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小鼠酒精性心肌病相關非編碼RNAs表達譜特征分析

發(fā)布時間:2018-05-06 10:12

  本文選題:酒精 + 心肌病; 參考:《昆明醫(yī)科大學》2015年碩士論文


【摘要】:目的:長期過量飲酒可引起機體多個重要器官發(fā)生細胞學、組織學及其結構的改變,導致胃潰瘍,胰腺炎,酒精性脂肪肝,酒精性心肌病等疾病的發(fā)生。本論文以酒精性心肌病為研究對象,利用高通量基因芯片檢測長期過量飲酒小鼠心肌組織中差異表達的microRNAs, long non-coding RNAs (lnc RNAs)和circular RNAs等非編碼RNAs的表達譜,從分子生物學角度探索酒精性心肌病的發(fā)生機制。方法:100只昆明種小鼠(12~14周齡),隨機分為飲酒組(n=60)和對照組(n=40),4%的乙醇水溶液作為飲酒組小鼠唯一的飲用水源,采用自由飲用的方式飼喂24周制作酒精性心肌病模型。持續(xù)建模24周后,隨機摘取飲酒組和對照組小鼠心臟各5顆制作石蠟切片和超薄切片,分別在光學顯微鏡和透射電子顯微鏡下觀察心臟的病理學改變和心肌細胞超微結構改變;確認小鼠酒精性心肌病模型建成后,利用基因芯片檢測實驗組和對照組各3例心臟樣本中的microRNAs, lncRNAs ,circular RNAs和mRNAs表達譜。通過對原始數(shù)據(jù)進行均一化預處理后,確定酒精性心肌病心肌組織中具有明顯差異表達的microRNAs, lnc RNAs, circular RNAs和mRNAs o然后利用生物信息學軟件分析差異表達的mRNAs的基因功能和其參與的生物學信號通路,結合文獻找出與酒精性心肌病發(fā)病機制關系最為密切的蛋白質(zhì)編碼基因mRNAs及其參與的信號通路。結果:1.光學顯微鏡下,飲酒組和對照組小鼠相同心臟橫切面HE染色石蠟切片圖像顯示:飲酒組小鼠心臟室間隔明顯增厚;透射電子顯微鏡下觀察到飲酒組小鼠心肌細胞內(nèi)肌原纖維溶解,肌節(jié)連續(xù)性中斷,線粒體增多變形、內(nèi)嵴退化,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腫脹等表現(xiàn)。2.通過對基因芯片原始數(shù)據(jù)進行預處理達到均一化后,與對照組相比,在飲酒組小鼠心臟組織中有19個microRNAs,494個lncRNAs,265個circular RNAs和404個mRNAs出現(xiàn)明顯差異性表達(p0.05)。3.利用生物信息學分析工具對差異表達的mRNAs的基因功能及其參與的信號通路預測分析發(fā)現(xiàn),在飲酒組小鼠心臟組織中差異表達的mRNAs主要參與碳水化合物代謝過程。結論:1.長期過量飲酒可以導致小鼠心臟重構,心肌細胞內(nèi)肌原纖維,線粒體,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等超微結構改變;2.長期過量飲酒能引起小鼠心臟組織內(nèi)大量非編碼RNAs和mRNAs表達失調(diào)。
[Abstract]:Objective: excessive drinking for a long time can cause many important organogenesis cytology, histology and structural changes, leading to gastric ulcer, pancreatitis, alcoholic fatty liver, alcoholic cardiomyopathy and other diseases. In this study, alcoholic cardiomyopathy was used to detect the differential expression profiles of microRNas, long non-coding RNAs lnc RNAsand circular RNAs noncoding RNAs in myocardial tissues of long-drinking mice with high throughput gene microarray. To explore the mechanism of alcoholic cardiomyopathy from the point of molecular biology. Methods A total of 100 Kunming mice were randomly divided into drinking group (n = 60) and control group (n = 40%) as the only drinking water source. The model of alcoholic cardiomyopathy was established by free drinking for 24 weeks. After 24 weeks of continuous modeling, 5 hearts of drinking group and control group were randomly selected to make paraffin sections and ultrathin sections. The pathological changes and ultrastructure of cardiac myocytes were observed under optical microscope and transmission electron microscope respectively. After the establishment of mice model of alcoholic cardiomyopathy, microRNA RNAs, lncRNAs circular RNAs and mRNAs were detected by gene microarray in 3 heart samples from experimental group and 3 control group. After homogenizing the raw data, To identify microRNAs, lnc RNAs, circular RNAs and mRNAs o, which have obvious differential expression in myocardial tissue of alcoholic cardiomyopathy, and then to analyze the gene function and biological signal pathway of differentially expressed mRNAs using bioinformatics software. In combination with the literature, the protein encoding gene mRNAs, which is most closely related to the pathogenesis of alcoholic cardiomyopathy, and the signal pathway involved in it are found. The result is 1: 1. Under optical microscope, the paraffin sections of the same cross section of heart in drinking group and control group showed that the ventricular septum of drinking group was thicker than that of control group. Transmission electron microscope showed that the myofibrils dissolved, the continuity of sarcomere interrupted, the mitochondria increased and deformed, the inner ridge degenerated and the endoplasmic reticulum swelled in drinking group. Compared with the control group, there were 19 microRNASs 494 lncRNAss, 265 circular RNAs and 404 mRNAs in the drinking group, and the significant difference was found between the drinking group and the control group after homogenization of the original gene chip data. Using bioinformatics tools to predict the gene function of differentially expressed mRNAs and its involvement in signal pathways, it was found that the differentially expressed mRNAs in the heart of drinking mice was mainly involved in carbohydrate metabolism. Conclusion 1. Long-term excessive drinking could result in cardiac remodeling, ultrastructural changes of myofibrils, mitochondria and endoplasmic reticulum in cardiac myocytes. Excessive drinking for a long time caused a large number of non-coding RNAs and mRNAs expression disorders in the heart of mice.
【學位授予單位】:昆明醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R542.2

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本文編號:1851902

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