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利用RNA-seq對山羊房顫模型左心耳組織進行GO和KEGG網(wǎng)絡(luò)分析

發(fā)布時間:2021-01-29 06:13
  背景心房顫動(房顫,AF)是最常見的心律失常,與中風、心力衰竭等患亡率的增加密切相關(guān)。房顫病理生理的研究已近一個世紀的歷史,目前的觀點認為其發(fā)生及維持的分子機制包括:心房電重構(gòu)、結(jié)構(gòu)重構(gòu)、收縮重構(gòu)、自主神經(jīng)重構(gòu)、氧化應(yīng)激、炎癥等,但尚不完全清楚,仍需進一步的研究。目的本研究通過左心房快速起搏的方式構(gòu)建山羊房顫模型,利用深度測序技術(shù)RNA-seq檢測山羊房顫模型左心耳mRNA表達譜的變化,以期從分子水平揭示房顫發(fā)生發(fā)展機制,為今后房顫的精準化治療提供靶點。材料與方法1.選取14只健康雄性山羊,月齡相似,重量18-22 Kg,隨機分成對照組(n=7)和實驗組(快速起搏組,n=7)。所有山羊均行開胸手術(shù),將起搏電極縫至左心房和右心房,實驗組以600次/min持續(xù)刺激4 w,對照組不予起搏。并于手術(shù)前和手術(shù)4 w后分別進行心臟電生理檢查,包括心房有效不應(yīng)期(Atrial effective refractory period,AERP)和猝發(fā)刺激。實驗結(jié)束后留取山羊左心耳組織凍存?zhèn)溆谩?.轉(zhuǎn)錄組測序分析及驗證提取對照組和實驗組山羊左心耳組織的總RNA,通過RNA-seq檢測兩組山羊左心耳組織中... 

【文章來源】: 韓柯 新鄉(xiāng)醫(yī)學院

【文章頁數(shù)】:69 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

利用RNA-seq對山羊房顫模型左心耳組織進行GO和KEGG網(wǎng)絡(luò)分析


竇性心率及房顫心律心電圖(左圖為竇性心律,右圖為房顫心律

起搏,實驗組,終點


實驗組和對照組起搏前、起搏終點AERP檢驗,pre_pacing表示術(shù)前,pacing_ending表示

心耳,實驗組,圖片,山羊


24ABCD圖4對照組、實驗組左心耳組織HE及Masson染色圖片(左邊為對照組,右邊為實照組。A、B為HE染色,兩組間未觀察到明顯差異。C、D為Masson染色,兩組間膠原容積分數(shù),p>0.05,差異無統(tǒng)計學意義)3mRNAs深度測序結(jié)果對照組和實驗組山羊模型左心耳組織mRNAs表達譜分析顯示:差異表達基因共1079個(FoldChange>1.5且p<0.05),其中上調(diào)的有757個,下調(diào)的有322個。對對照組和實驗組山羊模型左心耳組織中mRNA進行主成分分析(principalcomponentanalysis,PCA),發(fā)現(xiàn)N2和C6為離群值,予以剔除,見圖5。對差異基因繪制聚類熱圖(見圖6)、火山圖(見圖7)和MA圖(見圖8)。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]白介素-18與心房顫動的相關(guān)性研究[J]. 郭媛媛,欒穎,李述峰,李少軍.  哈爾濱醫(yī)科大學學報. 2019(01)



本文編號:3006414

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