【摘要】：目的應(yīng)用基因芯片技術(shù)篩選哈薩克族原發(fā)性高血壓病(EH)患者異常DNA甲基化位點,初步構(gòu)建哈薩克族EH異常甲基化譜,為深入研究哈薩克族EH的發(fā)生機(jī)制提供理論依據(jù)。方法 2014年6月—2015年10月,在新疆烏魯木齊縣隨機(jī)抽取哈薩克族牧民或半農(nóng)牧民3 042例為調(diào)研對象,從其中的1 487例EH患者中隨機(jī)選取3例作為EH組,并選取年齡匹配的3例健康者作為對照組。采用Illumina Human Methylation 450K Bead Chip芯片對兩組受試者的全血進(jìn)行全基因組DNA甲基化檢測,篩選DNA異常甲基化位點,采用Gene Ontology(GO)富集分析和Pathway分析了解異常甲基化基因的功能。結(jié)果 EH組和對照組間存在427個差異甲基化位點,其中高甲基化位點148個,低甲基化位點279個;這些位點位于不同的染色體上,其中以1號和6號染色體最多,Y染色體未見差異甲基化位點;GO富集分析結(jié)果顯示,差異甲基化基因主要參與糖蛋白生物合成與代謝、血管發(fā)育、脈管系統(tǒng)發(fā)展、膠原蛋白結(jié)合等生物學(xué)過程;Pathway分析結(jié)果顯示,差異甲基化基因主要參與了硫酸軟骨素生物合成、胰島素信號通路、胞吞等。結(jié)論發(fā)生EH時DNA甲基化狀態(tài)發(fā)生改變,多條差異甲基化基因與EH相關(guān)通路有關(guān),但本研究僅是哈薩克族EH全基因組甲基化譜的開端,異常甲基化基因作為發(fā)生EH的候選分子標(biāo)志物,若要獲得更全面、更精確的結(jié)果,還需要進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量進(jìn)行分析及驗證。
[Abstract]:Objective to screen abnormal DNA methylation sites in Kazakh patients with essential hypertension (EH) by using gene chip technique, and to construct the abnormal methylation spectrum of EH in Kazakh population, and to provide a theoretical basis for further study on the pathogenesis of EH in Kazak nationality. Methods from June 2014 to October 2015, 3,042 Kazakh herdsmen or semi-farm herdsmen were randomly selected from Urumqi County, Xinjiang, and 3 of the 1,487 EH patients were randomly selected as EH group. Three age-matched healthy subjects were selected as control group. Illumina Human Methylation 450K Bead Chip chip was used to detect the whole genome DNA methylation in the whole blood of two groups of subjects. The abnormal methylation sites of DNA were screened, and the function of abnormal methylation gene was analyzed by Gene Ontology (GO) enrichment analysis and Pathway analysis. Results there were 427 differential methylation sites in EH group and control group, including 148 hypermethylation sites and 279 hypomethylation sites, which were located on different chromosomes. The results of enrichment analysis on chromosome 1 and chromosome 6 showed that differential methylation genes were mainly involved in glycoprotein biosynthesis and metabolism, vascular development and vascular system development. Biological processes such as collagen binding showed that differentially methylated genes were involved in chondroitin sulfate biosynthesis insulin signaling pathway and endocytosis. Conclusion the status of DNA methylation changes during EH, and many differentially methylated genes are related to EH related pathways, but this study is only the beginning of the whole genome methylation spectrum of EH in Kazak. The abnormal methylation gene is a candidate molecular marker for the occurrence of EH. In order to obtain more comprehensive and accurate results, it is necessary to further expand the sample size for analysis and verification.
【作者單位】： 新疆醫(yī)科大學(xué)護(hù)理學(xué)院;新疆醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)實驗動物中心;新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院;新疆烏魯木齊市烏魯木齊縣甘溝鄉(xiāng)衛(wèi)生院;新疆烏魯木齊市烏魯木齊縣小渠子鄉(xiāng)衛(wèi)生院;新疆烏魯木齊市烏魯木齊縣水西溝鎮(zhèn)中心衛(wèi)生院;新疆烏魯木齊市烏魯木齊縣板房溝鄉(xiāng)中心衛(wèi)生院;新疆醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院;
【基金】：新疆維吾爾自治區(qū)自然科學(xué)基金資助項目(2015211C020)
【分類號】：R544.11

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本文編號：2155645