發(fā)布時(shí)間：2017-09-05 07:09

  本文關(guān)鍵詞：重慶地區(qū)HBV基因型與臨床相關(guān)性分析及HBV群體遺傳學(xué)研究

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【摘要】：目的:了解重慶地區(qū)HBV基因型分布特征,探討各基因型與HBV感染者年齡、性別、肝功能狀態(tài)、HBe Ag陽性率、病毒復(fù)制水平、臨床用藥、臨床表型及HBV S基因突變的關(guān)系,為本地區(qū)診治和預(yù)防乙型肝炎提供理論依據(jù);研究HBV的群體遺傳學(xué),計(jì)算重慶各地區(qū)HBV群體遺傳結(jié)構(gòu),推測某些地區(qū)是否存在HBV可能爆發(fā)的威脅。方法:選取重慶8個(gè)地區(qū)HBs Ag陽性的HBV感染者768例,提取各感染者電子病歷中的人口統(tǒng)計(jì)學(xué)信息和診斷治療數(shù)據(jù),應(yīng)用PCR和直接測序法獲得HBV S基因序列,運(yùn)用NCBI在線軟件genetyping及軟件MEGA6.0將HBV S基因序列和在NCBI上下載的21條A-H型標(biāo)準(zhǔn)序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建,分析HBV基因型;運(yùn)用生物信息軟件分析S基因突變位點(diǎn),通過統(tǒng)計(jì)學(xué)方法探討基因型與臨床特征及S基因突變的相關(guān)性;應(yīng)用群體遺傳學(xué)方法,對不同地區(qū)不同基因型的HBV群體進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析,探討重慶各地區(qū)不同基因型HBV的擴(kuò)張情況。結(jié)果:1.768例HBs Ag陽性血清標(biāo)本中,成功測出HBV S基因序列的有528條。其中B型346例(65.53%),C型181例(34.28%),D型1例(0.19%),未見其他基因型;2.B型和C型在性別、年齡、HBV DNA載量及臨床用藥方面差異不大,沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);3.C型HBV感染者ALT異常值(40IU/L)的比例及HBe Ag陽性率明顯高于B型(P0.05)。LC/HCC組中C型的比例高于ASC組和CHB組(P0.05),ASC組和CHB組中B型比例高于LC/HCC組中B型比例(P0.01);4.B型和C型HBV S基因不同細(xì)胞表位均存在大量突變,B型主要突變類型為I110L、P120T、K122R、T126A/S、P127T、Q129H/R、M133L、T140N;C型突變類型主要有Y100C、Q101R、T113S、S114T、I126T/N/S、G130N、F134L、G131N、S143T。P120T、K122R為B型特異性突變,T113S為C型特異性突變。5.在HBs Ag MHR B型HBV株有140例(140/346)發(fā)生了突變,C型有84株(84/181)發(fā)生了突變,B型和C型的突變比例無明顯差異(P0.05);突變存在單突變和多突變,C型多突變比例38.1%(32/84)高于B型17.9%(25/140),具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.01);6.比對后的HBV S基因序列中,346條B型531bp S基因有189個(gè)突變位點(diǎn),250個(gè)hap,h為0.978,各地區(qū)從0.895-0.999不等,π為0.01644,各地區(qū)從0.00694-0.02628不等;181條C型525bp S基因有161個(gè)突變位點(diǎn),163個(gè)hap,h為0.999,各地區(qū)從0.992-1不等,π為0.02051,各地區(qū)從0.01788-0.02604不等;7.各地區(qū)B型和C型HBV群體的BSP顯示貝葉斯天界線呈上升趨勢,中性檢驗(yàn)值(Tajima's D值與Fu's Fs值)均為負(fù)值,大部分地區(qū)的錯(cuò)配分布為單峰倒鐘形分布,綜合分析表明重慶地區(qū)HBV群體近10年經(jīng)歷了一個(gè)擴(kuò)張過程,有的地區(qū)甚至擴(kuò)張了10倍,只有少部分地區(qū)的C型擴(kuò)張不明顯(黔江、合川、沙坪壩區(qū))。結(jié)論:1.B型為重慶地區(qū)的優(yōu)勢基因型,占65.53%;2.C型比B型具有更強(qiáng)的致病力,容易引起肝硬化及肝細(xì)胞癌;3.HBV S基因不同表位均存在大量突變,這些突變的病毒抗原性及免疫原性可能發(fā)生改變,感染HBs Ab陽性人群。4.C型多突變率比例高于B型,多突變可能會(huì)影響HBV的致病性,影響乙肝患者的治療及預(yù)后;5.B型和C型HBV群體h和p均高,提示HBV遺傳多樣性豐富,生存能力強(qiáng),且C型高于B型,間接反映C型具有更強(qiáng)的生存能力;6.重慶各地區(qū)B型和C型HBV群體都在經(jīng)歷擴(kuò)張,將來具有爆發(fā)的可能,需進(jìn)一步開展大型的分子流行病學(xué)調(diào)查并做好預(yù)警工作。
【關(guān)鍵詞】：乙型肝炎病毒 基因型 臨床相關(guān)性 HBV S基因突變 群體遺傳學(xué)
【學(xué)位授予單位】：西南醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R512.62
【目錄】：

• 中文摘要3-6
• 英文摘要6-10
• 前言10-15
• 技術(shù)路線15-16
• 材料與方法16-23
• 結(jié)果23-39
• 討論39-46
• 結(jié)論46-47
• 參考文獻(xiàn)47-51
• 中英文對照表51-53
• 致謝53-54
• 乙肝疫苗突破性感染患者病毒S基因變異的研究進(jìn)展（綜述）54-66
• 參考文獻(xiàn)61-66

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本文編號：796536