最大信息系數(shù)在瓣膜性心臟病差異表達(dá)miRNA識(shí)別中的應(yīng)用
本文選題:生物信息學(xué) 切入點(diǎn):瓣膜性心臟病 出處:《中國(guó)科技論文》2017年06期 論文類(lèi)型:期刊論文
【摘要】:將1種稱(chēng)為最大信息系數(shù)的新型統(tǒng)計(jì)工具引入到表達(dá)miRNA的識(shí)別中,并應(yīng)用到瓣膜性心臟病(valvular heart disease,VHD)的miRNA表達(dá)譜中識(shí)別差異表達(dá)miRNA。通過(guò)對(duì)表達(dá)譜GSE28954的分析,最大信息系數(shù)方法識(shí)別了2個(gè)具有強(qiáng)烈差異表達(dá)的miRNA,其中,hsa-miR-221*是已有研究未發(fā)現(xiàn)的新的差異表達(dá)miRNA。實(shí)驗(yàn)提示,最大信息系數(shù)可用于差異表達(dá)miRNA的識(shí)別,且其最佳閾值為0.5~0.6。
[Abstract]:A new statistical tool called maximum information coefficient was introduced into the recognition of miRNA, and the differential expression of miRNA was recognized in the miRNA expression profile of valvular heart disease (VHD). Two miRNAs with strong differentially expressed miRNAs were identified by the maximum information coefficient method, among which hsa-miR-221* was a new differentially expressed miRNAs which have not been found in previous studies. The experiment showed that the maximum information coefficient could be used to recognize differentially expressed miRNA, and its optimal threshold was 0.50.0..
【作者單位】: 贛南師范大學(xué)數(shù)學(xué)與計(jì)算機(jī)科學(xué)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31660321)
【分類(lèi)號(hào)】:R542.5
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,本文編號(hào):1616470
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