上海市HIV-1主要流行株近全長(zhǎng)序列分析與HIV/HCV合并感染者中HCV基因亞型的分布
發(fā)布時(shí)間:2021-10-08 16:20
人類免疫缺陷病毒1型(HIV-1)是導(dǎo)致人獲得性免疫缺陷綜合征(AIDS)的病原體。我國(guó)HIV/AIDS流行呈快速上升趨勢(shì)。HIV分為HIV-1和HIV-2型,HIV-1的M群至少包含11個(gè)亞型,其中CRF01-AE重組型在全國(guó)所占比例也有所增加,在上海HIV-1 CRF01-AE重組型為主要的流行株。HIV感染和丙型肝炎病毒感染有著相似的傳播途徑如經(jīng)血傳播、性傳播和母嬰傳播,因此HIV和HCV混合感染很常見。本研究中,我們應(yīng)用巢式逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)方法,分段擴(kuò)增HIV-1近全長(zhǎng)基因組相應(yīng)片段,進(jìn)行克隆、測(cè)序,并進(jìn)行遺傳進(jìn)化樹和序列斷點(diǎn)位置。我們還對(duì)186份HCV病毒載量大于1000拷貝/ml的來自于河南、云南、新疆維吾爾自治區(qū)、吉林和遼寧省HIV-1/HCV合并感染人群標(biāo)本,用逆轉(zhuǎn)錄套式聚合酶鏈反應(yīng)方法擴(kuò)增病人血漿HCV核心基因區(qū)并進(jìn)行基因亞型分型,同時(shí)檢測(cè)病人的HIV-1和HCV載量以及CD4+T細(xì)胞計(jì)數(shù)。主要結(jié)果如下:1、完成了5株HIV-1CRF01-AE、1株URF01-AE/B近全基因組克隆,建立了HIV-1 CRF01-AE、URF01-AE/B近全基因組...
【文章來源】:中國(guó)人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
PCR產(chǎn)物的瓊脂糖電泳
使用引物擴(kuò)增所需片段,經(jīng)0.8%瓊脂糖凝膠電泳顯示擴(kuò)增序列片段大小與預(yù)期片段大小相符(圖1.),即4段片段在2~3Kb左右?寺∪胼d體后,經(jīng)過酶切鑒定篩選陽性克隆(圖2)1 2 3 4 M3000bp2000bp1000bp4000bp500bp5000bp圖1 PCR產(chǎn)物的瓊脂糖電泳Fig.1 gel electrophoresis of PCR- 18 -M:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)品;1、2、3、4樣品
部分測(cè)序結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HIV和HCV合并感染的臨床特點(diǎn)[J]. 雷華,李云麗,莊林. 肝臟. 2007(02)
[2]甘肅省HIV-1毒株基因序列測(cè)定和亞型分析[J]. 王炳濤,邢輝,于愛玲,邱照鑄,石林,魏民,席滄海,馬鵬飛,趙煜君,邵一鳴. 中國(guó)艾滋病性病. 2005(05)
[3]天津口岸出入境人員丙型肝炎感染情況的調(diào)查和分析[J]. 何晨光,劉振宇. 口岸衛(wèi)生控制. 2005(04)
[4]河北省HIV-1流行株的env基因序列測(cè)定和亞型分析[J]. 趙翠英,邢輝,趙宏儒,黃海龍,劉艷芳,馬鵬飛,李保軍,張玉琪,王玉,邵一鳴. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2005(07)
[5]山東省HIV-1感染者分子流行病學(xué)研究[J]. 傅繼華,李盛長(zhǎng),張靜,劉學(xué)真,黃濤,邢輝,邵一鳴. 中華流行病學(xué)雜志. 2005(02)
[6]我國(guó)中部HIV-1B′亞型分離株基因組結(jié)構(gòu)特征及系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 馮福民,李敬云,鮑作義,莊道民,劉思楊,李林. 中國(guó)病毒學(xué). 2004(05)
[7]福建省HIV-l流行毒株的基因序列測(cè)定和亞型分析[J]. 嚴(yán)延生,陳舸,邵一鳴,邢輝,鄭兆雙. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2000(05)
本文編號(hào):3424521
【文章來源】:中國(guó)人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
PCR產(chǎn)物的瓊脂糖電泳
使用引物擴(kuò)增所需片段,經(jīng)0.8%瓊脂糖凝膠電泳顯示擴(kuò)增序列片段大小與預(yù)期片段大小相符(圖1.),即4段片段在2~3Kb左右?寺∪胼d體后,經(jīng)過酶切鑒定篩選陽性克隆(圖2)1 2 3 4 M3000bp2000bp1000bp4000bp500bp5000bp圖1 PCR產(chǎn)物的瓊脂糖電泳Fig.1 gel electrophoresis of PCR- 18 -M:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)品;1、2、3、4樣品
部分測(cè)序結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HIV和HCV合并感染的臨床特點(diǎn)[J]. 雷華,李云麗,莊林. 肝臟. 2007(02)
[2]甘肅省HIV-1毒株基因序列測(cè)定和亞型分析[J]. 王炳濤,邢輝,于愛玲,邱照鑄,石林,魏民,席滄海,馬鵬飛,趙煜君,邵一鳴. 中國(guó)艾滋病性病. 2005(05)
[3]天津口岸出入境人員丙型肝炎感染情況的調(diào)查和分析[J]. 何晨光,劉振宇. 口岸衛(wèi)生控制. 2005(04)
[4]河北省HIV-1流行株的env基因序列測(cè)定和亞型分析[J]. 趙翠英,邢輝,趙宏儒,黃海龍,劉艷芳,馬鵬飛,李保軍,張玉琪,王玉,邵一鳴. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2005(07)
[5]山東省HIV-1感染者分子流行病學(xué)研究[J]. 傅繼華,李盛長(zhǎng),張靜,劉學(xué)真,黃濤,邢輝,邵一鳴. 中華流行病學(xué)雜志. 2005(02)
[6]我國(guó)中部HIV-1B′亞型分離株基因組結(jié)構(gòu)特征及系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 馮福民,李敬云,鮑作義,莊道民,劉思楊,李林. 中國(guó)病毒學(xué). 2004(05)
[7]福建省HIV-l流行毒株的基因序列測(cè)定和亞型分析[J]. 嚴(yán)延生,陳舸,邵一鳴,邢輝,鄭兆雙. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2000(05)
本文編號(hào):3424521
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