可促進(jìn)rAAV在人肝星狀細(xì)胞LX-2中基因表達(dá)的miRNA篩選及機(jī)制初探
發(fā)布時(shí)間:2021-08-13 12:44
肝纖維化是繼發(fā)于肝臟炎癥或損傷后組織修復(fù)的代償反應(yīng)。肝星狀細(xì)胞的活化造成肝臟細(xì)胞外基質(zhì)(extracellular matrix, ECM)過(guò)度沉積是導(dǎo)致肝纖維化的中心環(huán)節(jié)。若得不到及時(shí)治療,肝纖維化會(huì)向肝硬化甚至肝癌發(fā)展。而近年來(lái),基因治療以其靶向性高,給藥劑量低等優(yōu)勢(shì)逐漸成為藥物開(kāi)發(fā)的新方向。開(kāi)發(fā)抗肝纖維化基因藥物也成為治療肝纖維化的研究熱點(diǎn);谙傧嚓P(guān)病毒(Adeno-associated virus,AAV)開(kāi)發(fā)的基因治療載體——重組腺相關(guān)病毒(Recombinant adeno-associated virus,rAAV)載體,被認(rèn)為是最有前景的基因治療載體之一,并在臨床實(shí)驗(yàn)中取得了一定的成績(jī)。但其體內(nèi)基因表達(dá)效率太低是限制rAAV載體臨床應(yīng)用的關(guān)鍵問(wèn)題之一。而高劑量的rAAV基因藥物會(huì)引發(fā)機(jī)體免疫反應(yīng)。因此,rAAV基因藥物研究的當(dāng)務(wù)之急之一是提高其基因表達(dá)效率。基于此,本論文設(shè)想尋找一種能夠進(jìn)一步提高rAAV載體轉(zhuǎn)染纖維化肝臟的有效手段來(lái)提高肝纖維化治療的有效性。通過(guò)查閱相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)現(xiàn),RNAi極有可能是一種有效手段。本論文選用在肝纖維化過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵性作用的肝星狀細(xì)胞(L...
【文章來(lái)源】:華僑大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:138 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
第1章 引言
1.1 基因治療
1.1.1 基因載體
1.1.2 基因治療研究現(xiàn)狀
1.1.3 基因治療的應(yīng)用障礙及應(yīng)對(duì)策略
1.2 肝纖維化與基因治療
1.2.1 肝纖維化概述
1.2.2 抗肝纖維化治療現(xiàn)狀
1.3 rAAV 與基因治療
1.3.1 AAV 與 rAAV 載體
1.3.2 rAAV 載體的轉(zhuǎn)染過(guò)程
1.3.3 rAAV 基因藥物的臨床應(yīng)用
1.3.4 rAAV 基因藥物存在的問(wèn)題
1.3.5 rAAV 載體表達(dá)效率優(yōu)化策略
1.4 RNAi 與基因治療
1.4.1 RNAi 與 miRNA
1.4.2 miRNA 與病毒感染
1.5 本課題的研究思路和論文結(jié)構(gòu)安排
第2章 促進(jìn) rAAV 表達(dá)效率的 miRNA 的篩選
2.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑與儀器
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑與耗材
2.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 主要溶液的配制
2.2.2 細(xì)胞復(fù)蘇、凍存、培養(yǎng)與傳代
2.2.3 轉(zhuǎn)染 miRNA
2.2.4 rAAV 病毒轉(zhuǎn)染
2.2.5 rAAV2‐Gluc 熒光檢測(cè)
2.2.6 rAAV2‐EGFP 熒光檢測(cè)
2.2.7 MTT 法檢測(cè)細(xì)胞存活率
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析
2.3.1 促進(jìn) rAAV 載體表達(dá)的 miRNA 的篩選
2.3.2 對(duì)明星 miRNA 序列進(jìn)行再次篩選
2.4 討論與小結(jié)
第3章 影響 rAAV 表達(dá)的細(xì)胞信號(hào)通路預(yù)測(cè)與分析
3.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑與儀器
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑與耗材
3.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 miRNA 靶基因的預(yù)測(cè)
3.2.2 基因富集分析
3.2.3 信號(hào)通路分析
3.2.4 主要溶液的配制
3.2.5 細(xì)胞復(fù)蘇、凍存、培養(yǎng)與傳代
3.2.6 轉(zhuǎn)染 miRNA
3.2.7 Trizol 法提取細(xì)胞總 RNA
3.2.8 瓊脂糖電泳鑒定細(xì)胞總 RNA
3.2.9 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 分析(qReal‐time PCR)
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 miRNA 靶基因預(yù)測(cè)及信號(hào)通路預(yù)測(cè)
3.3.2 基因富集分析
3.3.3 瓊脂糖電泳鑒定細(xì)胞總 RNA
3.3.4 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 分析(qReal‐time PCR)
3.4 討論與小結(jié)
第4章 總結(jié)與展望
4.1 總結(jié)
4.2 展望
創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄 A 初篩 miRNA 文庫(kù)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
附錄 B 備選 miRNA 預(yù)測(cè)靶基因 GO 分類(lèi)的層次網(wǎng)絡(luò)
個(gè)人簡(jiǎn)歷、在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]MicroRNAs in the regulation of immune response against infections[J]. Yue ZHANG 1,Ying-ke LI 2(1 Department of General Surgery,East Hospital,Tongji University School of Medicine,Shanghai 200120,China)(2 Department of Anesthesiology,Changzheng Hospital,the Second Military Medical University,Shanghai 200003,China). Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2013(01)
[2]人肝星狀細(xì)胞激活和抑制及其相關(guān)分子機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 秦棪楠,鐘耀剛,李錚. 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2011(10)
[3]PDGF及TGF信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路與肝星狀細(xì)胞活化增殖的研究進(jìn)展[J]. 王慧,陳真. 安徽醫(yī)藥. 2011(07)
[4]Colchicine reduces procollagen Ⅲ and increases pseudocholinesterase in chronic liver disease[J]. Sergio Muntoni,Marcos Rojkind,Sandro Muntoni. World Journal of Gastroenterology. 2010(23)
[5]miRNA調(diào)控病毒與宿主細(xì)胞相互作用的研究進(jìn)展[J]. 張傳軍,連海. 中國(guó)生物制品學(xué)雜志. 2010(05)
[6]腺相關(guān)病毒基因治療載體的改良與應(yīng)用[J]. 張鳳蘭,文朝陽(yáng),丁衛(wèi). 首都醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2009(04)
[7]重組腺相關(guān)病毒載體在基因治療中的應(yīng)用[J]. 董曉宇,井申榮. 中國(guó)生物制品學(xué)雜志. 2009(07)
[8]自身互補(bǔ)型腺相關(guān)病毒載體發(fā)展趨勢(shì)[J]. 呂穎慧,王啟釗,肖衛(wèi)東,刁勇,許瑞安. 生物工程學(xué)報(bào). 2009(05)
[9]腺相關(guān)病毒外殼修飾與腫瘤靶向治療[J]. 徐增輝,周秀梅,石文芳,錢(qián)其軍. 科學(xué)通報(bào). 2008(21)
[10]基因治療病毒載體的研究進(jìn)展[J]. 王振發(fā),王烈,衛(wèi)立辛. 醫(yī)學(xué)綜述. 2007(07)
本文編號(hào):3340451
【文章來(lái)源】:華僑大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:138 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
第1章 引言
1.1 基因治療
1.1.1 基因載體
1.1.2 基因治療研究現(xiàn)狀
1.1.3 基因治療的應(yīng)用障礙及應(yīng)對(duì)策略
1.2 肝纖維化與基因治療
1.2.1 肝纖維化概述
1.2.2 抗肝纖維化治療現(xiàn)狀
1.3 rAAV 與基因治療
1.3.1 AAV 與 rAAV 載體
1.3.2 rAAV 載體的轉(zhuǎn)染過(guò)程
1.3.3 rAAV 基因藥物的臨床應(yīng)用
1.3.4 rAAV 基因藥物存在的問(wèn)題
1.3.5 rAAV 載體表達(dá)效率優(yōu)化策略
1.4 RNAi 與基因治療
1.4.1 RNAi 與 miRNA
1.4.2 miRNA 與病毒感染
1.5 本課題的研究思路和論文結(jié)構(gòu)安排
第2章 促進(jìn) rAAV 表達(dá)效率的 miRNA 的篩選
2.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑與儀器
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑與耗材
2.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 主要溶液的配制
2.2.2 細(xì)胞復(fù)蘇、凍存、培養(yǎng)與傳代
2.2.3 轉(zhuǎn)染 miRNA
2.2.4 rAAV 病毒轉(zhuǎn)染
2.2.5 rAAV2‐Gluc 熒光檢測(cè)
2.2.6 rAAV2‐EGFP 熒光檢測(cè)
2.2.7 MTT 法檢測(cè)細(xì)胞存活率
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析
2.3.1 促進(jìn) rAAV 載體表達(dá)的 miRNA 的篩選
2.3.2 對(duì)明星 miRNA 序列進(jìn)行再次篩選
2.4 討論與小結(jié)
第3章 影響 rAAV 表達(dá)的細(xì)胞信號(hào)通路預(yù)測(cè)與分析
3.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑與儀器
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑與耗材
3.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 miRNA 靶基因的預(yù)測(cè)
3.2.2 基因富集分析
3.2.3 信號(hào)通路分析
3.2.4 主要溶液的配制
3.2.5 細(xì)胞復(fù)蘇、凍存、培養(yǎng)與傳代
3.2.6 轉(zhuǎn)染 miRNA
3.2.7 Trizol 法提取細(xì)胞總 RNA
3.2.8 瓊脂糖電泳鑒定細(xì)胞總 RNA
3.2.9 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 分析(qReal‐time PCR)
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 miRNA 靶基因預(yù)測(cè)及信號(hào)通路預(yù)測(cè)
3.3.2 基因富集分析
3.3.3 瓊脂糖電泳鑒定細(xì)胞總 RNA
3.3.4 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 分析(qReal‐time PCR)
3.4 討論與小結(jié)
第4章 總結(jié)與展望
4.1 總結(jié)
4.2 展望
創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄 A 初篩 miRNA 文庫(kù)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
附錄 B 備選 miRNA 預(yù)測(cè)靶基因 GO 分類(lèi)的層次網(wǎng)絡(luò)
個(gè)人簡(jiǎn)歷、在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]MicroRNAs in the regulation of immune response against infections[J]. Yue ZHANG 1,Ying-ke LI 2(1 Department of General Surgery,East Hospital,Tongji University School of Medicine,Shanghai 200120,China)(2 Department of Anesthesiology,Changzheng Hospital,the Second Military Medical University,Shanghai 200003,China). Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2013(01)
[2]人肝星狀細(xì)胞激活和抑制及其相關(guān)分子機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 秦棪楠,鐘耀剛,李錚. 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2011(10)
[3]PDGF及TGF信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路與肝星狀細(xì)胞活化增殖的研究進(jìn)展[J]. 王慧,陳真. 安徽醫(yī)藥. 2011(07)
[4]Colchicine reduces procollagen Ⅲ and increases pseudocholinesterase in chronic liver disease[J]. Sergio Muntoni,Marcos Rojkind,Sandro Muntoni. World Journal of Gastroenterology. 2010(23)
[5]miRNA調(diào)控病毒與宿主細(xì)胞相互作用的研究進(jìn)展[J]. 張傳軍,連海. 中國(guó)生物制品學(xué)雜志. 2010(05)
[6]腺相關(guān)病毒基因治療載體的改良與應(yīng)用[J]. 張鳳蘭,文朝陽(yáng),丁衛(wèi). 首都醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2009(04)
[7]重組腺相關(guān)病毒載體在基因治療中的應(yīng)用[J]. 董曉宇,井申榮. 中國(guó)生物制品學(xué)雜志. 2009(07)
[8]自身互補(bǔ)型腺相關(guān)病毒載體發(fā)展趨勢(shì)[J]. 呂穎慧,王啟釗,肖衛(wèi)東,刁勇,許瑞安. 生物工程學(xué)報(bào). 2009(05)
[9]腺相關(guān)病毒外殼修飾與腫瘤靶向治療[J]. 徐增輝,周秀梅,石文芳,錢(qián)其軍. 科學(xué)通報(bào). 2008(21)
[10]基因治療病毒載體的研究進(jìn)展[J]. 王振發(fā),王烈,衛(wèi)立辛. 醫(yī)學(xué)綜述. 2007(07)
本文編號(hào):3340451
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