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鹽酸異丙腎上腺素誘導的心肌肥大中環(huán)狀RNA的表達

發(fā)布時間:2021-11-18 21:18
  研究背景心肌肥大被認為是心臟對于各種生理性以及病理性刺激的一種適應性改變,其特征主要包括胚胎發(fā)育標志基因的重新激活、心肌細胞體積增大、蛋白質(zhì)合成顯著升高以及收縮蛋白的種類發(fā)生相應改變等。雖然最初心肌肥大是為了滿足心臟在超負荷壓力下的需求而發(fā)生的一種代償性的生理變化,但它并不是無限度的。由于肥大的心肌需氧量逐漸增加,而冠狀動脈的供血量不足從而造成肥大部分心肌的缺血,進而造成心肌收縮功能減弱,最終導致一系列心血管疾病,因此心肌肥大被認為是誘發(fā)眾多重大心血管疾病的危險因素之一。然而目前臨床上仍缺乏有效預防方法和治療手段。因此,深入探究心肌肥大發(fā)生的分子機制,以期為臨床預防與治療提供新的理論依據(jù)。環(huán)狀RNA作為近年來一種新發(fā)現(xiàn)的非編碼RNA(ncRNA),是真核生物中共價閉合的內(nèi)源性生物分子,具有組織特異性和細胞特異性表達模式。環(huán)狀RNA由于其獨特的環(huán)狀結構不易被核酸外切酶降解而更加穩(wěn)定,因而具有更長的半衰期。由于目前已知的某些環(huán)狀RNA在表達上比較豐富,且在進化上相對保守,而逐漸成為ncRNA領域的研究熱點。研究表明,環(huán)狀RNA主要通過吸附miRNA來調(diào)節(jié)下游靶基因的表達,也可通過調(diào)控基因轉... 

【文章來源】:鄭州大學河南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:70 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

鹽酸異丙腎上腺素誘導的心肌肥大中環(huán)狀RNA的表達


圖4.2?ISO誘導對小鼠心室中ANF和miR-23a表達情況的影響??

序列,環(huán)狀,染色體,基因組


?實驗結果???418?I?14S4?!?1441?(?|;?f?^??:?^in?r??control?iso?control?Iso??C????^一??餐蘿..'?......…#.??圖4.?3環(huán)狀RNA表達譜??(A)兩組測序結果中環(huán)狀RNA的維恩圖;(B?)通過將環(huán)狀RNA序列比對到小鼠基因組??上得到其分類占比:(C)?Circos圖上顯示環(huán)狀RNA在小鼠染色體上的分布。最外層代表??小鼠所有的染色體,每3個內(nèi)層代表同?組中每個樣品的環(huán)狀RNA分布。Control:生理鹽??水處理組,ISO:異丙腎上腺素處理組,n=3。??4.3?ISO誘導使心室環(huán)狀RNA表達譜發(fā)生改變??從圖4.3的結果我們己經(jīng)知道對照組和]SO處理組小鼠心室環(huán)狀RNA表達??譜并不是完全相同的,所以我們推測ISO能夠影響環(huán)狀RNA的表達。通過對兩??組共表達的1464個環(huán)狀RNA進一步分析,我們發(fā)現(xiàn)在其中有119個環(huán)狀RNA??表達發(fā)生了明顯的改變。結果如圖4.4A所示,相比于對照組,其中的89個環(huán)狀??RNA發(fā)生上調(diào),30個環(huán)狀RNA發(fā)生下調(diào)。隨后我們從其中挑選了一部分表達??差異比較顯著的環(huán)狀RNA以熱圖進行展示,其結果如圖4.4B所示。綜上所述,??ISO能夠影響心室環(huán)狀RNA的表達。??21??

環(huán)狀,腎上腺素


lc38a1??0)?I?I?丨護,痛!??cir-jmjcJ1c??cir-kalm??cir-mboat2??.:>i?i總.??,C#*I?I?4EjT?Cir-arh9ap26???????Vi?>yv_?UHV*??[SS?v??m?V?W?'?LrTM?—^???f?^?¥:=PpPic???〇-|?1?_?嚴丨?1?1?cir-nln??I^^HIHHi?%\rr:^〇2??log2FC?low?—1^—?high??圖4.4異丙腎上腺素處理后差異表達的環(huán)狀RNA??(A)相比于control組,ISO處理后差異表達環(huán)狀RNA的火山圖。FC?(Fold?changes)為2??倍及以上并且P<0.05被認為是有顯著差異,顯著上調(diào)和下調(diào)的分別用紅點和綠點表示。(B)??一部分在control和ISO組中表達發(fā)生顯著變化的環(huán)狀RNA熱圖。紅色代表上調(diào),綠色代??表下調(diào),表達量越高顏色越深,n=3。??4.4對環(huán)狀RNA測序結果的驗證??接下來對RNA-seq中差異表達的環(huán)狀RNA的真實性和可靠性進行驗證,我??們挑選6個表達發(fā)生顯著變化的環(huán)狀RNA進行驗證,它們分別是mmu-circRNA??wwpl、mmu-circRNA?ift81、mmu-circRNA?trappc9、mmu-circRNA?klcl、??mmu-circRNA?sh3rf3?和?mmu-circRNA?20702。為了保證環(huán)狀?RNA?的特異性擴增,??我們對每個環(huán)狀RNA都設計了一對divergent?primer和一對convergent?primer,??以小鼠cDNA和基因組D


本文編號:3503626

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