006.html
最近更新
教材專著