發(fā)布時(shí)間：2020-04-14 05:41

【摘要】：背景經(jīng)典遺傳學(xué)認(rèn)為某些單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(single nucleotide polymorphisms,SNPs)與房顫具有強(qiáng)相關(guān)性,例如rs2200733,但其分子機(jī)制還不清。此外,大量研究已經(jīng)報(bào)道了表觀遺傳學(xué)可能參與SNPs與表型關(guān)系的調(diào)控,例如DNA甲基化,但其與房顫的相關(guān)性報(bào)道罕見。通過(guò)查閱文獻(xiàn),未發(fā)現(xiàn)有關(guān)于rs2200733位點(diǎn)附近DNA甲基化與房顫的相關(guān)報(bào)道。目的探索rs2200733在中國(guó)中原地區(qū)漢族人群中對(duì)房顫的影響,以及位于rs2200733下游的兩個(gè)CpG位點(diǎn)的甲基化程度是否與該SNP位點(diǎn)具有相關(guān)性。方法在鄭州市第七人民醫(yī)院心血管內(nèi)科從2016年9月至2017年6月的住院患者中篩選出238名患者,分為房顫組和竇律組。對(duì)所有患者采集外周靜脈血并提取DNA,使用突變阻滯擴(kuò)增系統(tǒng)(amplification refractory mutation system,ARMS)法對(duì)rs2200733進(jìn)行基因分型。在上述分組中隨機(jī)選擇57例房顫患者和110例竇律患者,進(jìn)行重亞硫酸氫鹽處理和焦磷酸測(cè)序。全部病人的相關(guān)臨床資料從醫(yī)院病歷中獲取。結(jié)果病人的臨床資料分析顯示其性別、年齡、冠心病(CAD)、糖尿病(DM)、腦卒中、左房?jī)?nèi)徑(LAD)和左室射血分?jǐn)?shù)(LVEF)對(duì)房顫有影響。經(jīng)由卡方檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)在五個(gè)遺傳模型中,rs2200733與房顫具有明顯的相關(guān)性,尤其是在隱性模型中(OR:2.396,95%CI:1.336 to 4.297,P=0.003)。利用在線基因型分析軟件SNPStats,經(jīng)過(guò)校正性別、年齡、CAD、DM、腦卒中、LAD和LVEF后仍然發(fā)現(xiàn)在隱性模型中,SNP在房顫組和竇律組存在顯著差異(OR:4.75,95%CI:2.07 to 10.91,pSNP0.0056)。通過(guò)甲基化實(shí)驗(yàn),檢測(cè)到CpG_1和CpG_2均高度甲基化。根據(jù)二元logistic回歸分析的結(jié)果,發(fā)現(xiàn)上述兩個(gè)位點(diǎn)與rs2200733不相關(guān),即對(duì)房顫沒(méi)有影響(P0.025)。結(jié)論在中國(guó)中原地區(qū)漢族人群中,rs2200733的分布與該位點(diǎn)在亞洲其他人群中的分布相一致,并且rs2200733和房顫具有相關(guān)性。位于rs2200733下游的CpG_1和CpG_2位點(diǎn)的DNA甲基化與該SNP無(wú)相關(guān)性,并可能沒(méi)有參與到SNP對(duì)房顫的調(diào)控機(jī)制當(dāng)中。
【圖文】：

以及兩個(gè)位點(diǎn)CpG1，CpG2和PITX2 (Paired like homeodomain-2)基因之間的位置關(guān)系（圖1）。PITX2 基因距離 rs2200733 大約 150 kb。CpG1和 CpG2分別位于 rs2200733 位點(diǎn)下游 145 bp 和 177 bp 處，，是距離該 SNP 最近的兩個(gè) CpG 位點(diǎn)。圖 1 在染色體 4q25 上 rs2200733, CpG1, CpG2和 PITX2 基因的位置關(guān)系Figure 1 The position relations between rs2200733, CpG1, CpG2and PITX2 in chromosome 4q252.3 基因分型2.3.1 ARMS 法原理突變阻滯擴(kuò)增系統(tǒng)(amplification refractory mutation system，ARMS)是 SNP 分型

圖 2 房顫組樣本 PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果圖Figure 2 Electrophoresis results of PCR products in AF group.圖 3 竇律組樣本 PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果圖Figure 3 Electrophoresis results of PCR products in SR group經(jīng)過(guò) ABI3500XL 測(cè)序儀測(cè)序后，應(yīng)用 Chromas 軟件對(duì)測(cè)序圖進(jìn)行分析。測(cè)序顯示為反義互補(bǔ)鏈，找到對(duì)應(yīng)的 rs2200733 位點(diǎn)處，在野生型純合子的目的 DNA 序列上顯示為 G（圖 4），突變型純合子的目的 DNA 序列上顯示為 A（圖 5），雜合子的兩個(gè)目的 DNA 序列分別顯示為 G 和 A（圖 6、圖 7）。
【學(xué)位授予單位】：新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：R541.75

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本文編號(hào)：2626949