人體作為一個超個體,其生理健康不僅會受到外界環(huán)境與自身基因的影響,也會受到機體自身寄居微生物的影響。人體內(nèi)的微生物組可以看做是一個虛擬的器官,執(zhí)行著機體的多種代謝功能。而人體大部分的細菌是寄居在腸道的,腸道微生物基因組被譽為人類的“第二基因組”。 正常成年人結(jié)腸內(nèi)pH在5.5-7.0之間,并且腸道菌群結(jié)構(gòu)趨于近似,擬桿菌屬占腸道菌群30%,而腸桿菌屬和腸球菌屬的含量少于1%。腸道中的專性厭氧菌本身對于維持腸道菌群結(jié)構(gòu)的平衡起著至關(guān)重要的作用,專性厭氧菌作為腸道中的菌膜屏障,主要通過兩種途徑來阻止腸道潛在致病菌(通常為兼性厭氧或需氧菌)及毒素在腸上皮細胞的粘附,其一,通過與腸上皮細胞緊密結(jié)合,占據(jù)空間；其二,通過競爭營養(yǎng)物質(zhì),產(chǎn)生酸性代謝產(chǎn)物,降低腸道pH。 據(jù)世界衛(wèi)生組織的數(shù)據(jù)顯示,全球每年約有60萬人死于慢性HBV感染。截止至2010年,中國有1.2億人感染HBV。HBV侵襲肝臟后在肝細胞內(nèi)復(fù)制,從根本上損害肝臟功能,其誘導(dǎo)的機體適應(yīng)性免疫應(yīng)答會產(chǎn)生兩種效果：殺死肝細胞和清除HBV病毒,經(jīng)過數(shù)年的遷延,發(fā)展為肝硬化。在我國,肝硬化患者中血清HBV DNA陽性率高達76.7%。 肝硬化...

【文章頁數(shù)】：117 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
縮略詞表
摘要
Abstract
前言
第一部分 腸道菌群宏基因組DNA的基因數(shù)據(jù)產(chǎn)出
    1.1 材料與方法
        1.1.1 實驗儀器與試劑
        1.1.2 實驗步驟
    1.2 結(jié)果及討論
        1.2.1 研究對象的基本信息
        1.2.2 測序結(jié)果及數(shù)據(jù)處理
        1.2.3 基因比對結(jié)果
        1.2.4 稀釋分析結(jié)果
    1.3 小結(jié)
第二部分 肝硬化患者和正常人腸道菌群結(jié)構(gòu)及差異分析
    2.1 分析方法
        2.1.1 主成分分析
        2.1.2 顯著差異基因的檢驗及物種注釋
        2.1.3 顯著差異種屬的熒光定量PCR驗證
    2.2 結(jié)果及討論
        2.2.1 肝硬化患者與正常人腸道菌群結(jié)構(gòu)分析
        2.2.2 肝硬化患者和正常人腸道菌群的主成分分析
        2.2.3 基于顯著差異基因的物種注釋及分析
        2.2.4 顯著差異種屬的熒光定量PCR驗證結(jié)果
    2.3 小結(jié)
第三部分 肝硬化患者和正常人腸道菌群功能及代謝分析
    3.1 分析方法
        3.1.1 功能及代謝注釋的方法
        3.1.2 膽汁酸代謝分析的方法
    3.2 結(jié)果及討論
        3.2.1 肝硬化患者和正常人腸道菌群功能及代謝組成分析
        3.2.2 顯著差異基因的功能代謝注釋及分析
        3.2.3 肝硬化患者腸道菌群的膽汁酸代謝分析
    3.3 小結(jié)
第四部分 肝硬化患者腸道微生物特有基因分析
    4.1 分析方法
        4.1.1 特有基因的組裝及基因預(yù)測
        4.1.2 特有基因的物種及功能代謝注釋方法
    4.2 結(jié)果及討論
        4.2.1 肝硬化患者特有基因預(yù)測結(jié)果
        4.2.2 肝硬化患者特有基因的物種注釋
        4.2.3 肝硬化患者特有基因的功能注釋及分析
    4.3 小結(jié)
討論
全文總結(jié)
參考文獻
綜述
    參考文獻
附表一
附表二
發(fā)表文章
個人簡歷
碩士在讀期間發(fā)表的文章
致謝



本文編號：3868191