乙型肝炎病毒感染相關(guān)性肝癌中HBV cccDNA水平與突變關(guān)系的研究
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更多相關(guān)文章: 乙型肝炎病毒 肝癌 HBV共價(jià)閉合環(huán)狀DNA 序列突變
【摘要】:目的:研究乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染相關(guān)性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中HBV共價(jià)閉合環(huán)狀DNA(covalently closed circular DNA,ccc DNA)水平與突變關(guān)系。方法:運(yùn)用特異性熒光定量PCR定量分析了12例肝癌組織和癌旁組織中乙肝病毒復(fù)制水平的表征因子HBV ccc DNA,HBV total DNA及前基因組RNA(pregenome RNA,pg RNA)的表達(dá)水平,再用滾環(huán)擴(kuò)增(rolling circle amplification,RCA)特異性擴(kuò)增癌組織中HBV ccc DNA,測(cè)序分析了病毒基因組4個(gè)編碼調(diào)控區(qū)域pre C/C、RT、X、pre S中ccc DNA序列的突變。最后檢測(cè)了腫瘤組織ccc DNA的AP位點(diǎn)。結(jié)果:HBV ccc DNA在癌組織的表達(dá)水平明顯低于癌旁組織(3.32 copies/cell vs.9.64 copies/cell,P=0.029),但是HBV總DNA和pg RNA的表達(dá)沒(méi)有明顯差異(16.94 copies/cell vs.12.18 copies/cell,P=0.325,75.54 copies/cell vs.22.46 copies/cell,P=0.128);在肝癌組織中,HBV ccc DNA pre C/C和X區(qū)間,G-A突變是主要的突變類(lèi)型;其次,pre C/C和X區(qū)域發(fā)生G-A突變的位置上,均更傾向于GA二聯(lián)核苷酸組合方式,在肝癌中所占比例為37.1%和40%。最后,腫瘤組織中APE1酶處理后,HBV ccc DNA水平明顯下降(1 011 copies/μl vs.501.8 copies/μl,P=0.058)。結(jié)論:HBV ccc DNA水平在癌組織中明顯低于癌旁組織,可能與癌組織中HBV ccc DNA發(fā)生大量GA突變及形成的AP位點(diǎn)有關(guān)。
【作者單位】: 重慶醫(yī)科大學(xué)感染性疾病分子生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 乙型肝炎病毒 肝癌 HBV共價(jià)閉合環(huán)狀DNA 序列突變
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(編號(hào):81471945) 重慶市科委自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(編號(hào):cstc2014jcyj A10075)
【分類(lèi)號(hào)】:R512.62;R735.7
【正文快照】: 乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)發(fā)病的主要危險(xiǎn)因素,超過(guò)60%的肝癌發(fā)生與慢性HBV感染密切相關(guān)[1]。HBV共價(jià)閉合環(huán)狀DNA(covalently closedcircular DNA,ccc DNA)不僅是HBV DNA復(fù)制轉(zhuǎn)錄的模板,也是HBV持續(xù)感染的關(guān)鍵因素。HBV c
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