血栓閉塞性脈管炎的SNP靶點(diǎn)分析研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-12 02:07
目的研究血栓閉塞性脈管炎患者的SNP靶點(diǎn)。方法以2016年11月-2019年7月在新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院血管外科和新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院血管外科就診的血栓閉塞性脈管炎患者177例為研究對(duì)象,以同時(shí)期在體檢中心86例健康成年男性為對(duì)照。采用芯片法篩選差異位點(diǎn),采用Logistic回歸分析,通過(guò)質(zhì)量控制分析確定SNP靶點(diǎn)的研究。對(duì)易感SNP所在基因及上下游相關(guān)基因進(jìn)行富集分析,通過(guò)富集差異基因的Pathway條目,找尋引起疾病發(fā)病及進(jìn)展的細(xì)胞通路。結(jié)果通過(guò)檢驗(yàn)計(jì)算SNP與疾病關(guān)聯(lián)的顯著性篩選出26個(gè)血栓閉塞性脈管炎相關(guān)SNP靶點(diǎn),通過(guò)GO與Pathway富集分析,最終獲得16個(gè)靶點(diǎn)。篩選出26個(gè)SNP所在的基因及附近所涉及的基因共84個(gè),其主要作用于細(xì)胞粘附,生物粘附,細(xì)胞與細(xì)胞間粘附,細(xì)胞真菌起源的分子應(yīng)答,調(diào)節(jié)細(xì)胞組件大小,細(xì)胞內(nèi)的信號(hào)級(jí)聯(lián),腫瘤壞死因子生成的正向調(diào)控,模式識(shí)別受體信號(hào)通路,激活先天性免疫,先天性免疫激活反應(yīng)等生物學(xué)過(guò)程。結(jié)論血栓閉塞性脈管炎與SPN靶點(diǎn)具有相關(guān)性。
【文章來(lái)源】:新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,43(11)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 一般資料
1.2 納入及排除標(biāo)準(zhǔn)[10-11]
1.3 方法
1.3.1 樣品的制備方法
1.3.2 基因測(cè)序方法
1.3.3 關(guān)聯(lián)性分析
1.4 質(zhì)量控制
1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié)果
2.1 芯片掃描結(jié)果
2.2 Logistic回歸分析篩選差異位點(diǎn)
2.3富集分析結(jié)果
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]血栓閉塞性脈管炎中西醫(yī)結(jié)合專(zhuān)家共識(shí)[J]. Expert Committee of Thromboangiitis Obliterans, Professional Committee of Peripheral Blood Vessels of Chinese Association of Integrative Medicine;. 血管與腔內(nèi)血管外科雜志. 2019(06)
[2]線(xiàn)粒體損傷與動(dòng)脈粥樣硬化的研究進(jìn)展[J]. 李翼,吳鵬,彭文夕,譚利蘭,危當(dāng)恒,尹衛(wèi)東. 生命的化學(xué). 2018(05)
[3]轉(zhuǎn)錄因子核因子-κB p65通過(guò)miR-17調(diào)控血管平滑肌細(xì)胞增殖的機(jī)制研究[J]. 段力仁,楊棟,張晶,林姝,趙琳,王侖,呂俊遠(yuǎn),辛世杰. 中國(guó)血管外科雜志(電子版). 2017(02)
[4]彩色多普勒超聲檢查在下肢動(dòng)脈硬化閉塞癥與血栓閉塞性脈管炎鑒別診斷中的應(yīng)用研究[J]. 魯靖. 實(shí)用醫(yī)技雜志. 2017(03)
[5]貝前列素鈉聯(lián)合西洛他唑和瑞舒伐他汀治療老年糖尿病下肢動(dòng)脈病變的臨床研究[J]. 王芬,王彥,孟海艷. 中西醫(yī)結(jié)合心腦血管病雜志. 2016(06)
[6]氧化應(yīng)激對(duì)內(nèi)皮細(xì)胞NF-κB、iNOS和NO信號(hào)表達(dá)的影響[J]. 何姜,陳閩,劉小鶯,王燕萍,劉禮斌. 福建醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(03)
本文編號(hào):3077491
【文章來(lái)源】:新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,43(11)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 一般資料
1.2 納入及排除標(biāo)準(zhǔn)[10-11]
1.3 方法
1.3.1 樣品的制備方法
1.3.2 基因測(cè)序方法
1.3.3 關(guān)聯(lián)性分析
1.4 質(zhì)量控制
1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié)果
2.1 芯片掃描結(jié)果
2.2 Logistic回歸分析篩選差異位點(diǎn)
2.3富集分析結(jié)果
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]血栓閉塞性脈管炎中西醫(yī)結(jié)合專(zhuān)家共識(shí)[J]. Expert Committee of Thromboangiitis Obliterans, Professional Committee of Peripheral Blood Vessels of Chinese Association of Integrative Medicine;. 血管與腔內(nèi)血管外科雜志. 2019(06)
[2]線(xiàn)粒體損傷與動(dòng)脈粥樣硬化的研究進(jìn)展[J]. 李翼,吳鵬,彭文夕,譚利蘭,危當(dāng)恒,尹衛(wèi)東. 生命的化學(xué). 2018(05)
[3]轉(zhuǎn)錄因子核因子-κB p65通過(guò)miR-17調(diào)控血管平滑肌細(xì)胞增殖的機(jī)制研究[J]. 段力仁,楊棟,張晶,林姝,趙琳,王侖,呂俊遠(yuǎn),辛世杰. 中國(guó)血管外科雜志(電子版). 2017(02)
[4]彩色多普勒超聲檢查在下肢動(dòng)脈硬化閉塞癥與血栓閉塞性脈管炎鑒別診斷中的應(yīng)用研究[J]. 魯靖. 實(shí)用醫(yī)技雜志. 2017(03)
[5]貝前列素鈉聯(lián)合西洛他唑和瑞舒伐他汀治療老年糖尿病下肢動(dòng)脈病變的臨床研究[J]. 王芬,王彥,孟海艷. 中西醫(yī)結(jié)合心腦血管病雜志. 2016(06)
[6]氧化應(yīng)激對(duì)內(nèi)皮細(xì)胞NF-κB、iNOS和NO信號(hào)表達(dá)的影響[J]. 何姜,陳閩,劉小鶯,王燕萍,劉禮斌. 福建醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(03)
本文編號(hào):3077491
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