主動(dòng)脈弓縮窄模型所致小鼠主動(dòng)脈重塑的lncRNA表達(dá)譜分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-20 13:10
目的分析主動(dòng)脈弓縮窄(TAC)模型所致高壓負(fù)荷誘導(dǎo)的小鼠主動(dòng)脈重塑的長鏈非編碼RNA(lncRNA)表達(dá)譜并探討其可能的作用機(jī)制。方法取60只8周齡C57BL/6J雄性小鼠,分別構(gòu)建TAC模型及進(jìn)行假手術(shù)處理,術(shù)后1周TAC模型小鼠右頸總動(dòng)脈/左頸總動(dòng)脈血流速度比值為5~10時(shí)納入實(shí)驗(yàn)組,假手術(shù)處理小鼠該比值為<1者納入對照組,各24只。分別采用HE、Weigert及天狼猩紅染色觀察血管中膜厚度、中膜層彈力纖維及膠原纖維沉積情況。應(yīng)用高通量測序技術(shù)鑒定差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄本,并通過生物信息學(xué)分析的方法解析動(dòng)脈重塑后轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)變化。結(jié)果術(shù)后1周,實(shí)驗(yàn)組的右頸總動(dòng)脈/左頸總動(dòng)脈血流速度比值高于對照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001)。術(shù)后2周,與對照組相比,實(shí)驗(yàn)組升主動(dòng)脈內(nèi)徑增大,且發(fā)生明顯重塑,包括中膜增厚、中膜彈力纖維變稀疏以及大量膠原纖維沉積。根據(jù)建立的標(biāo)準(zhǔn)[差異倍數(shù)≥2,P<0.05,錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(FDR值)<0.05],實(shí)驗(yàn)組與對照組在轉(zhuǎn)錄水平上共有199個(gè)lncRNA發(fā)生顯著變化。任意挑選6個(gè)lncRNA進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證,與測序結(jié)果一致。預(yù)測lncRNA...
【文章來源】:解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2020,45(09)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 動(dòng)物模型的制備
1.2 超聲檢測小鼠血流速度
1.3 取材及石蠟切片制備
1.4 升主動(dòng)脈組織切片染色
1.5 RNA-seq篩選差異lncRNA
1.6 qRT-PCR驗(yàn)證RNA-seq效力
1.7 生物信息學(xué)分析
1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié) 果
2.1 TAC對主動(dòng)脈壓力及形態(tài)的影響
2.2 RNA-seq篩選出差異表達(dá)的lncRNA
2.3 qRT-PCR驗(yàn)證RNA-seq效力
2.4 反義預(yù)測的靶基因的功能富集分析
2.5 順式調(diào)控預(yù)測的靶基因的功能富集分析
3 討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于貝葉斯網(wǎng)絡(luò)的心血管疾病與其他慢性病因果關(guān)系分析[J]. 何旭,錢夕元,阮彤. 鄭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2019(04)
[2]不同心血管危險(xiǎn)分層高血壓患者腸道菌群多樣性分析[J]. 陳維玉,陳揚(yáng)平,馮婷,胡興衛(wèi),周風(fēng)云,路祥麒,張秋霞,張新祿,陳鵬,修建成. 實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志. 2019(09)
[3]高血壓或糖尿病及二者聯(lián)合作用對新發(fā)慢性腎臟病的影響[J]. 李俊娟,周靖,李慧英,陸春紅,王劍利,黃金杰,魯?shù)陆?吳壽嶺. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2018(10)
[4]LncRNA-ATB在高糖誘導(dǎo)的人腹膜間皮細(xì)胞表型轉(zhuǎn)換及增殖中的作用[J]. 車明文,龔翔,張小金,魏達(dá)鋒,王曉文,王漢民,巨立中. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2017(11)
本文編號(hào):3197811
【文章來源】:解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2020,45(09)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 動(dòng)物模型的制備
1.2 超聲檢測小鼠血流速度
1.3 取材及石蠟切片制備
1.4 升主動(dòng)脈組織切片染色
1.5 RNA-seq篩選差異lncRNA
1.6 qRT-PCR驗(yàn)證RNA-seq效力
1.7 生物信息學(xué)分析
1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié) 果
2.1 TAC對主動(dòng)脈壓力及形態(tài)的影響
2.2 RNA-seq篩選出差異表達(dá)的lncRNA
2.3 qRT-PCR驗(yàn)證RNA-seq效力
2.4 反義預(yù)測的靶基因的功能富集分析
2.5 順式調(diào)控預(yù)測的靶基因的功能富集分析
3 討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于貝葉斯網(wǎng)絡(luò)的心血管疾病與其他慢性病因果關(guān)系分析[J]. 何旭,錢夕元,阮彤. 鄭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2019(04)
[2]不同心血管危險(xiǎn)分層高血壓患者腸道菌群多樣性分析[J]. 陳維玉,陳揚(yáng)平,馮婷,胡興衛(wèi),周風(fēng)云,路祥麒,張秋霞,張新祿,陳鵬,修建成. 實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志. 2019(09)
[3]高血壓或糖尿病及二者聯(lián)合作用對新發(fā)慢性腎臟病的影響[J]. 李俊娟,周靖,李慧英,陸春紅,王劍利,黃金杰,魯?shù)陆?吳壽嶺. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2018(10)
[4]LncRNA-ATB在高糖誘導(dǎo)的人腹膜間皮細(xì)胞表型轉(zhuǎn)換及增殖中的作用[J]. 車明文,龔翔,張小金,魏達(dá)鋒,王曉文,王漢民,巨立中. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2017(11)
本文編號(hào):3197811
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