通過原發(fā)性膽汁性膽管炎T細(xì)胞受體免疫組庫(kù)的研究揭示E.coli在其致病機(jī)理的作用
發(fā)布時(shí)間:2021-07-31 04:25
研究背景與實(shí)驗(yàn)?zāi)康?原發(fā)性膽汁性膽管炎(Primary biliary cholangitis,PBC)是一種器官特異性自身免疫性肝病,其特征是存在抗線粒體抗體,炎癥和小葉間膽管破壞。95%以上的PBC患者的血清中存在抗M2型線粒體抗體(Anti-mitochondrial antibody,AMA),其所針對(duì)的抗原主要是線粒體中的丙酮酸脫氫酶E2亞基(PDC-E2)。雖然PBC疾病的發(fā)病機(jī)制尚未完全清楚,易感基因和環(huán)境危險(xiǎn)因素在PBC的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要的作用。對(duì)自身組織(抗原)喪失免疫耐受是PBC疾病發(fā)生的基礎(chǔ)。T淋巴細(xì)胞在這一過程中發(fā)揮著關(guān)鍵性的作用。T細(xì)胞受體(T cell receptor,TCR)是T細(xì)胞表面的一種特異性受體,負(fù)責(zé)識(shí)別由主要組織相容性復(fù)合體(major histocompatibility complex,MHC)所呈遞的抗原和介導(dǎo)免疫應(yīng)答,是T細(xì)胞識(shí)別不同的抗原及被激活的中心環(huán)節(jié)。而TCR的抗原特異性主要由β受體鏈的高變互補(bǔ)決定區(qū) 3(complementary determining regions 3,CDR3)決定。我們研究 PBC患者的初始和記憶...
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:116 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
測(cè)序結(jié)果的穩(wěn)定性和可靠性評(píng)估
我們通過繪制散點(diǎn)圖從整體水平分析PBC患者組和正常對(duì)照組(Norma丨??control,?NC)外周血中CD4+記憶細(xì)胞和CD『記憶細(xì)胞的TCRp?CDR3核苷酸序??列的克隆擴(kuò)增程度(圖2)。我們發(fā)現(xiàn)無(wú)論是CD4+記憶細(xì)胞還是CD8+記憶細(xì)胞,??絕大部分TCRPCDR3序列的頻率較低,表明這些序列尚未經(jīng)歷大規(guī)?寺⌒詳U(kuò)??增。而在每個(gè)個(gè)體的TCRpCDR3圖譜中都發(fā)現(xiàn)一些高頻序列?偟膩碚f,PBC??患者的TCRPCDR3核苷酸序列的克隆擴(kuò)增程度與正常對(duì)照組沒有顯著差異
散點(diǎn)圖展示PBC患者與健康者的CD8+記憶T細(xì)胞的克隆擴(kuò)增程度。??我們采用3種評(píng)估方法比較PBC患者組和正常對(duì)照組CD4+記憶細(xì)胞和CD8’??記憶細(xì)胞的TCRpCDR3免疫圖譜的多樣性(圖3),發(fā)現(xiàn)克隆數(shù)/CDR3總序列數(shù)??的百分比在?NC-4RO,?PBC-4RO,?NC-8RO?和?PBC-8RO?組分別為?4.43?±?丨.53%,?3.45??±0.99%,丨.03土0.40°/〇和丨.00±0.32%。該值越大說明說明樣本的多樣性越大,反??之越小。結(jié)果表明PBC患者組的TCR(3CDR3免疫圖譜多祥性小于正常對(duì)照組,??但差異不顯著。但無(wú)論在PBC患者組還是正常對(duì)照組,CD4+記憶細(xì)胞的多樣性??遠(yuǎn)大于CD8+記憶細(xì)胞的多樣性。此外,CDt記憶細(xì)胞的前I00位克隆的累計(jì)頻??率為20%,而在CD8*記憶細(xì)胞中該累計(jì)頻率達(dá)到60%,進(jìn)一步證明了?CD4+記憶??細(xì)胞的TCRPCDR3免疫圖譜多樣性較大,克隆擴(kuò)增程度較小。香農(nóng)墑分析也顯示??了類似的結(jié)果。??19??
本文編號(hào):3312765
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:116 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
測(cè)序結(jié)果的穩(wěn)定性和可靠性評(píng)估
我們通過繪制散點(diǎn)圖從整體水平分析PBC患者組和正常對(duì)照組(Norma丨??control,?NC)外周血中CD4+記憶細(xì)胞和CD『記憶細(xì)胞的TCRp?CDR3核苷酸序??列的克隆擴(kuò)增程度(圖2)。我們發(fā)現(xiàn)無(wú)論是CD4+記憶細(xì)胞還是CD8+記憶細(xì)胞,??絕大部分TCRPCDR3序列的頻率較低,表明這些序列尚未經(jīng)歷大規(guī)?寺⌒詳U(kuò)??增。而在每個(gè)個(gè)體的TCRpCDR3圖譜中都發(fā)現(xiàn)一些高頻序列?偟膩碚f,PBC??患者的TCRPCDR3核苷酸序列的克隆擴(kuò)增程度與正常對(duì)照組沒有顯著差異
散點(diǎn)圖展示PBC患者與健康者的CD8+記憶T細(xì)胞的克隆擴(kuò)增程度。??我們采用3種評(píng)估方法比較PBC患者組和正常對(duì)照組CD4+記憶細(xì)胞和CD8’??記憶細(xì)胞的TCRpCDR3免疫圖譜的多樣性(圖3),發(fā)現(xiàn)克隆數(shù)/CDR3總序列數(shù)??的百分比在?NC-4RO,?PBC-4RO,?NC-8RO?和?PBC-8RO?組分別為?4.43?±?丨.53%,?3.45??±0.99%,丨.03土0.40°/〇和丨.00±0.32%。該值越大說明說明樣本的多樣性越大,反??之越小。結(jié)果表明PBC患者組的TCR(3CDR3免疫圖譜多祥性小于正常對(duì)照組,??但差異不顯著。但無(wú)論在PBC患者組還是正常對(duì)照組,CD4+記憶細(xì)胞的多樣性??遠(yuǎn)大于CD8+記憶細(xì)胞的多樣性。此外,CDt記憶細(xì)胞的前I00位克隆的累計(jì)頻??率為20%,而在CD8*記憶細(xì)胞中該累計(jì)頻率達(dá)到60%,進(jìn)一步證明了?CD4+記憶??細(xì)胞的TCRPCDR3免疫圖譜多樣性較大,克隆擴(kuò)增程度較小。香農(nóng)墑分析也顯示??了類似的結(jié)果。??19??
本文編號(hào):3312765
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