背景與目的炎癥性腸病（Inflammatory bowel disease,IB D）是一種慢性非特異性腸道疾病,包括潰瘍性結(jié)腸炎（Ulcerative colitis,UC）和克羅恩�。–rohn’s disease,CD）。在近十年來,IBD的發(fā)病率在全球范圍內(nèi)均有所增加。IBD的診斷和鑒別主要依靠臨床表現(xiàn),影像學(xué)檢查,內(nèi)鏡和病理檢查。然而,這些檢查方法對不典型的CD和UC患者的鑒別以及IBD與其他腸道疾病的鑒別比較局限,尤其是UC與缺血性腸炎（Ischemic colitis,IC）的鑒別,CD 與腸結(jié)核（Intestinal tuberculosis,ITB）和原發(fā)性腸淋巴瘤（Primary intestinal lymphoma,PIL）的鑒別。目前,在臨床上尚無有效的標(biāo)志物用于它們之間的鑒別。因此,本研究擬從蛋白質(zhì)組學(xué)和深度學(xué)習(xí)的研究方法入手,以期為IBD的診斷和鑒別提供新的思路。方法在蛋白組學(xué)研究中,我們首先收集了 CD、UC、正常對照組（normalcontrol,NC）的腸黏膜,采用了定量蛋白組學(xué)方法,篩選出差異表達(dá)蛋白（Differentially expresse... 

【文章來源】：浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：126 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

1.1NC、UC、CD三組間蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定結(jié)果

浙江大學(xué)博士學(xué)位論文正文第一部分結(jié)果15圖1.3.1.2IBD與NC組及CD與UC組差異蛋白數(shù)量及火山圖1.3.2NAD代謝和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路在IBD中表達(dá)異常通過通路聚類分析，我們發(fā)現(xiàn)許多蛋白質(zhì)參與了免疫反應(yīng)。有文獻(xiàn)報(bào)道NAD代謝途徑促進(jìn)腸道炎癥[14]；因此，我們分析了鑒定的蛋白質(zhì)中參與NAD+代謝和信號傳導(dǎo)分子，發(fā)現(xiàn)有22個(gè)蛋白參與了NAD代謝和信號傳導(dǎo)（表1.3.2）。當(dāng)倍數(shù)變化水平設(shè)置為>1.2或<0.84（即升高或降低倍數(shù)＞1.2倍）視為有差異時(shí)，其中10個(gè)蛋白在IBD組和對照組間是有差異的，這10個(gè)蛋白大多數(shù)是參與NAD合成和裂解有關(guān)的酶，其中CD38差異倍數(shù)最大。這些蛋白在NAD代謝和信號通路的角色見圖1.3.2。表1.3.2蛋白質(zhì)組學(xué)中鑒定得到的參與NAD代謝和信號傳導(dǎo)的蛋白Uniprot編號蛋白名稱ANOVAP值倍數(shù)改變倍數(shù)改變UC/對照CD/對照P36222CD380.0001582.282.70O95544NADK0.2214531.411.45Q4G0N4NADK20.244510.830.81Q6IA69NADSYN10.5209160.970.96C9JF35NAMPT0.029911.591.95Q6XQN6NAPRT0.0889090.741.02Q9HAN9NMNAT10.0437680.840.90Q96T66NMNAT30.3228430.760.81

浙江大學(xué)博士學(xué)位論文正文第一部分結(jié)果16Uniprot編號蛋白名稱ANOVAP值倍數(shù)改變倍數(shù)改變UC/對照CD/對照P40261NNMT0.0006231.731.73Q13423NNT0.0013380.800.78Q8TCD5NT5C0.5887620.830.82P49902NT5C20.4743890.950.92Q9H0P0NT5C3A0.3050460.710.68P21589NT5E0.5512320.801.03Q9BQG2NUDT120.0331140.760.88P00491PNP0.0119471.211.51Q96EB6SIRT10.2955131.141.23Q8IXQ6PARP90.0036921.551.52Q460N5PARP140.0030341.451.58Q00653NFKB20.0377451.471.43P19838NFKB10.7728810.971.07圖1.3.2蛋白質(zhì)組學(xué)中鑒定得到的參與NAD代謝和信號通路中DEPs（紅色代表表達(dá)上調(diào)，綠色代表表達(dá)下調(diào)，黃色代謝表達(dá)無差異，灰色代表未檢測到，星號


本文編號：3373601