通過非靶向代謝組學(xué)分析乙型肝炎病毒協(xié)同酒精誘導(dǎo)小鼠肝臟組織的生物標(biāo)志物和代謝通路
發(fā)布時間:2022-01-02 07:33
背景近些年來,酒精性肝。ˋLD)是威脅人類健康的主要肝病,占全球死亡率的0.9%。同時,乙型肝炎病毒(HBV)感染及其相關(guān)并發(fā)癥對全球公共健康構(gòu)成重大威脅。病毒感染和酒精攝入是原發(fā)性肝癌的兩大病因,而乙型病毒和酒精相互協(xié)同作用對人群的影響更為嚴(yán)重,但是這些人群的代謝變化尚不清楚。對其代謝產(chǎn)物進(jìn)行定性分析,尋找醫(yī)學(xué)生物標(biāo)志物和最顯著的差異代謝途徑,可用于疾病機(jī)制研究、藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和癌癥風(fēng)險評估。方法本研究通過建立一種新的乙型肝炎病毒感染聯(lián)合酒精肝小鼠模型,我們收集小鼠的肝組織勻漿,采用超高效液相色譜-四極桿飛行時間質(zhì)譜(UHPLC-QTOFMS)技術(shù),對肝臟代謝譜和生物標(biāo)志物進(jìn)行篩選。結(jié)果鑒定了小鼠模型中涉及的差異代謝物,包括甘氨酸、L-谷氨酸、L-丙氨酸、L-纈氨酸、L-焦谷氨酸、一甲基戊酸、丙酮醛、N-乙酰-L-丙氨酸。經(jīng)生物標(biāo)志物分析,焦谷氨酸是酒精聯(lián)合HBV組與酒精組之間的最顯著的差異代謝物。此外,經(jīng)HBV或酒精處理后,組間的主成分分析提示分離效果良好。代謝途徑分析表明,這些差異代謝產(chǎn)物參與了7種代謝途徑:谷胱甘肽(γ-谷氨酰-l-胱氨酰甘氨酸,GSH)代謝;氮代謝;核黃素代謝...
【文章來源】:安徽醫(yī)科大學(xué)安徽省
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
HBV攜帶對酒精性肝病小鼠肝臟損傷和脂肪代謝無明顯變化
19的數(shù)據(jù)保持時間穩(wěn)定,所有峰均無漂移,反映了代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的可靠性。然后利用多元統(tǒng)計工具對提取的有用信息進(jìn)行分析,以進(jìn)一步研究。使用ProteoWizard軟件將質(zhì)譜原始轉(zhuǎn)成mzXML各式。再使用XCMS做保留時間矯正、峰識別、峰提娶峰積分、峰對齊等工作,minfrac設(shè)為0.5,cutoff設(shè)為0.6同時使用自撰寫R程序包和自建二級質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫對峰進(jìn)行物質(zhì)鑒定圖2.利用UHPLC-QTOFMS對小鼠肝臟進(jìn)行典型的UPLC/MS代謝指紋圖譜分析。(A)質(zhì)量控制樣品;(B)WT組;(C)ET組;(D)HBET組;Fig2.ThetypicallyUPLC/MSmetabolicfingerprintingtotalionchromatogramofliverobtainedfrommousemodelusingUHPLC-QTOFMS.(A)QCsamples.(B)WTgroup.(C)ETgroup.(D)HBETgroup.3.3各組間代謝產(chǎn)物的UHPLC-QTOFMS分析結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)比較數(shù)據(jù)采用主成分分析,OPLS-DA分析如圖3所示。為了全面了解WT對照組、ET組和HBET組的肝臟代謝信號,我們首先進(jìn)行了PCA分析,這是一種無監(jiān)督的多變量數(shù)據(jù)分析,它是數(shù)據(jù)的降維,用評分圖總結(jié)數(shù)據(jù)中的所有代謝差異。盡管存在重疊(圖3A和圖3B),但評分圖解釋了樣本的變異性超過一半,R2X為0.66,R2Y為0.608,如表1所示,表明HBET組的代謝組明顯改變。為了檢測HBET組的差異代謝物,OPLS-DA分析被用于通過消除不相關(guān)的系統(tǒng)變化來確定導(dǎo)致組
20間差異的標(biāo)記代謝物。OPLS-DA評分(圖3C)顯示模型組與WT組存在明顯的分離,R2X為0.982,Q2Y為0.677(表1),可見HBET組肝臟代謝譜的部分紊亂。通過PLS-DA評分圖,采用20倍交叉驗(yàn)證對模型進(jìn)行驗(yàn)證(圖3D),得到PLS-DA模型的R2Y和Q2值分別為0.8和0.68,說明該模型具有較高的可靠性和預(yù)測性。Tab1.各組之間的多元分析圖3.PCA、OPLS-DA模型對WT組、ET組、HBET組的多變量統(tǒng)計分析得分圖。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Risk for hepatocellular carcinoma in the course of chronic hepatitis B virus infection and the protective effect of therapy with nucleos(t)ide analogues[J]. Irene Rapti,Stephanos Hadziyannis. World Journal of Hepatology. 2015(08)
[2]Microbiota and the gut-liver axis:Bacterial translocation,inflammation and infection in cirrhosis[J]. Valerio Giannelli,Vincenza Di Gregorio,Valerio Iebba,Michela Giusto,Serena Schippa,Manuela Merli,Ulrich Thalheimer. World Journal of Gastroenterology. 2014(45)
本文編號:3563760
【文章來源】:安徽醫(yī)科大學(xué)安徽省
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
HBV攜帶對酒精性肝病小鼠肝臟損傷和脂肪代謝無明顯變化
19的數(shù)據(jù)保持時間穩(wěn)定,所有峰均無漂移,反映了代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的可靠性。然后利用多元統(tǒng)計工具對提取的有用信息進(jìn)行分析,以進(jìn)一步研究。使用ProteoWizard軟件將質(zhì)譜原始轉(zhuǎn)成mzXML各式。再使用XCMS做保留時間矯正、峰識別、峰提娶峰積分、峰對齊等工作,minfrac設(shè)為0.5,cutoff設(shè)為0.6同時使用自撰寫R程序包和自建二級質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫對峰進(jìn)行物質(zhì)鑒定圖2.利用UHPLC-QTOFMS對小鼠肝臟進(jìn)行典型的UPLC/MS代謝指紋圖譜分析。(A)質(zhì)量控制樣品;(B)WT組;(C)ET組;(D)HBET組;Fig2.ThetypicallyUPLC/MSmetabolicfingerprintingtotalionchromatogramofliverobtainedfrommousemodelusingUHPLC-QTOFMS.(A)QCsamples.(B)WTgroup.(C)ETgroup.(D)HBETgroup.3.3各組間代謝產(chǎn)物的UHPLC-QTOFMS分析結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)比較數(shù)據(jù)采用主成分分析,OPLS-DA分析如圖3所示。為了全面了解WT對照組、ET組和HBET組的肝臟代謝信號,我們首先進(jìn)行了PCA分析,這是一種無監(jiān)督的多變量數(shù)據(jù)分析,它是數(shù)據(jù)的降維,用評分圖總結(jié)數(shù)據(jù)中的所有代謝差異。盡管存在重疊(圖3A和圖3B),但評分圖解釋了樣本的變異性超過一半,R2X為0.66,R2Y為0.608,如表1所示,表明HBET組的代謝組明顯改變。為了檢測HBET組的差異代謝物,OPLS-DA分析被用于通過消除不相關(guān)的系統(tǒng)變化來確定導(dǎo)致組
20間差異的標(biāo)記代謝物。OPLS-DA評分(圖3C)顯示模型組與WT組存在明顯的分離,R2X為0.982,Q2Y為0.677(表1),可見HBET組肝臟代謝譜的部分紊亂。通過PLS-DA評分圖,采用20倍交叉驗(yàn)證對模型進(jìn)行驗(yàn)證(圖3D),得到PLS-DA模型的R2Y和Q2值分別為0.8和0.68,說明該模型具有較高的可靠性和預(yù)測性。Tab1.各組之間的多元分析圖3.PCA、OPLS-DA模型對WT組、ET組、HBET組的多變量統(tǒng)計分析得分圖。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Risk for hepatocellular carcinoma in the course of chronic hepatitis B virus infection and the protective effect of therapy with nucleos(t)ide analogues[J]. Irene Rapti,Stephanos Hadziyannis. World Journal of Hepatology. 2015(08)
[2]Microbiota and the gut-liver axis:Bacterial translocation,inflammation and infection in cirrhosis[J]. Valerio Giannelli,Vincenza Di Gregorio,Valerio Iebba,Michela Giusto,Serena Schippa,Manuela Merli,Ulrich Thalheimer. World Journal of Gastroenterology. 2014(45)
本文編號:3563760
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