利用RNA-seq對(duì)山羊房顫模型左心耳組織進(jìn)行GO和KEGG網(wǎng)絡(luò)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-29 06:13
背景心房顫動(dòng)(房顫,AF)是最常見的心律失常,與中風(fēng)、心力衰竭等患亡率的增加密切相關(guān)。房顫病理生理的研究已近一個(gè)世紀(jì)的歷史,目前的觀點(diǎn)認(rèn)為其發(fā)生及維持的分子機(jī)制包括:心房電重構(gòu)、結(jié)構(gòu)重構(gòu)、收縮重構(gòu)、自主神經(jīng)重構(gòu)、氧化應(yīng)激、炎癥等,但尚不完全清楚,仍需進(jìn)一步的研究。目的本研究通過左心房快速起搏的方式構(gòu)建山羊房顫模型,利用深度測(cè)序技術(shù)RNA-seq檢測(cè)山羊房顫模型左心耳mRNA表達(dá)譜的變化,以期從分子水平揭示房顫發(fā)生發(fā)展機(jī)制,為今后房顫的精準(zhǔn)化治療提供靶點(diǎn)。材料與方法1.選取14只健康雄性山羊,月齡相似,重量18-22 Kg,隨機(jī)分成對(duì)照組(n=7)和實(shí)驗(yàn)組(快速起搏組,n=7)。所有山羊均行開胸手術(shù),將起搏電極縫至左心房和右心房,實(shí)驗(yàn)組以600次/min持續(xù)刺激4 w,對(duì)照組不予起搏。并于手術(shù)前和手術(shù)4 w后分別進(jìn)行心臟電生理檢查,包括心房有效不應(yīng)期(Atrial effective refractory period,AERP)和猝發(fā)刺激。實(shí)驗(yàn)結(jié)束后留取山羊左心耳組織凍存?zhèn)溆谩?.轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析及驗(yàn)證提取對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組山羊左心耳組織的總RNA,通過RNA-seq檢測(cè)兩組山羊左心耳組織中...
【文章來源】: 韓柯 新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
竇性心率及房顫心律心電圖(左圖為竇性心律,右圖為房顫心律
實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組起搏前、起搏終點(diǎn)AERP檢驗(yàn),pre_pacing表示術(shù)前,pacing_ending表示
24ABCD圖4對(duì)照組、實(shí)驗(yàn)組左心耳組織HE及Masson染色圖片(左邊為對(duì)照組,右邊為實(shí)照組。A、B為HE染色,兩組間未觀察到明顯差異。C、D為Masson染色,兩組間膠原容積分?jǐn)?shù),p>0.05,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義)3mRNAs深度測(cè)序結(jié)果對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組山羊模型左心耳組織mRNAs表達(dá)譜分析顯示:差異表達(dá)基因共1079個(gè)(FoldChange>1.5且p<0.05),其中上調(diào)的有757個(gè),下調(diào)的有322個(gè)。對(duì)對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組山羊模型左心耳組織中mRNA進(jìn)行主成分分析(principalcomponentanalysis,PCA),發(fā)現(xiàn)N2和C6為離群值,予以剔除,見圖5。對(duì)差異基因繪制聚類熱圖(見圖6)、火山圖(見圖7)和MA圖(見圖8)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]白介素-18與心房顫動(dòng)的相關(guān)性研究[J]. 郭媛媛,欒穎,李述峰,李少軍. 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(01)
本文編號(hào):3006414
【文章來源】: 韓柯 新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
竇性心率及房顫心律心電圖(左圖為竇性心律,右圖為房顫心律
實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組起搏前、起搏終點(diǎn)AERP檢驗(yàn),pre_pacing表示術(shù)前,pacing_ending表示
24ABCD圖4對(duì)照組、實(shí)驗(yàn)組左心耳組織HE及Masson染色圖片(左邊為對(duì)照組,右邊為實(shí)照組。A、B為HE染色,兩組間未觀察到明顯差異。C、D為Masson染色,兩組間膠原容積分?jǐn)?shù),p>0.05,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義)3mRNAs深度測(cè)序結(jié)果對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組山羊模型左心耳組織mRNAs表達(dá)譜分析顯示:差異表達(dá)基因共1079個(gè)(FoldChange>1.5且p<0.05),其中上調(diào)的有757個(gè),下調(diào)的有322個(gè)。對(duì)對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組山羊模型左心耳組織中mRNA進(jìn)行主成分分析(principalcomponentanalysis,PCA),發(fā)現(xiàn)N2和C6為離群值,予以剔除,見圖5。對(duì)差異基因繪制聚類熱圖(見圖6)、火山圖(見圖7)和MA圖(見圖8)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]白介素-18與心房顫動(dòng)的相關(guān)性研究[J]. 郭媛媛,欒穎,李述峰,李少軍. 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(01)
本文編號(hào):3006414
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