背景和目的：CpG島甲基化表型（CpG island methylator phenotype, CIMP）是存在于多種腫瘤中的一種表觀遺傳學(xué)現(xiàn)象,參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展。異常DNA甲基化的明確可用于腫瘤的早期診斷、治療以及風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。本研究的目的是明確骨髓增生異常綜合征（myelodysplastic syndrome, MDS）的CIMP,為MDS的早期診斷和預(yù)后預(yù)測(cè)提供新的生物標(biāo)記物。方法：我們使用Illumina450k甲基化芯片和Agilent全基因組表達(dá)譜芯片進(jìn)行差異基因篩選,篩選出高甲基化低表達(dá)基因初步建立MDS的CIMP。通過(guò)甲基化特異性PCR （methylation-specific PCR, MSP）驗(yàn)證基因的甲基化、重硫酸鹽測(cè)序（bisulfite-sequencing PCR cloning and sequencing, BSP）驗(yàn)證MSP的準(zhǔn)確性和實(shí)時(shí)熒光定量PCR （real-time PCR, qRT-PCR）驗(yàn)證基因表達(dá)的方法在樣本病例組及對(duì)照組中對(duì)篩選出的基因進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證。然后通過(guò)診斷試驗(yàn)評(píng)價(jià)的方法評(píng)價(jià)高甲基化基因單獨(dú)或聯(lián)合診斷MDS的效能。并通過(guò)Ka... 

【文章來(lái)源】：復(fù)旦大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．表觀遺傳學(xué)機(jī)制??除外ＤＮＡ序列的變化外的染色體結(jié)構(gòu)的變異，從而調(diào)節(jié)基因組的作用，包括ＤＮＡ??

在ＤＮＡ甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下，將Ｓ－腺巧甲硫氨酸提供的甲基基團(tuán)（－Ｃ擬）??轉(zhuǎn)移到胞喀巧和鳥(niǎo)嘿嶺（ＣｐＧ）二核肯酸的胞喀館５位碳原子上形成５－甲基胞嗦??巧的過(guò)程（圖２）。ＤＮＡ甲基化在正常細(xì)胞中主要表現(xiàn)為腫瘤抑癌基因和組織特??異基因的低甲基化，轉(zhuǎn)錄因子、其他細(xì)胞類(lèi)型的組織特異基因１＾＞１及病毒ＤＮＡ的??高甲基化ｐｙ。在腫瘤中主要表現(xiàn)為，啟動(dòng)子區(qū)ＣｐＧ島的異常高甲基化和全基因??組范圍的低甲基化Ｐ６—２８１。ＤＮＡ的高甲基化可使腫瘤抑癌基因失活，ＤＮＡ的低甲??基化可使原癌基因激活，這兩種情況均可致使腫瘤的發(fā)生發(fā)展Ｐｓ’２９ｌ?（圖３）。研??究表明在血液系統(tǒng)惡性疾病及其他類(lèi)型的腫瘤中，啟動(dòng)子區(qū)ＣｐＧ島異常高甲基??６??

高甲基化ｐｙ。在腫瘤中主要表現(xiàn)為，啟動(dòng)子區(qū)ＣｐＧ島的異常高甲基化和全基因??組范圍的低甲基化Ｐ６—２８１。ＤＮＡ的高甲基化可使腫瘤抑癌基因失活，ＤＮＡ的低甲??基化可使原癌基因激活，這兩種情況均可致使腫瘤的發(fā)生發(fā)展Ｐｓ’２９ｌ?（圖３）。研??究表明在血液系統(tǒng)惡性疾病及其他類(lèi)型的腫瘤中，啟動(dòng)子區(qū)ＣｐＧ島異常高甲基??６??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]CpG island methylator phenotype in plasma is associated with hepatocellular carcinoma prognosis[J]. Ji-Bin Liu,Yi-Xin Zhang,Ke-Ping Chen,Institute of Life Sciences,Jiangsu University,Zhenjiang 212013,Jiangsu Province,ChinaJi-Bin Liu,Min-Xin Shi,Jin Cai,Yan Liu,Fu-Lin Qiang,Institute of Tumor,Nantong Tumor Hospital,Nantong 226361,Jiangsu Province,China Shu-Hui Zhou,Department of Radiology,School of Radiology and Public Health,Soochow University,Suzhou 215006,Jiangsu Province,China.  World Journal of Gastroenterology. 2011(42)



本文編號(hào)：3510186