目的通過生物信息學(xué)方法尋找肺動(dòng)脈高壓中差異表達(dá)的基因,為肺動(dòng)脈高壓的預(yù)防和早期診斷及治療提供新思路。方法從公共基因數(shù)據(jù)庫（GEO）中下載基因芯片數(shù)據(jù)集GSE113439,使用在線分析工具GEO2R篩選出肺動(dòng)脈高壓肺組織和正常肺組織的差異表達(dá)基因。利用在線數(shù)據(jù)庫DAVID和STRING分別進(jìn)行功能、通路富集分析和蛋白互作分析,使用Cytoscape軟件來篩選蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)中的核心網(wǎng)絡(luò)基因及顯著相互作用模塊。結(jié)果共篩選出559個(gè)差異基因,其中87個(gè)為上調(diào)基因,472個(gè)為下調(diào)基因（調(diào)整后P<0.2005,|log2FC|>1）。對(duì)差異基因進(jìn)行GO和KEGG富集分析,GO富集分析（P<0.2005）結(jié)果提示:（1）生物過程:差異表達(dá)基因顯著富集于DNA雙解、DNA修復(fù)、有絲分裂等;（2）細(xì)胞單位:差異表達(dá)基因顯著富集于核質(zhì)、膜、核仁、細(xì)胞質(zhì)、中心體、核、核斑點(diǎn)、染色體、高爾基體等;（3）分子功能:差異表達(dá)基因顯著富集于聚（A）20RNA結(jié)合、ATP結(jié)合、蛋白質(zhì)結(jié)合、解旋酶活性、微管結(jié)合、ATP依賴性DNA解旋酶活性等。KEGG富集分析結(jié)果提示差異表達(dá)基因顯著富集于真核生物的... 

【文章來源】：心血管病學(xué)進(jìn)展. 2020,41(04)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 數(shù)據(jù)來源
    1.2 篩選DEG
    1.3 DEG生物信息學(xué)分析
    1.4 PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析
2 結(jié)果
    2.1 篩選DEG
    2.2 對(duì)DEG進(jìn)行GO富集分析和KEGG分析
    2.3 PPI分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]肺動(dòng)脈高壓新型治療方式展望[J]. 石文海,黃瑋,蔡琳.  心血管病學(xué)進(jìn)展. 2017(01)



本文編號(hào)：3177007