染色體11q23.3單核苷酸多態(tài)性與中國(guó)漢族人群心肌梗死的相關(guān)性研究
本文選題:心肌梗死 + 單核苷酸多態(tài)性。 參考:《吉林大學(xué)》2015年博士論文
【摘要】:心肌梗死是冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟病進(jìn)展到后期的一種嚴(yán)重疾病,心肌梗死是由多種環(huán)境因素和多種遺傳因素共同參與作用所造成的一種復(fù)雜的疾病。單核苷酸多態(tài)性與心肌梗死的相關(guān)性研究是心肌梗死病因和發(fā)病機(jī)理遺傳學(xué)研究方面的重要內(nèi)容,而由于在種族的遷徙和進(jìn)化過種中,基因重組不斷的發(fā)生,因此,單核苷酸多態(tài)性與疾病的相關(guān)性在不同種族之間經(jīng)常存在不一致性。 目的:研究證實(shí)部分在非中國(guó)人群中報(bào)道的和心肌梗死或冠心病存在相關(guān)性的單核苷酸多態(tài)性在中國(guó)漢族人群是否和心肌梗死存在相關(guān)性,為全球多種族范圍內(nèi)心肌梗死易感性標(biāo)志物的篩選,以及心肌梗死遺傳學(xué)方面的機(jī)理研究提供部分理論數(shù)據(jù)依據(jù)。 方法:按照預(yù)先設(shè)定的入選標(biāo)準(zhǔn),我們共入選了549例中國(guó)漢族急性心肌梗死的患者,入選了551例中國(guó)漢族既往無冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟病病史者作為對(duì)照組。采用問卷調(diào)查和臨床住院病歷資料收集相結(jié)合的方式來收集所有研究樣本的資料。所有標(biāo)本采集外周靜脈血,應(yīng)用酚-氯仿法提取全基因組DNA。按照預(yù)先設(shè)定的入選標(biāo)準(zhǔn),我們隨機(jī)入選了三個(gè)在非中國(guó)人群中報(bào)道的和心肌梗死或冠心病存在相關(guān)性的單核苷酸多態(tài)性作為我們的研究對(duì)象,這三個(gè)單核苷酸多態(tài)性分別是rs1412444(LIPA),rs662799(APOA5)和rs964184(ZNF259),我們對(duì)每個(gè)標(biāo)本的基因組DNA,應(yīng)用基因測(cè)序的方法對(duì)這三個(gè)單核苷酸多態(tài)性的基因型進(jìn)行檢測(cè),再結(jié)合每個(gè)標(biāo)本的臨床資料,我們應(yīng)用SNPStats軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,并對(duì)混雜風(fēng)險(xiǎn)因素進(jìn)行校正,以及應(yīng)用Bonferroni校正方法來校正單核苷酸多態(tài)性選擇過程中出現(xiàn)的偏倚。 結(jié)果:研究結(jié)果顯示在中國(guó)漢族人群?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性rs662799與心肌梗死顯著性相關(guān),經(jīng)過混雜風(fēng)險(xiǎn)因素校正及Bonferroni校正后,在遺傳模型意義相對(duì)較大的相加模型中,其比值比為1.39,其比值比的95%可信區(qū)間為1.09-1.78,p值為0.0228;在中國(guó)漢族人群?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性rs964184亦與心肌梗死顯著性相關(guān),經(jīng)過混雜風(fēng)險(xiǎn)因素校正及Bonferroni校正后,在遺傳模型意義相對(duì)較大的相加模型中,其比值比為1.52,其比值比的95%可信區(qū)間為1.16-1.98,p值為0.0060;然而,在中國(guó)漢族人群?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性rs1412444卻并未發(fā)現(xiàn)與心肌梗死存在相關(guān)性,經(jīng)過混雜風(fēng)險(xiǎn)因素校正及Bonferroni校正后,在遺傳模型意義相對(duì)較大的相加模型中,其比值比為1.11,其比值比的95%可信區(qū)間為0.87-1.40,p值為1.0000。對(duì)和心肌梗死相關(guān)的兩個(gè)單核苷酸多態(tài)性rs662799和rs964184進(jìn)行連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)它們二者存在連鎖不平衡:心肌梗死組為:D’=0.959,r2=0.652;對(duì)照組為:D’=0.955,r2=0.658。進(jìn)一步的單體型分析發(fā)現(xiàn)單核苷酸多態(tài)性rs662799和rs964184組成的GG單體型與心肌梗死存在顯著相關(guān)性,經(jīng)過混雜風(fēng)險(xiǎn)因素校正及Bonferroni校正后,在遺傳模型意義相對(duì)較大的相加模型中,其比值比為1.50,95%可信區(qū)間為1.14-1.97,p值為0.0034。 為進(jìn)一步探討我們所研究的單核苷酸多態(tài)性與心肌梗死相關(guān)性可能存在的有關(guān)機(jī)制,我們對(duì)部分混雜風(fēng)險(xiǎn)因素的與我們研究的單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)上的二次分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在中國(guó)漢族人群?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性rs662799與甘油三脂顯著性相關(guān),,經(jīng)過混雜風(fēng)險(xiǎn)因素校正及Bonferroni校正后,在遺傳模型意義相對(duì)較大的相加模型中,其差異為0.09,其差異的95%可信區(qū)間為0.04-0.14,p值=0.0015;在中國(guó)漢族人群?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性rs964184亦與甘油三脂顯著相關(guān),經(jīng)過混雜風(fēng)險(xiǎn)因素校正及Bonferroni校正后,在遺傳模型意義相對(duì)較大的相加模型中,其差異為0.07,其差異的95%可信區(qū)間為0.01-0.12,p值=0.042;而在中國(guó)漢族人群?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性rs1412444卻并未發(fā)現(xiàn)與甘油三脂存在相關(guān)性,經(jīng)過混雜風(fēng)險(xiǎn)因素校正及Bonferroni校正后,在遺傳模型意義相對(duì)較大的相加模型中,其差異為-0.04,其差異的95%可信區(qū)間為-0.08-0.01,p值=0.48。 結(jié)論:本研究結(jié)果表明,位于染色體11q23.3上的兩個(gè)單核苷酸多態(tài)性rs964184和rs662799在中國(guó)漢族人群與心肌梗死存在顯著的相關(guān)性,其相關(guān)的致病基因可能與甘油三脂相關(guān);而位于染色體10q23上的單核苷酸多態(tài)性rs1412444在中國(guó)漢族人群未發(fā)現(xiàn)與心肌梗死存在相關(guān)性。而這三個(gè)單核苷酸多態(tài)性既往在非中國(guó)漢族人群的其他種族人群中均曾報(bào)導(dǎo)和心肌梗死或冠心病有關(guān),其結(jié)果進(jìn)一步表明單核苷酸多態(tài)性與疾病的相關(guān)性在不同種族存在差異。本研究為中國(guó)漢族人群心肌梗死在遺傳學(xué)研究領(lǐng)域完善了部分?jǐn)?shù)據(jù),可給未來在全球多種族內(nèi)研究心肌梗死易感性標(biāo)志物篩選,以及心肌梗死遺傳學(xué)方面的機(jī)理研究提供部分?jǐn)?shù)據(jù)的理論依據(jù)。
[Abstract]:Myocardial infarction is a serious disease in the late stage of coronary atherosclerotic heart disease . Myocardial infarction is a complex disease caused by multiple environmental factors and multiple genetic factors . The correlation between single nucleotide polymorphism and myocardial infarction is an important element in the pathogenesis and pathogenesis of myocardial infarction .
Objective : To study whether single nucleotide polymorphism ( SNPs ) associated with myocardial infarction or coronary heart disease ( AMI ) and myocardial infarction ( AMI ) in non - Chinese population is associated with myocardial infarction , and provides some theoretical data for the screening of susceptibility markers for myocardial infarction within the global multiracial range , as well as the mechanism of myocardial infarction genetics .
Methods : A total of 549 Chinese Han Chinese patients with acute myocardial infarction were enrolled and 551 Chinese Han Chinese were selected as control group . All the samples were collected from peripheral venous blood and the whole genomic DNA was extracted by phenol - chloroform method . According to the pre - set inclusion criteria , we randomly selected three single nucleotide polymorphisms ( rs1412444 ( LIPA ) , rs662799 ( APOA5 ) and rs964184 ( ZNF259 ) .
Results : The results showed that the single nucleotide polymorphism rs662799 of Chinese Han population was significantly correlated with myocardial infarction , and the odds ratio was 1 . 39 , the 95 % confidence interval of the odds ratio was 1.09 - 1.78 , and the p - value was 0.0228 .
The single nucleotide polymorphism rs964184 of Chinese Han population was also significantly correlated with myocardial infarction . After confounding risk factor correction and Bondevii correction , the odds ratio was 1.52 , the 95 % confidence interval of the odds ratio was 1.16 - 1.98 , p - value was 0.0060 ;
However , the single nucleotide polymorphism rs1412444 in Chinese Han population did not find a correlation with myocardial infarction , and the odds ratio was 1.11 , with a 95 % confidence interval of 0.87 - 1.40 and a p - value of 1.0000 . The linkage disequilibrium between the two single nucleotide polymorphisms rs662799 and rs964184 associated with myocardial infarction showed linkage disequilibrium : D ' = 0.959 , r2 = 0.652 ;
There was a significant correlation between single nucleotide polymorphism rs662799 and rs964184 in the control group . There was a significant correlation between single nucleotide polymorphism rs662799 and rs964184 . The odds ratio was 1.50 , 95 % confidence interval 1.14 - 1.97 , p - value 0.0034 .
In order to further explore the possible mechanism of single nucleotide polymorphism and myocardial infarction in Chinese Han population , we statistically analyzed some confounding risk factors and the single nucleotide polymorphism we studied . The results showed that the difference of single nucleotide polymorphism rs662799 and triglyceride in Chinese Han population was 0.09 , the 95 % confidence interval of the difference was 0.04 - 0.14 , p - value = 0.0015 ;
The single nucleotide polymorphism rs964184 of Chinese Han population was also significantly correlated with triglyceride , after confounding risk factor correction and Bondevii correction , the difference was 0.07 , the 95 % confidence interval of the difference was 0.01 - 0.12 , p - value = 0.042 ;
However , the single nucleotide polymorphism rs1412444 of Chinese Han population did not find a correlation with triglyceride , after confounding risk factor correction and Bondevii correction , the difference was - 0.04 , the 95 % confidence interval of the difference was - 0.08 - 0.01 , p - value = 0.48 .
Conclusion : Two single nucleotide polymorphisms rs964184 and rs662799 located on chromosome 11q23 have a significant correlation with myocardial infarction in Chinese Han population .
The single nucleotide polymorphism rs1412444 , which is located on chromosome 10q23 , has not been found to be associated with myocardial infarction in Chinese Han population . These three single nucleotide polymorphisms have previously been reported in other ethnic groups in the Han population in China . The results suggest that the correlation between single nucleotide polymorphism and disease is different in different races .
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R542.22
【共引文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):1954670
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