研究背景:心血管疾�。╟andiovascular disease,CVD）的發(fā)病率與死亡率已躍居世界第一,是當(dāng)今危害人類健康和生命的主要疾病之一,其中很大部分歸因于冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟病。腸道菌群失調(diào)（intestinal dysbacteriosis,ID）是指由于某種原因打破了人體腸道正常菌群的種類、數(shù)量、定位以及生物學(xué)特點(diǎn)的變化,使腸道菌群之間失去平衡從而產(chǎn)生病理性組合,并危害著人體健康。有研究提示腸道菌群失調(diào)與冠心病、心力衰竭、肥胖、高血壓病及糖尿病等疾病存在相關(guān)性。本實(shí)驗(yàn)旨在穩(wěn)定型冠心病與腸道菌群之間的關(guān)系,為腸道菌群與穩(wěn)定型冠心病的研究進(jìn)一步提供了理論依據(jù)。目的:本研究旨在通過16Sr RNA測序技術(shù)分析穩(wěn)定型冠心病患者的腸道菌群變化特點(diǎn),研究腸道菌群改變與穩(wěn)定型冠心病之間的關(guān)系,以期為冠心病的防治提供新的靶點(diǎn)和理論依據(jù)。方法:13例受試者收集于2018年12月至2019年5月陜西省人民醫(yī)院心血管內(nèi)一科的住院患者及門診健康體檢者,分為穩(wěn)定型冠心患者9例和健康對(duì)照組4例。采集研究對(duì)象的糞便5g用于提取糞便總DNA,利用16S r RNA測序技術(shù)獲得基因序列,然后在Illu... 

【文章來源】：西安醫(yī)學(xué)院陜西省

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

序列樣本拆分統(tǒng)計(jì)

西安醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文28cluster的序列及其代表序列（即為OTU）。對(duì)每個(gè)樣本而言，OTU豐度構(gòu)成該樣本的組成結(jié)構(gòu)。使用R軟件ggplot2包中的ggplot函數(shù)可對(duì)示例樣本在各分類水平注釋的相對(duì)程度進(jìn)行堆疊圖繪制，可視化結(jié)果如圖3，代表所有樣本在各分類水平上的序列注釋程度柱形圖。橫坐標(biāo)(SampleName)是樣品名，縱坐標(biāo)(SequenceNumberPercent)表示注釋到該水平的序列數(shù)目占總注釋數(shù)據(jù)的比率，柱狀圖自上而下的顏色順序?qū)?yīng)于右側(cè)的圖例顏色順序。每個(gè)分類水平最高值為1，代表100%的序列都得到了至少在這個(gè)級(jí)別的注釋。本研究結(jié)果主要針對(duì)每個(gè)樣本腸道微生物的物種分別在門、綱和屬3個(gè)水平分類級(jí)別進(jìn)行分析。圖3所有樣本在各分類水平上的序列注釋程度柱形圖說明：A樣本為穩(wěn)定型冠心病組，C樣本為健康對(duì)照組3.4物種組成分析一般進(jìn)行群落結(jié)構(gòu)分析，可以從兩個(gè)角度來入手。一是群落結(jié)構(gòu)分布柱狀圖，可以展示不同樣本或者分組整體群落的構(gòu)成，以及構(gòu)成之間的差異；二是群落結(jié)構(gòu)分布Heatmap圖：可直觀展示物種在門綱目科水平的豐度高低。首先，根據(jù)圖4-A在門水平上群落結(jié)構(gòu)分布柱狀圖，我們?cè)诜�(wěn)定型冠心病組中發(fā)現(xiàn)主要以四大門為主（總占比大于99%），按照占比情況從高到低分別是厚壁菌門（Firmicutes）、變形菌門（Proteobacteria）、放線菌門（Actinobacteria）

西安醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文31GenusLevelBarplot(C)圖4在各分類水平上的序列注釋程度柱形圖（門、綱、屬）說明：treatment代表穩(wěn)定型冠心病組；Control代表健康對(duì)照組3.5樣本共有物種分析OTU的豐度揭示了樣本腸道菌群的豐富程度。根據(jù)分組里每個(gè)樣本的OTU的豐度可計(jì)算出每個(gè)樣本或組間共同擁有和特有的OTU，可用Veen圖表示。從圖5可看出共有OTU數(shù)是780個(gè)，穩(wěn)定型冠心病組特有OTU數(shù)是415個(gè)，健康對(duì)照組特有OTU數(shù)是174個(gè)，兩組共有OTU數(shù)是191個(gè)。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]《中國心血管病報(bào)告2018》概要[J]. 胡盛壽,高潤霖,劉力生,朱曼璐,王文,王擁軍,吳兆蘇,李惠君,顧東風(fēng),楊躍進(jìn),鄭哲,陳偉偉.  中國循環(huán)雜志. 2019(03)
[2]基于高通量測序技術(shù)的冠心病患者腸道菌群多樣性研究[J]. 胡海兵,崔立,郭靚驊,王春艷,華修國,余強(qiáng),尹桂芝.  上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)科學(xué)版). 2016(02)
[3]role of the normal gut microbiota[J]. Sai Manasa Jandhyala,Rupjyoti Talukdar,Chivkula Subramanyam,Harish Vuyyuru,Mitnala Sasikala,D Nageshwar Reddy.  World Journal of Gastroenterology. 2015(29)
[4]我國冠心病研究主要成就[J]. 高潤霖,吳錫桂,陳紀(jì)林,陳保生,馮宗忱.  中華心血管病雜志. 1999(05)

碩士論文
[1]腸道菌群與糖尿病發(fā)生關(guān)系的研究[D]. 王娜.大連醫(yī)科大學(xué) 2011



本文編號(hào)：3226042