H.pylori可塑區(qū)tfs3a分泌系統(tǒng)virB2基因功能
發(fā)布時(shí)間:2021-06-13 01:07
目的對(duì)virB2基因編碼蛋白進(jìn)行分析,為virB2基因及其編碼蛋白功能提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。方法利用多種生物學(xué)軟件以及網(wǎng)站對(duì)VirB2蛋白的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行分析預(yù)測,VirB2蛋白序列通過基因推導(dǎo)獲得并由生物公司合成,然后通過免疫動(dòng)物實(shí)驗(yàn)制備鼠抗VirB2蛋白多克隆抗體,同時(shí)設(shè)計(jì)進(jìn)行VirB2蛋白細(xì)胞毒試驗(yàn)(MTT法)。結(jié)果 virB2基因編碼蛋白屬于疏水性蛋白,為鞭毛樣結(jié)構(gòu),有較強(qiáng)的細(xì)胞毒作用。結(jié)論對(duì)VirB2蛋白的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行了分析預(yù)測,證明VirB2蛋白在H.pylori相關(guān)的致病性特別是引起胃黏膜炎癥方面起到一定的作用,能夠?yàn)檠芯縃.pylori致病機(jī)制提供幫助。
【文章來源】:中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2020,32(03)CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
VirB2蛋白的親水性分析
通過Antheprot 5.0軟件對(duì)VirB2蛋白的信號(hào)肽序列進(jìn)行預(yù)測,該蛋白在24和89位氨基酸位置存在明顯的信號(hào)肽(圖3)。經(jīng)TMpred軟件預(yù)測發(fā)現(xiàn)VirB2蛋白有兩處明顯的跨膜區(qū)(圖4A),一處在第10位氨基酸左右,此處插入胞膜較深,由于VirB2蛋白屬于H.Pylori的菌毛蛋白,推測此處相當(dāng)于H.Pylori菌毛的“毛根”。另一處在70位氨基酸周圍,推測起固定菌毛或者同菌毛的運(yùn)動(dòng)相關(guān)。通過Antheprot 5.0分析結(jié)果也顯示VirB2蛋白存在兩處明顯的跨膜區(qū)(圖4B),與TMpred軟件的預(yù)測結(jié)果基本相吻合,雖然對(duì)于跨膜區(qū)的具體位置的預(yù)測上述兩種軟件存在一定差異,但是對(duì)于存在兩個(gè)跨膜區(qū)的結(jié)論兩種軟件是相互印證的,基本可以肯定的是兩個(gè)跨膜區(qū)確定存在(圖4)。圖4 VirB2蛋白的跨膜區(qū)分析
VirB2蛋白的跨膜區(qū)分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]幽門螺桿菌尿素酶研究現(xiàn)狀[J]. 盛濤,張建中. 世界華人消化雜志. 1999(10)
本文編號(hào):3226675
【文章來源】:中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2020,32(03)CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
VirB2蛋白的親水性分析
通過Antheprot 5.0軟件對(duì)VirB2蛋白的信號(hào)肽序列進(jìn)行預(yù)測,該蛋白在24和89位氨基酸位置存在明顯的信號(hào)肽(圖3)。經(jīng)TMpred軟件預(yù)測發(fā)現(xiàn)VirB2蛋白有兩處明顯的跨膜區(qū)(圖4A),一處在第10位氨基酸左右,此處插入胞膜較深,由于VirB2蛋白屬于H.Pylori的菌毛蛋白,推測此處相當(dāng)于H.Pylori菌毛的“毛根”。另一處在70位氨基酸周圍,推測起固定菌毛或者同菌毛的運(yùn)動(dòng)相關(guān)。通過Antheprot 5.0分析結(jié)果也顯示VirB2蛋白存在兩處明顯的跨膜區(qū)(圖4B),與TMpred軟件的預(yù)測結(jié)果基本相吻合,雖然對(duì)于跨膜區(qū)的具體位置的預(yù)測上述兩種軟件存在一定差異,但是對(duì)于存在兩個(gè)跨膜區(qū)的結(jié)論兩種軟件是相互印證的,基本可以肯定的是兩個(gè)跨膜區(qū)確定存在(圖4)。圖4 VirB2蛋白的跨膜區(qū)分析
VirB2蛋白的跨膜區(qū)分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]幽門螺桿菌尿素酶研究現(xiàn)狀[J]. 盛濤,張建中. 世界華人消化雜志. 1999(10)
本文編號(hào):3226675
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