新生小鼠心肌肌鈣蛋白Ⅰ相互作用蛋白的鑒定與功能預(yù)測
本文選題:心肌肌鈣蛋白Ⅰ + 蛋白質(zhì)組學(xué); 參考:《解放軍醫(yī)學(xué)雜志》2017年09期
【摘要】:目的采用高通量蛋白質(zhì)組學(xué)篩選鑒定小鼠心肌原代細胞中可能與心肌肌鈣蛋白I(c Tn I)存在相互作用的蛋白質(zhì)并通過生物信息學(xué)軟件預(yù)測其可能參與的生物過程及信號通路。方法取C57新生小鼠的心臟制備心肌原代細胞,提取細胞全蛋白行免疫共沉淀實驗篩選出c Tn I的相互作用蛋白,通過質(zhì)譜分析技術(shù)對其進行鑒定;將鑒定所得蛋白質(zhì)信息輸入生物信息學(xué)軟件分析其理化性質(zhì),預(yù)測其可能參與的生物過程及信號通路。結(jié)果共鑒定出262種可能與c Tn I存在相互作用的蛋白質(zhì),預(yù)測其可能參與的生物進程14條,KEGG生物學(xué)通路33條(P0.05)。結(jié)論在小鼠心肌細胞中,有262種蛋白可能與c Tn I存在相互作用,其中部分蛋白可能參與心肌細胞鈣離子內(nèi)流及PI3K-Akt信號通路的調(diào)節(jié)。
[Abstract]:Objective to identify the proteins that may interact with cardiac troponin I (C Tn I) in murine cardiomyocytes by high throughput proteomics and to predict the possible biological processes and signaling pathways through bioinformatics software. Methods the cardiac primary cells were prepared from the heart of the newborn mice of C57, and the whole egg was extracted from the heart of the newborn mice of C57. The interaction protein of C Tn I was screened by the white line immunoprecipitation experiment, and was identified by mass spectrometry. The identification of protein information was introduced into bioinformatics software to analyze its physical and chemical properties, and to predict the possible biological processes and signal pathways involved in it. The results showed that 262 kinds of possible interactions with C Tn I were identified. Protein, prediction of its possible participation in biological processes 14, KEGG biological pathway 33 (P0.05). Conclusion in mouse cardiomyocytes, 262 proteins may interact with C Tn I, some of which may be involved in the regulation of calcium ion inflow and PI3K-Akt signaling pathway in cardiac myocytes.
【作者單位】: 重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院心臟內(nèi)科 兒童發(fā)育疾病研究教育部重點實驗室 兒童發(fā)育重大疾病國家國際科技合作基地 兒科學(xué)重慶市重點實驗室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金面上項目(81670212)~~
【分類號】:R542.2
【相似文獻】
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本文編號:1932390
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